Bi7340 Cytologie a morfologie bakterií - cvičení

Přírodovědecká fakulta
podzim 2012
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
Mgr. Andrea Vávrová, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Zdeněk Hubálek, DrSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Ludmila Tvrzová, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Čt 7:00–8:50 Bpb,02012
Předpoklady
NOW( Bi7330 Cytologie a morfologie bakt. )
absolvování předmětu obecná mikrobiologie
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Předmět je vyučován formou praktických laboratorních cvičení a jeho cílem je umožnit přímé pozorování morfologické diverzity bakteriálních buněk (včetně závislosti morfologie buňky jednoho bakteriálního druhu na kultivačním mediu) a studium některých základních struktur bakteriální buňky (endospory, inkluze, bičíky). Součástí cvičení jsou techniky a organismy důležité jak pro klinickou praxi, tak pro environmentální mikrobiologii a biotechnologie; Archaea. V průběhu kurzu by účastníci měli zvládnout základní techniky přípravy mikroskopických preparátů pro světelnou mikroskopii (barvené, nativní preparáty, sklíčkové kultury), mikroskopickou techniku (fázový a Nomarského kontrast, pozorování v jasném poli), pořizování obrazového záznamu z mikroskopu (kamera) i obrazu makroskopického (fotoaparát), digitalizaci obrazu a jeho následné zpracování, příp. analýzu (LUCIA G).
Osnova
  • Základní morfologická charakteristika a barvitelnost bakteriálních buněk a buněk archeí.
  • Hodnocení morfologie bakteriálních kolonií.
  • Práce se světelným mikroskopem, seřizování, údržba, odstranění drobných vad.
  • Pořizování, archivace, editace a analýza obrazu v mikrobiologii.
  • Mikrofotografie, práce s digitálním fotoaparátem, využití analogové kamery k pořizování makro- i mikrosnímků v mikrobiologické laboratoři.
  • Měření velikosti bakteriálních buněk a jejich morfologických struktur (využití okulárového mikrometru a software pro analýzu obrazu).
  • Tvary a shluky bakteriálních buněk (morfologická diverzita bakterií).
  • Gramovo barvení. Acidorezistence bakterií, Ziehl-Neelsenovo barvení, mykobakteria. Giemsovo barvení.
  • Spory a sporulace u bakterií.
  • Fázový a Nomarského kontrast.
  • Pouzdra, pochvy a slizy bakteriálních buněk.
  • Pohyb bakteriálních buněk.
  • Příprava sklíčkových kultur.
  • Aktinomycety a metody pozorování jejich morfologie.
  • Měření a srovnání rozměrů jednotlivých skupin mikroorganismů.
  • Barvení buněčné stěny, jaderného materiálu a zásobních látek v buňkách bakterií.
  • Zpracování obrazové dokumentace - digitální protokol.
Literatura
  • PERRY, Jerome J. a James T. STALEY. Microbiology :dynamics and diversity. Fort Worth: Saunders College Publishing, 1997, xxxi, 911. ISBN 0-03-053893-9. info
  • Laboratory experiments in microbiology. Edited by Ted R. Johnson - Christine L. Case. 4th ed. Redwood City: Benjamin Cummings, 1995, xi, 418 s. ISBN 0-8053-8509-6. info
Výukové metody
laboratorní cvičení, diskuze výsledků, protokol
Metody hodnocení
V průběhu praktických cvičení se provádí fotografická dokumentace pozorovaných objektů - výsledkem je elektronický protokol. Závěrečné hodnocení sestává z písemného testu, zápočtového preparátu a protokolu.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, jaro 2003, jaro 2004, jaro 2005, podzim 2005, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2013, podzim 2014, podzim 2015, podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018.