Bi8202c Kurz základů proteomiky - cvičení

Přírodovědecká fakulta
jaro 2006
Rozsah
0/3. 3 kr. Ukončení: z.
Vyučující
doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
prof. RNDr. Zbyněk Zdráhal, Dr. (cvičící)
RNDr. Eliška Nejedlá, CSc. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Eva Paděrová (cvičící)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Pavel Mazura, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Ivana Urbánková (cvičící)
Bc. Martina Válková (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D.
Rozvrh seminárních/paralelních skupin
Bi8202c/Beh_1: Rozvrh nebyl do ISu vložen. R. Dopitová, J. Hejátko, H. Konečná, P. Mazura, E. Nejedlá, E. Paděrová, I. Urbánková, M. Válková, Z. Zdráhal
Bi8202c/Beh_2: Rozvrh nebyl do ISu vložen. R. Dopitová, J. Hejátko, H. Konečná, P. Mazura, E. Nejedlá, E. Paděrová, I. Urbánková, M. Válková, Z. Zdráhal
Předpoklady
Předpokladem úspěšného absolvování praktika jsou znalosti základů biochemie a molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Mateřské obory/plány
předmět má 10 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Během kurzu se studenti seznámí se základy metodických přístupů využívaných v současné době ke studiu funkce souhrnu všech proteinů daného organismu (proteomu), tak k analýze vlastností jednotlivých proteinů. Studenti si budou moci sami vyzkoušet metody exprese a purifikace rekombinantních proteinů v heterologních expresních systémech (E. coli) a to od izolace a analýzy rekombinantní DNA, přes izolaci proteinu, purifikaci a analýzu čistoty purifikovaného proteinu pomocí SDS-PAGE a analýzy obrazu až po strukturní a funkční analýzu purifikovaných proteinů. Dále bude provedena izolace celkového proteinu modelového organismu Arabidopsis thaliana a studenti se seznámí se základy analýzy proteomu prostřednictvím 2D elektroforézy a jejího vyhodnocení pomocí analýzy obrazu. Dále budou prakticky demonstrovány základy identifikace proteinů pomocí MS spektrometrie a budou jim prezentovány základy práce s proteinovými databázemi. Všechny výše zmíněné metody a metodické přístupy jsou v Laboratoři molekulární fyziologie rostlin využívány k řešení reálných biologických a biochemických problémů zaměstnanci a studenty laboratoře, kteří se na vedení vlastních kurzů podílejí.
Metody hodnocení
Pro úspěšné absolvování kurzu a udělení zápočtu bude požadováno splnění všech studijních povinností a to nejpozději v POSLEDNÍ DEN konání daného běhu (tedy vždy v pátek). Jedná se především o absolvování několika písemných testů a odevzdání VŠECH požadovaných protokolů.
Informace učitele
Praktika budou probíhat během prvních dvou týdnů zkouškového období a to ve dvou identických bězích (první v době od 22.-26.5. 2006, druhý od 29.5. do 2.6. 2006). Studenti se mohou hlásit do jednotlivých běhů, přičemž do jednoho běhu může být zařazeno nejvíce 14 studentů. Studenti, kteří nevyjádří svou preferenci nebo již nebudou moci být zařazeni do běhu ve zvoleném termínu z kapacitních důvodů, budou přiřazeni do běhu s volným místem. Definitivní seznam pak bude zveřejněn na adrese http://www.sci.muni.cz/LMFR/indexLMFR.html.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2005, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace.