BLAM061p Analýza a management dat pro zdravotnické obory - přednáška

Lékařská fakulta
jaro 2022
Rozsah
1/0/0. 15. 3 kr. Ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Jiří Jarkovský, Ph.D. (přednášející)
RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D. (cvičící)
Michaela Gregorovičová (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Institut biostatistiky a analýz – Jiná pracoviště pro vzdělávací a vědecko-výzkumnou činnost – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Danka Haruštiaková, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Institut biostatistiky a analýz – Jiná pracoviště pro vzdělávací a vědecko-výzkumnou činnost – Lékařská fakulta
Rozvrh
Čt 17. 2. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 24. 2. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 3. 3. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 10. 3. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 17. 3. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 24. 3. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 31. 3. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 7. 4. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 14. 4. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 21. 4. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 28. 4. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 5. 5. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 12. 5. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 19. 5. 15:00–16:40 D29/347-RCX2, Čt 26. 5. 15:00–16:40 viz studijní materiály/see study materials
Předpoklady
Nejsou - základní kurz.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem kurzu je seznámit studenty s principy statistického zpracování dat v oblasti biologických a klinických dat od přípravy experimentu, přes sběr dat a jejich vizualizaci až po popisnou statistiku a metodiku testování statistických hypotéz.
Výstupy z učení
V závěru kurzu jsou studenti schopni:
- Definovat strukturu datového souboru pro statistickou analýzu;
- Vizualizovat vstupní data pro analýzu a tyto vizualizace interpretovat;
- Identifikovat vhodné metody popisné analýzy dat;
- Fomulovat hypotézy statistické analýzy dat;
- Vybrat korektní statistické testy pro potvrzení/vyvrácení položených hypotéz;
- Interpretovat výsledky statistického hodnocení dat (jak vlastní, tak v odborné literatuře);
- Posoudit vhodnost aplikace různých statistických metod na různé typy dat
Osnova
  • 1. Práce s daty – zásady správného ukládání dat a jejich kontroly. MS Office Excel – vhodný nástroj pro manipulaci s daty.
  • 2. Úvod do statistiky. Typy dat v medicíně a biologii; nominální, ordinální, spojitá proměnná. Vizualizace kvantitativních a kvalitativních (kategoriálních) proměnných.
  • 3. Popisná statistika. Průměr, medián, kvantily, rozptyl. Frekvenční tabulka.
  • 4. Rozložení spojitých proměnných. Normální rozložení, log-normální rozložení.
  • 5. Základní principy testování hypotéz. Definice nulové a alternativní hypotézy. Hladina významnosti. Chyba I. a II. druhu.
  • 6. Ověření normality rozložení. Grafické ověření normality (histogram, normálně-pravděpodobnostný graf). Shapiro-Wilkův test k ověření normality rozložení.
  • 7. Parametrické testy: t-testy. Jednovýběrový t-test, dvouvýběrový t-test, párový t-test.
  • 8. Analýza rozptylu ANOVA.
  • 9. Neparametrické testy: jednovýběrový Wilcoxnův test, Mannův-Whitneyův U test, párový Wilcoxnův test, Kruskalův-Wallisův test.
  • 10. Definice kontingenční tabulky a její analýza: Pearsonův chí-kvadrát test, Fisherův přesný test, McNemarův test.
  • 11. Korelace. Pearsonův korelační koeficient, Spearmanův korelační koeficient.
  • 12. Úvod do regresní analýzy. Lineární regrese.
Literatura
  • ZAR, Jerrold H. Biostatistical analysis. 5th ed. Upper Saddle River, N.J.: Prentice Hall. xiii, 944. ISBN 9780131008465. 2010. info
  • PETRIE, Aviva a Caroline SABIN. Medical statistics at a glance. 1st ed. Oxford: Blackwell Science. 138 s. ISBN 0632050756. 2001. info
  • ALTMAN, Douglas G. Practical statistics for medical research. 1st ed. Boca Raton: Chapmann & Hall/CRC. xii, 611. ISBN 0412276305. 1991. info
Výukové metody
Teoretické přednášky doplněné komentovanými příklady, studenti jsou podporováni v kladení otázek týkajících se probírané látky.
Metody hodnocení
Předmět je uzavřen písemnou zkouškou testující uchopení principů a správnou aplikaci metod. Zkouška pokrývá celý rozsah kurzu od popisné statistiky, předpokladů statistického testovní až po aplikaci konkrétních testů na konkrétních příkladech.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024.