EMMB0411p Metody molekulární biologie - přednáška

Lékařská fakulta
jaro 2022
Rozsah
3/0/0. 45. 5 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
doc. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Jarmila Navrátilová, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Út 10:00–12:50 B11/306
Předpoklady
EMBI0222p Biologie II - přednáška || EMBI0222s Biologie II - seminář
Základní znalost o struktuře a funkci nukleových kyselin a proteinů.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech, tak in vitro. Je určen všem studentům biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.
Výstupy z učení
Po absolvování kurzu by měli studenti:
- znát principy metod
- získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.
Osnova
  • • 1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
  • • 2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
  • • 3. Hybridizace nukleových kyselin: příprava nukleotidových sond, značení nukleových kyselin.
  • • 4. Restrikční analýza nukleových kyselin, konstrukce restrikční mapy, mapování genomů.
  • • 5. Sekvenční analýza nukleových kyselin, genomové sekvencování.
  • • 6. Charakteristika základních typů vektorů a jejich aplikace.
  • • 7. Klonovací strategie: přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy a ß-galaktozidázy.
  • • 8. Zakládání genových knihoven.
  • • 9. Průtoková cytometrie.
  • • 10. Transkripce a translace in vitro.
  • • 11. Polymerázová řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
  • • 12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
  • • 13. Příprava a využití monoklonálních a polyklonálních protilátek.
  • • 14. Analýza interakcí mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.
Literatura
Výukové metody
Výuka probíhá týdně formou tříhodinových přednášek.
Metody hodnocení
Ukončení zkouškou formou písemného testu (60 otázek). Podle potřeby může být klasifikace upřesněna ústním zkoušením.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2023, jaro 2024.