CBA www.cba.muni.cz "u CENTRE OF BIOSTATISTICS AND ANALYSES Faculty of Medicine and Faculty of Science Masaryk University, Brno, Czech Republic Faculty of Science, Masaryk University, Brno Faculty of Medicine, %1L# Masaryk University, Brno w ional biology comes into andard" biolo w a; „£? ^ISAR^P^ Concept of comp B3ľ?J] Faculty of Science COMPUTATIONAL - BIOLOGY - Faculty of Medicine Concept of comp B3ľ?J] Artificial intelligence Data management Theoretical biology Experimental biology Biology Microbiology Biomedicine Physiology Taxonomy Ecology Anthropology Information systems ICT Biomedicine Clinical sciences Machine learning SW development Mathematics Stochastic modeling Deterministic modeling Data Mathematics analysis CBA ■iL Concept of comp m*M\ Kdo je matematický biolog Vědec, který má kladný vztah k biologii, matematice a počítačům Biolog s analytickým myšlením a touhou porozumět živým systémům Odborník s velmi komplexním vzděláním Znalost biologie a biomedicínských oborů Znalost matematiky, analýzy dat a informatiky Odborník s invenčním myšlením Schopnost syntézy poznatků z různých oborů Člověk s vědomím, že porozumět biologickým jevům znamená je popsat a matematicky modelovat CBA fľl#» Comp asfvl <Č "■ ~w ^s*±&~ ]í ÍDľ SlJJ dj£3CJp ly is objectively Statistics Mathematics Informatics ^ minjng Data analysis SW development 0. r Bio-engineering Ecology J Zoology Botany Taxonomy Microbiology Anthropology iology Anatomy Physi( Q^f Genomics Biomedicine Genetics Některé zajímavé příležitosti pro práci a uplatnění matematického biologa ... I. Ekologické modely a hodnocení ekologických rizik II. Analýza dat ze zajímavých mezioborových projektů (antropologie, paleontologie, sociobiologie, populační biologie,......) III. Analýza biodiverzity, modelování struktury a chování biologických společenstev IV. Analýza epidemiologických dat nádorových a jiných závažných onemocnění na národní i mezinárodní úrovni V. Hodnocení klinických studií: testování a vývoj léků VI. Molekulární biologie v biomedicínském výzkumu (např. diagnostika a výzkum zhoubných nádorů) VII. Modely v toxikologii a ekotoxikologii Vlil. Vývoj software a informačních systémů pro biologii a medicínu IX. Matematický výzkum v oblasti biologie a medicíny ... a mnoho dalšího ve všech oblastech biologie a medicíny * rVPi r^ sX^J oligonucleotide array (Rosetta/Agilent) RNA isolation iKiUiwi generation of [depending on array): cDNA array 1) biotinylated cRNA * hybridization 2) Cy3 and Cy5 labelled cRNA • wash 3) Cy3 and Cy5 labelled cDNA • scan ■■■■■■■ ■■■■■■■■ ■■■■■■■■ predictive ciassifie| ■ image analysii •identification of significant genesi ■ unsupervised cluster analysis • supervised classification ■ validation of predictive classifier ■ analysis of uncharacterised sampll í * "^§í\'to x • X : h?:! Jľľiľ^, £°ur |« Int—.frü.p, \ ífí; .. — . . —-. ň z™, f f r.'frije oe*e stena ^(-------. / ffl *<*> CBA Kontaktní učitel IBA Sladění rozvrhu biologie, matematiky a informatiky Biologie: většina předmětů je bez cvičení Individuální přístup