Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin
Taxonomické jednotky a botanická
nomenklatura
Petr Bureš
MODULARIZACE VÝUKY EVOLUČNÍ A EKOLOGICKÉ BIOLOGIE
CZ.1.07/2.2.00/15.0204
1. základy již v Linnéově
Philosophia botanica (1751).
2. 1867 pověřil botanický kongres
„komisi devíti“ – v jejím čele –
Alphons de Candolle. = Zpracování
prvního nomenklatorického kódu
3. Nomenklatorická komise v
období mezi kongresy shromažďuje
podněty pro zpřesnění kódu
4. změny může schválit pouze
botanický kongres, konaný ca 1x za
6 let.
Alphonse de Candolle
1806-1893
Kodifikace botanické nomenklatury (1867)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Pojmenování rostlin podléhá sofistikovanému souboru pravidel botanické
nomenklatury - nomeklatorickému kódu
Kód - tvoří nomenklatorická komise IAPT, mezi kongresy
shromažďuje podněty pro nový kód,
Nový kód - schvaluje botanický kongres,
poslední kongres Melbourne červenec 2011;
další bude 23-29. července 2017 v Číně v Šen-čenu
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Příklad návrhu na konzervaci jména před kongresem ve Vídni
Jména taxonů supragenerických (nadrodové úrovně)
jednoslovná, s velkým počátečním písmenem, s
koncovkami, označujícími taxonomickou úroveň
taxon latinsky koncovka příklad
říše regnum -ae Plantae
podříše subregnum -bionta Cormobionta
oddělení divisio -phyta Magnoliophyta
třída classis -opsida nebo -atae Liliiopsida
podtřída subclassis -idae Liliidae
řád ordo -ales Cyperales
čeleď familia -aceae Cyperaceae
podčeleď subfamilia -oiedae Cyperoideae
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Jméno rodu (genus)
podstatné jméno v jednotném čísle nebo slovo, které je za podstatné
jméno považováno s velkým počátečním písmenem - např.
Eleocharis
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Jméno druhu (species)
dvouslovné (binomické)
= jméno rodu (nomen genericum) + druhový přívlastek (epitheton
specificum) - např. Viola odorata
Viola odorata
jméno rodové přívlastek druhový
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
nejčastěji
přídavné jméno
nebo
podstatné jméno
v druhém pádě
Přívlastek začíná vždy malým písmenem, i když je odvozen od jména osoby.
Např. Rubus josefianus (Podle českého botanika Josefa Holuba)
Minuartia smejkalii (Podle moravského botanika Miroslava Smejkala)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Není-li přívlastek jednoslovný, musí být slova, která jej tvoří, spojena
spojovací čárkou (spojovníkem, nikoli pomlčkou)
Např. Dryopteris filix-mas nikoli Dryopteris filix - mas
nebo Capsella bursa-pastoris nikoli Capsella bursa - pastoris
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Jména taxonů infraspecifických (nižší než druh)
Pojmenovávají se přívlastky - nelze je psát samostatně,
Píší se jen za jménem druhu nebo jménem jiného infraspecifického
taxonu, k němuž se vztahují, spolu se zkratkou vyznačující o jakou
taxonomickou úroveň se jedná.
poddruh, plemeno, subspecies, subsp. nebo ssp.
Př. Eleocharis palustris ssp. vulgaris
odrůda, varieta, varietas, var.
Př. Eleocharis palustris var. septentrionalis
forma, f.
Př. Eleocharis uniglumis f. nulliseta
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Zásada III.
Pojmenování taxonomické skupiny se zakládá na principu priority zveřejnění.
Zásada IV.
Každá taxonomická skupina v určitém vymezení, postavení a hierarchické
úrovni, s výjimkou některých zvláštních případů, může mít jen jedno správné
jméno, a to nejstarší, které je v souladu s pravidly.
Priorita směrem do minulosti omezena (čl. 13).
