Bi9020 Evolutionary and comparative plant cytogenetics

Přírodovědecká fakulta
podzim 2006
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit
Osnova
  • 1. Sto let rostlinne cytogenetiky. Morganismus versus lysenkismus. Odhaleni role chromosomu a DNA molekuly. Vzestup a pad cytotaxonomie rostlin. Molekularni cytogenetika a fylogenomika. 2. Velikost genomu rostlin. Paradox a enigma C-hodnoty. Evolucni role a biologicky vyznam nekodujici DNA (retroelementy, tandemove repetice aj.). Genomova obezita a co s ni. Velikost genomu ve vztahu k fyziologii, ekogeografii a fylogenezi rostlin. Evoluce velikosti genomu. 3. Chromatin a jeho typy. Heterochromatin a repetitivni DNA. Heterochromatin a chromosomy. Modifikace chromatinu, epigenetika. 4. Struktura a morfologie chromosomů; modely. Typy chromosomu (autosomy, B chromosomy, pohlavni chromosomy). Pocet chromosomu, cisla n a x evolucni analyza. Karyotyp a jeho evoluce. Cytotaxonomie ve vztahu k fylogenezi rostlin. 5. Genove duplikace, duplikace velkych useku DNA. Genomove duplikace: polyploidie a paleopolyploidie. Typy polyploidie. Hybridizace, polyploidie a speciace. Diploidizace. Apomixe. Polyploidní komplexy. 6. Meiosa a jeji prubeh. Geneticka rekombinace, crossing-over. Chromosomove mutace (translokace, inverze, delece aj.). Fixace chromosomovych mutaci a jejich evolucni role. Permanentni heterozygoti. Aneuploidie. Meiosa u polyploidu. 7. Definice druhu. Role karyotypovych a chromosomovych zmen ve speciaci. Chromosomove mutace a reprodukcni bariery. Rekombinacni speciace. 8. Geneticke a fyzicke mapovani genomu. Genomova a chromosomalni kolinearita a syntenie. Sekvenovani rostlinnych genomu. Komparativni fylogenomika rostlin. 9. Cytogenetika a molekularni fylogeneze rostlin. Budoucnost a perspektivy rostlinne cytogenetiky. Evolucni cytogenetika v ere post-genomiky.
Vyučovací jazyk
Angličtina
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2010 - akreditace, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009, podzim 2010, podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, podzim 2012.