Informace o předmětu

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 16:00–16:50 A319

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost poslouchat přednášky a přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 81 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Dlouhodobým tématem semináře je "Analýza bioinformatických (mol.biologických a biomedicínských) dat". Jednotlivé běhy můžou být zaměřeny na užší okruh problémů.

Výstupy z učení

Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• - Úvod do použití 'deep learning' v bioinformatice - Přednášky zvaných hostů z celého světa k této problematice - Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu nebo aplikaci z dané oblasti

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

přednášky zvaných hostů, studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní vědeckou publikaci. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 15. 2. až St 10. 5. St 16:00–16:50 A319

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost poslouchat přednášky a přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 81 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Dlouhodobým tématem semináře je "Analýza bioinformatických (mol.biologických a biomedicínských) dat". Jednotlivé běhy můžou být zaměřeny na užší okruh problémů.

Výstupy z učení

Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• - Úvod do použití 'deep learning' v bioinformatice - Přednášky zvaných hostů z celého světa k této problematice - Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu nebo aplikaci z dané oblasti

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

přednášky zvaných hostů, studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní vědeckou publikaci. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

Mgr. Monika Čechová, Ph.D. (přednášející)
doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 16. 2. až St 11. 5. St 16:00–16:50 A319

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost poslouchat přednášky a přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 80 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Dlouhodobým tématem semináře je "Analýza bioinformatických (mol.biologických a biomedicínských) dat". Jednotlivé běhy můžou být zaměřeny na užší okruh problémů.

Výstupy z učení

Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• - Úvod do použití 'deep learning' v bioinformatice - Přednášky zvaných hostů z celého světa k této problematice - Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu nebo aplikaci z dané oblasti

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

přednášky zvaných hostů, studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní vědeckou publikaci. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučováno online.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 11:00–11:50 Virtuální místnost

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 80 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".

Výstupy z učení

Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 17. 2. až Pá 15. 5. Čt 9:00–9:50 C525

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 80 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".

Výstupy z učení

Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 9:00–9:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 43 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Čt 12:00–12:50 C416

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 43 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bioinformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 12:00–13:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 43 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 8:00–9:50 C416

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 43 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Aleš Horák, Ph.D.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Pá 10:00–11:50 C416

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

St 12:00–13:50 G107

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Pá 12:00–13:50 B116

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře je "Analýza biologických sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů, určování struktury proteinů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat: ován
• Zpracování dat ze sekvenace
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Dodavatelské pracoviště: Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 42 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat:
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 8:00–8:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 40 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat:
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Po 9:00–9:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 40 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy a funkce genů, promotorů a jiných elementů".
Absolvováním předmětu student získá přehled o vědeckých problémech řešených v oblasti bioinformatiky; zdokonalí se v schopnosti vystupovat před publikem a vést diskuzi.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci). Příklady témat:
• Identifikace genů v sekvenci DNA
• Metody hodnocení podobnosti sekvencí
• Vyhledávaní vzorů v sekvencích DNA
• Modelování sekundární struktury DNA a RNA

Literatura

• ZVELEBIL, Marketa J. a Jeremy O. BAUM. Understanding bioinformatics. New York, N.Y.: Garland Science, 2008, xxiii, 772. ISBN 9780815340249. info

Výukové metody

studentský seminář a diskuse

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a odprezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. V případě absence absolvuje student ústní zkoušku.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/
Students select specific papers for each cycle of the seminar at the beginning of the semester. The papers typically come from scientific journals (Bioinformatics, BMC Bioinformatics, Journal of Computational Biology, Proteins) or conference proceedings (RECOMB, ISCB, ECCB).

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 9:00–9:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy genů, promotorů a jiných elementů". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Bionformatics seminar

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 12:00–12:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 37 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy genů, promotorů a jiných elementů". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Seminář z bioinformatiky

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 12:00–12:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy genů, promotorů a jiných elementů". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Seminář z bioinformatiky

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 13:00–13:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy genů, promotorů a jiných elementů". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

IV106 Seminář z bioinformatiky

Rozsah

0/1/0. 1 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.

Vyučující

doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D. (přednášející)

Garance

prof. PhDr. Karel Pala, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky

Rozvrh

Út 11:00–11:50 B411

Předpoklady

Od zájemců o tento silně mezioborový kurz se očekáva schopnost přečíst odborný článek nebo kapitolu knihy v anglickém jazyce. Hlubší znalosti konstrukce algoritmů a programování pomohou studentům soustředit se na biologickou stránku prezentované látky nebo naopak. U studentů nebiologickych oborů se vyžaduje paralelní navštěvování nebo předcházející absolvování předmetu IV107 - Bioinformatika I nebo souhlas učitele.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 18 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Nový předmět v oblasti aplikované informatiky, který si klade za cíl otevřít studentům dveře do fascinujícího světa molekul, genů a proteinů. Společným tématem semináře pro jaro je "Analýza genomových sekvencí, určování polohy genů, promotorů a jiných elementů". Kurz se bude konat jednou týdně po 1 hodině, kolokvium získá každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Osnova

• Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí dle vlastního výběru (z navržených článků nebo po konzultaci).

Metody hodnocení

Studenti samostatně nastudují a prezentují svým kolegům konkrétní metodu pro předpovídání elementů genomových sekvencí. Na konci kurzu absolvují studenti krátký kontrolní test. Kolokvium absolvuje každý student, který odprezentuje nastudovanou metodu a získá nejméně 50% bodů na kontrolním testu.

Navazující předměty

• IV105 Seminář z bioinformatiky
• IV108 Bioinformatika II

Informace učitele

http://www.fi.muni.cz/~lexa/

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.

• Statistika zápisu (nejnovější)