PA052 Úvod do systémové biologie

Fakulta informatiky
podzim 2010
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Luboš Brim, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. David Šafránek, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Ing. Václav Přenosil, CSc.
Katedra strojového učení a zpracování dat – Fakulta informatiky
Rozvrh
Čt 16:00–17:50 B411
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Studenti budou po absolvování tohoto kurzu seznámeni s problematikou komplexních systémů v biologii, porozumí základním principům systémové biologie a získají jasnou motivaci pro uplatnění informatických přístupů a myšlení v moderní biologii.
Osnova
  • 1.Historie a zaměření systémové biologie 2. Úvod do biologických pojmů 3. Základní pojmy a principy systémové biologie 4. Získávání biologických dat - Databáze systémově biologických znalostí 5. Průběh výzkumu v systémové biologii - Uplatnění informatických metod 6. Uchopení a specifikace biologického systému - Biologické sítě a jejich rekonstrukce 7. Pojem modelu v systémové biologii -- Modelování a simulace dynamických dějů uvnitř biologických systémů 8. Příklady systémově biologického výzkumu 9. Přehled případových studií modelů živých organismů 10. Validace modelu - Vztah analýzy in silico modelu a experimentální analýzy 11. Návrh a rekonstrukce biologických systémů
Literatura
    doporučená literatura
  • ALON, Uri. An Introduction to Systems Biology: Design Principles of Biological Circuits. Chapman & Hall/Crc, 2006. info
Výukové metody
přednáška, samostatné studium
Metody hodnocení
Zkouška je písemná. V případě zadání průběžných testů během semestru, mají tyto podíl nejvýše 30% na závěrečném hodnocení. Pomocné materiály nejsou povoleny.
Informace učitele
http://www.fi.muni.cz/usr/brim/vyuka/pa052.html
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2011, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.