Bi6721en Special methods for the analysis of microorganisms

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025

Předmět se v období jaro 2025 nevypisuje.

Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučováno kontaktně
Vyučující
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Pavel Dvořák, Ph.D.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: Ing. Jiřina Kučerová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
The course is destined for students of microbiology and other students who are interested in new methods of analysis of microorganisms. The prerequisite is the passed exam of the course Molecular Biology (Bi4020).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
The aim of the course is to acquaint students with the principles of selected methods of molecular biology, biochemistry, and biophysics for analysis of microorganisms, with the procedure for selection of a suitable method for solving a real problem, differences in procedures used for bacteria and yeasts and interpreting the results of analyzes. Students will receive specific information about the following processes:
1)Isolation of nucleic acids (NA) from microorganisms and analysis of NA using chromatographic and electrophoresis methods
2)Application of enzymes in microbial genes analysis
3)Sequence analysis of microbial genes, genomes, and proteins
4)Application of hybridisation and polymerase chain reaction in microbiology
5)Methods of study of microbial proteins and metabolites
6)Application of recombinant NA for the study of microorganisms 7)Basic methods in the study of bacteriophages
Výstupy z učení
At the end of this course, students should be able to: understand and explain the principles of basic molecular biology, biochemistry and biophysics methods used in microbiology, propose the procedure for solving a real problem, realize differences between methods used for bacteria and yeasts; interpret the results.
Osnova
  • Methods of microorganisms analysis. Isolation of nucleic acid.
  • Isolation of DNA and mtDNA from yeasts.
  • Fragmentation of DNA molecules. Restriction enzymes.
  • Analysis of nucleic acids using electromigration methods.
  • Analysis of nucleic acids using chromatographic methods.
  • Sequence analysis. Spectrophotometric analysis of nucleic acids.
  • Hybridisation.
  • Polymerase chain reaction (PCR).
  • Methods of protein analysis. Chromatographic determination of microbial metabolites and bacterial cell components.
  • Principles of quantitative analysis.
  • Immunomagnetic and affinity based separation techniques in microorganisms diagnostics.
  • Methods for preparation of recombinant DNA and RNA molecules and their use for the study of microorganisms.
  • Basic methods in the study of bacteriophages
  • Basic bioinformatic methods for recombinant DNA technology
Literatura
    doporučená literatura
  • Persing D.H. a kol. Molecular Microbiology: Diagnostic Principles and Practice, 3rd Edition. 2016, 835 p. ISBN: 978-1-555-81908-8
  • Brown T.A. Gene Cloning and DNA Analysis: An Introduction, 8th Edition. 2020, Wiley-Blackwell, 432 p. ISBN: 978-1-119-64078-3
  • Rozsypal S. a kol. Úvod do molekulární biologie, IV, 3 vydání, Brno 2002
  • ŠMARDA, Jan, Jiří DOŠKAŘ, Roman PANTŮČEK, Vladislava RŮŽIČKOVÁ a Jana KOPTÍKOVÁ. Metody molekulární biologie. 1. vyd. Brno: Masarykova univerzita, 2005, 194 s. 1. vydání. ISBN 80-210-3841-1. info
Výukové metody
The teaching methods make use of Powerpoint presentations. The course is followed up by a practical course.
Metody hodnocení
The course is closed with a test. The test contains 32 questions, which must be answered briefly. Each student must correctly answer 16 questions. The overall result of the exam is evaluated by the examiner.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/jaro2025/Bi6721en