1. 5. 1753 = počáteční bod (starting point) - platí pro cévnaté
rostliny, játrovky, rašeliníky, pro lišejníky a většinu řas
Ztotožňován s 1. vydáním - Linnéova Species plantarum
Princip priority
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Jiné počáteční body (starting points) mají z vyšších rostlin:
1. 1. 1801 - mechy (kromě rašeliníků) - Hedwig: Species
muscorum
31. 12. 1820 - fosilní rostliny - Sternberg: Flora der Vorwelt
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Princip priority
PŘ. Tentýž taxon byl pojmenován dvěma jmény:
Viola saxatilis F.W.Schmidt 1797
Viola arenaria DC. 1830
Výjimka
Výjimku z tohoto pravidla tvoří jména chráněná kódem nomina
conservanda (jejich seznam je v kódu uveden)
Které jméno je správné?
To starší - tedy Viola saxatilis F.W.Schmidt 1797
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Princip priority
Změny jmen
Žádné správné jméno nesmí být svévolně měněno,
pokud se nezjistí okolnosti, které jeho platnost ruší.
Takové okolnosti mohou být:
1. vyloučení homonymie
2. přesun ve smyslu horizontálním
3. přesun ve smyslu vertikálním
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
1. Změna jména v důsledku vyloučení homonymity
Každé jméno smí označovat jen jeden taxon = dva různé taxony
se nemohou jmenovat stejně.
Pokud se tak omylem stalo - platí princip priority (platné jméno pro
ten taxon pro nějž bylo použito poprvé, pro druhý je třeba pokud neexistuje
vystavit jméno nové)
Př. Carduus glaucus Baumg. 1816
Carduus glaucus Cavaniles 1794
Stejné jméno použité pro dva různé taxony,
Carduus glaucus = homonymum
Které jméno ale bude správné? - Starší.
- Musí se stát synonymem a je třeba hledat jiné nejstarší.
Pokud by jiné nejstarší nebylo - je třeba vystavit jméno nové.
V daném případě se tak skutečně stalo - Carduus glaucinus Holub 1974 nom. nov.
Co s tím druhým?
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
1. Změna jména v důsledku vyloučení homonymity
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
1895-
Eleocharis R. Br. 1810
Brown 1810 popsal z Austrálie
rod Eleocharis
Eleocharis palustris (L.)
Roem. & Schult. 1817
2. Přesun ve směru horizontálním
Linné 1753 popsal rod Scirpus a v
rámci něj také druh Scirpus palustris
Taxon zůstává na stejné úrovni, epiteton se zachovává
Scirpus L. 1753
Scirpus palustris
L. 1753
Roemer & Schultes 1817 se rozhodli přiřadit Scirpus palustris k rodu Eleocharis
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Eleocharis vulgaris
(Walters) Á. Löve
& D. Löve 1976
3. Přesun ve směru vertikálním
Walters 1953 rozlišil v rámci druhu Eleocharis palustris L. poddruh E.
palustris subsp. vulgaris
Taxon zvyšuje nebo snižuje svoji úroveň, epiteton může
zůstat stejné, ale nemusí.
Á. Löve & D. Löve 1976
se na základě odlišného
chromosomového počtu
rozhodli oddělit tento
poddruh do samostatného
druhu
Eleocharis palustris (L.) Roem. & Schult.
Eleocharis palustris
subsp. vulgaris
Walters 1953
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Kombinace a basionym
Kombinace = jméno vzniklé přesunem pod jiný taxon téže
nebo jiné hodnoty. Tedy jméno již popsaného taxonu, jehož
znění se mění jen v nezbytně nutné míře, a to v důsledku
jeho přesunu ve směru horizontálním nebo vertikálním.
Basionym (ve vztahu k příslušné kombinaci) je původní
jméno, na němž je kombinace založena.
Eleocharis vulgaris (Walters) Á. et D. Löve je kombinace
založená na basionymu Eleocharis palustris subsp. vulgaris
Walters
Eleocharis palustris (L.) Roemer et Schultes je kombinace
založená na basionymu Scirpus palustris L.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
U kombinace je vedle deskriptora uveden také kombinátor, jména
kombinací mají pak následující tvar: jméno + deskriptor v závorce
+ kombinátor za závorkou
Eleocharis palustris (L.) Roem. et Schult.
