> Obsah obrázku noční obloha, oceánské dno Popis byl vytvořen automaticky
Mutace SARS-CoV-2


Spike protein (S)
•Glykoprotein, složen z 1273 AMK + 23 sacharidů
•Trimerický spike protein
•Jeden virus obsahuje 26 spike trimerů
•RBD – receptorová vazebná doména (RBD), váže se na ACE2 (angiotenzin-konvertující enzym) receptor
lidské buňky
•Úloha vakcín?
Frontiers | SARS-CoV-2 Spike-Heat Shock Protein A5 (GRP78) Recognition may be Related to the
Immersed Human Coronaviruses | Pharmacology

Mutace SARS-CoV-2
•S každou novou kopií je větší šance vzniku nové vady, mutace
•Dosud až 1000 mutací viru
•Rychlost mutace vs. fixace
•Čím delší doba pro šíření viru, tím větší pravděpodobnost jeho replikace a tím i větší
pravděpodobnost vyšší fixace. Čím více nemocných, tím větší riziko vzniku mutací.
•U SARS-CoV-2 se odhaduje, že ke vzniku jedné mutace dochází každých 11 dní (některé zdroje udávají
1 mutaci za měsíc)
•Virus chřipky vs. koronavirus

20A.EU1 B.1.177
(Španělsko)
•Léto 2020, západní Evropa
•
•
•
•
•
•Druhá nejčastější mutace na západní Evropě po 20A.EU
•Nezávislý vznik i v Austrálii
20A.EU2
(Francie)

20I/501Y.V1 B.1.1.7 VUI-202012/01
(Velká Británie)
•Prosinec 2020, jihovýchod Anglie
•Až 23 mutací, z nich 8 ve spike proteinu
•S:N501Y pevnější vazba (díky tyrosinu jako aromatické molekule)
•S:H69- únik před imunitní odpovědí
•Rychlejší šíření
Tyrosin – Wikipedie

20H/501Y.V2 B.1.351
(Jihoafrická republika)
•Konec roku 2020, nezávislý vznik mutací jako u B.1.1.7
•Mutace E484K lépe odolává imunitnímu systému a vakcínám
•Na spike proteinu až 10 mutací
•Rychlejší šíření, větší počet případů mezi mladými a jinak zdravými jedinci
•Firmy AstraZeneca, Novavax a Janssen ohlásili nižší účinnost svých vakcín
•Studie

B.1.1.28 VOC202101/02 20J/501Y.V3 P.1
(Brazílie)
•17 mutací
•2 varianty brazilské mutace, které vznikly nezávisle na sobě
•P.1 má více mutací než P2, vědci se jí obávají více
•Jako první potvrzena v Japonsku u skupiny brazilských turistů

20C/S:452R
(California)
B.1.526 20C/S:484K
(New York)
Fin-796H VUI-21MAR-02(9.3) P.3
(Filipíny)

Vakcíny a nové mutace
•Vakcíny budou potřeba upravit kvůli novým variantám viru
•Vakcíny druhé generace – z velké části se budou zakládat na stejných technologiích  a výrobních
procesech, rozdíl bude pouze ve specifické struktuře látky, která spouští imunitní reakci těla.
•Výhoda – kratší čas na schválení (místo 10000 lidí by prošlo testováním vakcín cca 100 lidí)
•Pfizer, AstraZeneca, Moderna

Zdroje
•Emma B. Hodcroft. 2021. Covariants: SARS-CoV-2 Mutations and Variants of Interest.
https://covariants.org/
•https://www.nationalgeographic.com/science/article/the-coronavirus-is-mutating-but-what-determines
-how-quickly
•https://euractiv.cz/section/politika/news/jak-na-mutace-koronaviru-uprava-vakcin-je-relativne-rych
la-rika-ema/
•https://www.hopkinsmedicine.org/health/conditions-and-diseases/coronavirus/a-new-strain-of-coronav
irus-what-you-should-know
•https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312820306247
•https://www.scientificamerican.com/article/the-most-worrying-mutations-in-five-emerging-coronaviru
s-variants/
•https://www.mc-praha.cz/mcp/britska-mutace-viru-sars-cov-2/

Doporučené články
•https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1931312820306247
•https://theconversation.com/how-the-leading-coronavirus-vaccines-work-146969
•https://theconversation.com/new-coronavirus-variant-what-is-the-spike-protein-and-why-are-mutation
s-on-it-important-152463
•https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867420302622
•https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/95
9438/Technical_Briefing_VOC_SH_NJL2_SH2.pdf

Děkuji za pozornost