Bi0124 Forenzní genetika

Přírodovědecká fakulta
jaro 2016
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Markéta Šaňková, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Eva Drozdová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Út 12:00–13:50 ÚSL N01902
Předpoklady
Předpoklady studenta pro absolvování předmětu: minimálně absolvovaný předmět z obecné genetiky, molekulární biologie, genetiky člověka, případně biochemie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 1/20, pouze zareg.: 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Na konci tohoto předmětu bude student schopen porozumět základním principům identifikace na základě analýzy DNA, interpretovat a hodnotit získaná data ve světle právních a etických otázek.
Osnova
  • Forenzní genetika jako vědní obor
  • Historie forenzní genetiky aneb jak to vlastně začalo? - Alec Jeffreys a DNA fingerprinting - Colin Pitchfork - 1. případ využití analýzy DNA v kriminalistice na světě - Milan Lubas – 1. případ využití DNA analýzy pro kriminalistické účely v Čechách, na Moravě a na Slovensku - Co bylo před profilováním DNA a bylo vůbec něco?
  • Seznámení s genetikou aneb opakování – matka moudrosti - struktura jaderné a mitochondriální DNA, způsob zápisu genetické informace - chromozóm, gen, lokus, DNA marker - polymorfizmus, mutace; homozygot, heterozygot - dědičnost lokusů na pohlavních chromozómech, hemizygot, haplotyp - novinka zvaná „free“ DNA - atd.
  • Biologické stopy a biologický materiál - tkáňový původ, druhový původ a původce biologického materiálu - využitelnost biologického materiálu pro forenzně genetickou analýzu - nakládání s biologickými stopami - vlastnosti a chování biologického materiálu ve stopách - důkazní potenciál stopy
  • Principy forenzně genetické analýzy - individualita a identifikace - určení příbuznosti - nakládání s biologickými stopami - predikce biogeografického původu a fenotypových znaků osoby
  • Technologie forenzně genetické analýzy - izolace (extrakce) DNA - kvantifikace a případná charakterizace DNA - amplifikace DNA - elektroforéza - analýza STR lokusů, analýza HVR mt DNA, analýza SNP lokusů - degradovaná DNA, směsné vzorky, LCN - stochastické jevy - nové technologie typu NGS apod.
  • Interpretace forenzně genetických dat - obecné kroky a pravidla interpretace dat - spolehlivost dat, technická kvalita dat - kvalita v laboratoři - vypovídací hodnota dat - statistické hodnocení dat - zdroje chyb ve forenzně genetické expertize
  • „Non-humánní“ forenzní analýza - forenzní analýza živočišné DNA - forenzní analýza rostlinné DNA - forenzní analýza mikrobiální DNA
  • Uchovávání zdrojů genetických informací - banky (archivy, depozity) biologického materiálu - banky izolátů DNA - DNA databáze
  • Legislativa a etika analýzy DNA
Literatura
    doporučená literatura
  • Butler, J. M. (2010): Fundamentals of Forensic DNA Typing. Elsevier Inc. Butler, J. M. (2011): Advanced Topics in Forensic DNA Typing: Methodology. Elsevier Inc. Šimková, H.: Breviář forenzní genetiky (Forenzní analýza DNA v otázkách a odpovědích).
Výukové metody
teoretická výuka,exkurze v laboratoři
Metody hodnocení
vypracování eseje na zadané téma, ústní zkouška
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.