Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: V případě, že student nesplňuje vyžadované prerekvizity pro zápis, je zápis možný s tím, že ukončení tohoto předmětu je podmíněno úspěšným absolvováním předmětu Molekulární biologie (jeden z kódů v prerekvizitách).
Kurz je zaměřen na výklad základních metod běžně používaných pro
studium bílkovin a nukleových kyselin a jejich interakcí a to jak v živých systémech tak in vitro. Je určen všem studentům
biologie, kteří budou v pracovat v laboratořích základního nebo
aplikovaného výzkumu. Důraz je kladen na pochopení principů molekulárně biologických metod a způsobů jejich praktického využití. Po absolvování kurzu by měli studenti znát principy metod a získat tak schopnost provádět kvalifikovaná rozhodnutí o tom, jaké metodické přístupy zvolit pro studium nejrůznějších buněčných procesů a molekul.
Osnova
1. Manipulace s nukleovými kyselinami, centrifugace, enzymové úpravy in vitro.
2. Elektroforetická a elektronmikroskopická analýza nukleových kyselin.
6. Charakteristika
základních typů vektorů a jejich aplikace.
7. Klonovací strategie:
přenos DNA do bakteriálních a eukaryotických buněk, stanovení
přítomnosti produktů klonovaných genů v buňkách: elektroforéza
proteinů a western blotting, testy aktivity luciferázy
a ß-galaktozidázy.
8. Zakládání genových knihoven.
9. Průtoková
cytometrie.
10. Transkripce a translace in vitro.
11. Polymerázová
řetězcová reakce. Základní metody molekulární diagnostiky.
12. Analýza proteinů: elektroforéza v jednom a
dvou rozměrech, imunoprecipitace, fokuzace.
13. Příprava a využití
monoklonálních a polyklonálních protilátek.
14. Analýza interakcí
mezi proteiny a nukleovými kyselinami: retardační analýza, footprinting.
Výuka probíhá týdně formou přednášek (teoretická příprava).
Metody hodnocení
Zkouška se provádí formou písemného testu, který obsahuje 50 otázek. Na bodovém zisku je založena klasifikace. Podmínkou složení zkoušky je alespoň 50% správných odpovědí.
Požadavky na úspěšné ukončení přemětu:
1. Porozumění základním metodám analýzy nukleových kyselin, proteinů
a jejich interakcí v buněčných systémech a in vitro. Důraz je kladen
především na princip metod a způsob jejich využití v praxi.
Další komentáře
Studijní materiály
Poznámka k ukončení předmětu: Pro obor Biofyzika je možné zakončení kolokviem
Předmět je vyučován každoročně.