Projekt z bioinformatiky I
Týden 1 - Organizace výuky, okruhy k řešení 6/10/2020
Nosními tématy letošních projektů budou:
- Grafové genomy, jejich tvorba ze sekvenčních dat okolí vybraných genů nebo repetitivních sekvencí (transpozonů). X
- Identifikace komponentů metabolických drah v sekvenačních datech. X
KEGG Database
Gene and pathway database
Short read archive (SRA)
Source of next-gen sequencing data
Velvet
Short read assembler
vg
Variation graph tools