L. = Linné - deskriptor;
Roem. et Schult. = Roemer et Schultes - kombinátoři
Eleocharis vulgaris (Walters) Á. et D. Löve
Walters - deskriptor;
Á. et D. Löve - kombinátoři (místo "et" lze psát i "&")
Výjimka
Nikdy nepíšeme deskriptora ani kombinátora u nominátních
taxonů!
Př. Eleocharis palustris (L.) Roem. et Schult. subsp. palustris
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Změna jména v důsledku horizontálního přesunu
Při horizontálním přesunu má prioritu epiteton nejstarší,
pokud není v rozporu se zásadami. Nemění se úroveň
samotného taxonu, ale pouze se přeřazuje pod jiný taxon
nadřazený.
Př. Linné popsal široký rod
skřípina Scirpus L. 1753. Tento
rod byl později rozdělen na rody
užší - Schoenoplectus,
Bolboschoenus, Isolepis, etc.
vedle samotného rodu Scirpus.
Mezi nově vydělenými rody z
rodu Scirpus byl také rod
Eleocharis R.Br.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Přesun některých druhů z rodu Scirpus do Eleocharis byl
učiněn později např.:
Eleocharis quinqueflora (F.X.Hartman) O.Schwarz 1949
Bas.: Scirpus quinqueflorus F.X.Hartman 1767
Eleocharis pauciflora (Lightfood) Link 1827
Bas.: Scirpus pauciflorus Lightfood 1777
Bas. (basionym) = jméno na jehož základě byla učiněna
kombinace.
Oba basionymy se však vztahují ke stejnému druhu
popsanému nezávisle na sobě dvěma autory.
Která kombinace je tedy správná?
Ta první, neboť i když je sama o sobě mladší, je učiněna na
základě staršího basionymu ve stejném ranku.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Výjimka kdy při přesunu horizontálním nemá prioritu epiteton
nejstarší je vyloučení tautonymie a homonymie
Linné popsal jaterník podléšku jako druh Anemone hepatica L.
1754 v rámci rodu Anemone. Později ale byl vytvořen samostatný
rod Hepatica Miller 1754
Jak by mělo v duchu pravidel znít jméno pro horizontální přesun?
Hepatica hepatica
Tautonymie, tj. druhový epiteton opakuje rodové jméno není v
botanické nomenklatuře přípustná.
Proto vystaveno jméno nové - stalo se 2x:
Hepatica nobilis Miller 1768
Hepatica triloba Chaix 1785
Které je správné?
Starší - Hepatica nobilis Miller 1768.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Přesun ve směru vertikálním
Snižuje nebo zvyšuje se úroveň taxonu
- není třeba prioritu epitetonu či uninomu zachovat (je to však
doporučeno).
Př. Epiteton zachováno
Alyssum gmelinii Jord.
sníženo na
subsp. úroveň:
Alyssum montanum L.
subsp. gmelinii (Jord.)
Hegi et E. Schmidt
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Přesun ve směru vertikálním
Př. Uninom zachován
Betonica L.
snížena na sekční úroveň:
Stachys L. sect. Betonica
(L.) Bentham
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Epiteton nebo uninominální jméno není zachováno
PŘ. Magnolia virginiana var. foetida L. 1753
je-li varieta povýšena na hodnotu druhu pak:
Magnolia grandiflora L. 1759
Jméno Magnolia foetida (L.) Sargent 1889 sice respektuje
doporučení o zachování epiteta, ale v důsledku zásady priority platí jméno
předchozí.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Epiteton nebo uninominální jméno není zachováno
PŘ. Lythrum intermedium Ledeb. 1822
je-li hodnoceno jako var. druhu L. salicaria pak:
Lythrum salicaria var. glabrum Ledeb. 1843
nikoli
Lythrum salicaria var. intermedium (Ledeb.) Koehne 1881
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Lotus corniculatus L. subsp. slovacus Žertová 1958
Lotus borbásii Ujhelyi 1961
Označují oba stejný taxon. Které je správné?
Obě!
Jedno na úrovni subspecifické a druhé na úrovni specifické.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Nomenklatorický typ je prvkem, se kterým je spojeno
pojmenování dotyčného taxonu.
Pro čeleď je nomenklatorickým typem jeden z rodů
Např. pro čeleď Asteraceae je to rod Aster
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Zásada II
Použití jmen taxonomických skupin se určuje pomocí
nomenklatorických typů.
