IV108 Bioinformatika II
Mgr. Matěj Čuhel
IV108 Bioinformatika II
Mgr. Matěj Čuhel
IV108 Bioinformatika II
Info
Předmět
Období
podzim 2006
Prednášející: Dr. Matej Lexa, FI C505.
Konzultační hodiny: Čt 13:00 - 15:00, nebo dle domluvy
Rozvrh: (podzim 2006) Ut 12:00-12:50 B204, Ut 13:00-13:50 B116

Kurz vyžaduje základní znalosti z bioinformatiky, elementární znalosti programování v libovolném jazyce (nejlépe C/Perl nebo C++/Python) a uživatelskou znalost OS UNIX.

Jedná se o předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl umožnit studentům pochopit a navrhovat vybrané algoritmy pro práci s biologickými sekvencemi a strukturami.

UČEBNICE: Michael S. Waterman (1995). Introduction to computational biology.
Maps, sequences and genomes. Chapman & Hall/CRC, Boca Raton, 431 s. (prezenčně knihovna FI)
Rozsah pro kurz:
29-48 Restriction Maps
183-209 Alignment of 2 sequences by DP
327-343 RNA Secondary Structure

PROJEKT: Program pro hodnocení sekvenčních vzorů. Termín odevzdání 4.12.2006

Určené pasáže ucebnice, prezentace z přednášek (PDF a PPT), obsah cvičení
(kromě dobrovolných příkladů na body) a materiály označené hvězdičkou jsou
povinnými materiály ke zkoušce.
Zadani projektu
Novinky
Přejít
Kapitola obsahuje:
3
Web
2. týden 25. 9. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
5
Web
Učitel doporučuje studovat od 26. 9. 2006 do 2. 10. 2006.
3. týden 2. 10. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 3. 10. 2006 do 9. 10. 2006.
4. týden 9. 10. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
5
Web
Učitel doporučuje studovat od 10. 10. 2006 do 16. 10. 2006.
5. týden 16. 10. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
7
Web
Učitel doporučuje studovat od 17. 10. 2006 do 23. 10. 2006.
6. týden 23. 10. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
8
Web
Učitel doporučuje studovat od 24. 10. 2006 do 30. 10. 2006.
7. týden 30. 10. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
6
Web
Učitel doporučuje studovat od 31. 10. 2006 do 6. 11. 2006.
8. týden 6. 11. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
5
Web
Učitel doporučuje studovat od 7. 11. 2006 do 13. 11. 2006.
9. týden 13. 11. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
11
Web
Učitel doporučuje studovat od 14. 11. 2006 do 20. 11. 2006.
10. týden 20. 11. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
8
Web
Učitel doporučuje studovat od 21. 11. 2006 do 27. 11. 2006.
11. týden 28. 11. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
7
Web
Učitel doporučuje studovat od 28. 11. 2006 do 4. 12. 2006.
12. týden 5. 12. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
8
Web
Učitel doporučuje studovat od 5. 12. 2006 do 11. 12. 2006.
13. týden 12. 12. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 12. 12. 2006 do 18. 12. 2006.
14. týden 19. 12. 2006
Přejít
Kapitola obsahuje:
1
Studijní text
Učitel doporučuje studovat od 19. 12. 2006 do 25. 12. 2006.
Předchozí
Následující