Přednášky: úterý A11-306, 14:00 - 15:50
Cvičení: úterý A9-316, 7:00-8:50, 9:00-10:50, 11:00-12:50
Datum č. Předmět Lekce
17.9.2013 Bi9060+Bi5000 Bioinformatika –  základní definice, molekulárně biologické databáze
Bi9061 cvičení se nekoná
24.9.2013 Bi9060+Bi5000 přednáška odpadá
Bi9061 cvičení se nekoná
1.10.2013 2 Bi5000 Sekvenování DNA, next generation sequencing
Bi9061 Cvičení ‐ textové vyhledávání v databázích
8.10.2013 3 Bi5000 Genomové projekty, manipulace se sekvenčními daty
Bi9061 Cvičení – formáty sekvencí, manipulace se sekvenčními daty
15.10.2013 4 Bi5000 Posuzování podobnosti sekvencí nukleových kyselin a proteinů 
Bi9061 Cvičení – restrikční mapování in silico, návrh primerů
22.10.2013 5 Bi9060 Mnohonásobné přiložení sekvencí  a fylogeneze
Bi9061 Cvičení – párové přiložení sekvencí, BLAST
29.10.2013 6 Bi5000 Počítačové vyhledávání genů a srovnávací genomika
Bi9061 Cvičení ‐ mnohonásobné přiřazení a fylogeneze
5.11.2013 7 Bi9060 Analýza sekvencí proteinů
Bi9061 Cvičení – hledání prokaryotických genů, práce s programy pro srovnávací genomiku
12.11.2013 8 Bi5000 Připrava anotované sekvence DNA pro zaslání do databáze
Bi9061 Cvičení – analýza sekvencí proteinů
19.11.2013 9 Bi9060 Strukturní databáze
Bi9061 Cvičení – zpracování sekvence v programu Sequin
26.11.2013 10 Bi9060 Predikce struktury proteinů
Bi9061 Cvičení –  základní strukturní analýzy, vizualizace proteinových struktur v PyMOL
3.12.2013 Bi5000, Bi9060 Testy k ukončení kolokviem ke každému z předmětů (předtermín, skenovaná písemka)
Bi9061 Cvičení –  predikce struktury proteinů
11
Plán výuky předmětů Bi5000 Bioinformatika I ‐ nukleové kyseliny, Bi9060 Bioinformatika II ‐ proteiny
a Bi9061 Bioinformatika ‐ cvičení v semestru Podzim 2013
1