Zásada typizace
Pro rod je nomenklatorickým typem jeden z druhů
Např. pro rod Salvia je to druh Salvia officinalis
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Zásada typizace
Pro druh a všechny nižší kategorie je nomenklatorickým
typem konkrétní dokladový exemplář (uložený obvykle v
herbáři)
u nižších organismů je to může být lyofilizovaná živá
kultura
výjimečně může být typem vyobrazení - ikonotyp
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
typ čeledi
čeleď
typ čeledi
čeleď A jinak vymezená čeleď
Co bude typem čeledi (A+B+C)? – Jak se čeleď bude jmenovat?
jinak vymezená čeleď
typ čeledi
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
čeleď B čeleď C
Smysl typizace:
V padesátých letech zjistil anglický botanik Stuart
Max Walters, že v Evropě existují v rámci druhu
Eleocharis palustris populace, lišící se velikostí
plodů, počtem chromozómů a několika dalšími
znaky, v době Linnéově nerozlišitelné. Oba
taxony lišily i ve geografickém rozšíření.
Co teď? - Popsat jako nový taxon s malými plody a pro druhý
ponechat jméno založené na na Linnéovském bazionymu.
Řešení: - měl vyhledat typ v Linnéově herbáři a hned věděl pro
co ponechat původní
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Autoři jmen, jejich zkratky
Za jménem taxonu často připojujeme jméno nebo zkratku toho, kdo
rostlinu popsal - deskriptor (descriptor z lat. descriptio = popis)
Fagaceae Dumortier Fagaceae Dumort.
Eleocharis R.Brown Eleocharis R.Br.
Daphne arbuscula Čelakovský Daphne arbuscula Čelak.
Dactylis glomerata subsp. slovenica Domin
Dactylis glomerata subsp. slovenica Dom.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Odlišnosti zoologické nomenklatury oproti botanické
Zoologická pravidla jsou starší - 1842.
Platí zde také zásada typizace a zásada priority, ale starting
point je 1.1.1758 - 10. vydání Linné: Systema naturae.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
Zásada I
Botanická nomenklatura je nezávislá na zoologické a
bakteriologické nomenklatuře.
1. Zoologie připouští tautonyma
Např. Bufo bufo = ropucha obecná
Buteo buteo = káně lesní
Naja naja = kobra indická
Huso huso = vyza velká
Torpedo torpedo = parejnok elektrický
Rattus rattus = krysa obecná
Gobio gobio = hrouzek obecný
Vulpes vulpes = liška obecná
2. V zoologii se neuvádí jméno kombinátora pouze
se v případě kombinace jméno deskriptora
dává do závorky.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
3. Homonymita neplatí mezi zoologií a botanikou
např. rod Sida
v botanice = tropický rod z čel. Malvaceae (např. v Indii roste
druh Sida retusa)
*v zoologii = drobný perloočkovitý korýš (např. u nás se
vyskytující S. crystallina = stejnonožka rdestová)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
nebo rod Dracunculus
v botanice = rod z čel. Araceae
v zoologii = parazitický červ (např. Dracunculus medinensis
vlasovec medinský)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
nebo rod Arenaria
Arenaria interpres = pták z čeledi kulíkovitých kameňáček
pestrý (žije ve Skandinávii)
Arenaria = rostlina z čeledi hvozdíkovitých - písečnice –
(např. p. douškolistá Arenaria serpyllifolia)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
nebo jméno rodu Oenanthe, které představuje současně drozdovitého
ptáka českým jménem bělořit (např. b. šedý Oenanthe oenanthe), ale i
miříkovitou rostlinu haluchu (např. h. vodní Oenanthe aquatica)
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura
obdobně i rod Prunella = pták z řádu pěvců pěvuška (např.
P. modularis = p. modrá), ale i hluchavkovitá rostlina
černohlávek (např. P. vulgaris = č. obecný)
Zoologický kód nedoporučuje dávat živočichům jména,
kterými jsou pojmenovány jiné organismy.
Petr Bureš: Prezentace přednášky Fylogeneze a diverzita vyšších rostlin - botanická nomenklatura