EMBC0321p Biochemie I - přednáška

Lékařská fakulta
podzim 2021
Rozsah
3/0/0. 45. 1 kr. Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D. (přednášející)
prof. RNDr. Eva Táborská, CSc. (přednášející)
doc. RNDr. Jiří Dostál, CSc. (přednášející)
Mgr. Jiří Slanina, Ph.D. (přednášející)
Bc. Ivana Ševčíková (pomocník)
Garance
doc. RNDr. Josef Tomandl, Ph.D.
Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Dodavatelské pracoviště: Biochemický ústav – Teoretická pracoviště – Lékařská fakulta
Rozvrh
Út 14. 9. až Út 21. 9. Út 8:00–9:50 B22/116 aula, Čt 30. 9. až Čt 16. 12. Čt 8:00–8:50 B22/116 aula, Út 12. 10. až Út 14. 12. Út 8:00–9:50 B22/116 aula; a Čt 23. 9. 8:00–8:50 B11/234, Út 5. 10. 8:00–9:50 B11/234
Předpoklady
EMLC0111p Lékařská chemie - přednáška && EMBI0222s Biologie II - seminář || EMBI0222p Biologie II - přednáška
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu Biochemie I je získat znalosti o základních metabolických pochodech a drahách probíhajících na buněčné úrovni. Porozumění těmto procesům je základem pro pochopení metabolismu na tkáňové a orgánové úrovni, jež je náplní navazujícího předmětu Biochemie II.
Výstupy z učení
Po absolvování předmětu bude student schopen:
- popsat a diskutovat vlastnosti a funkci enzymů
- popsat základní katabolické i anabolické dráhy buněčného metabolismu sacharidů, lipidů a proteinů a jejich návaznosti
- rozumět principům získávání,využívání a ukládání energie pochody na buněčné úrovni
- znát syntézu proteinů, počínaje procesy replikace a transkripce,translace a posttranslační úpravy
- porozumět vztahu mezi strukturou a funkcí proteinů
- znát funkci hemoglobinu při transportu kyslíku a udržování acidobazické rovnováhy
Osnova
  • Chemické složení lidského těla, ROS, distribuce vody v těle, osmolalita a osmolarita, význam pufrů.
  • Struktura biomembrán, jejich výstavba a odbourávání.
  • Specializované struktury plazmatické membrány. Transport přes membrány.
  • Enzymy. Charakteristické rysy biokatalýzy, struktura enzymů a jejich vztah k funkci, názvy a třídění enzymů.
  • Kofaktory enzymů, přehled struktur a jejich funkcí.
  • Mechanismus účinku enzymů, kinetika enzymově katalyzovaných reakcí. Stanovení katalytické aktivity enzymů, volba podmínek. Ovlivnění katalytické aktivity, typy inhibice.
  • Obecné principy metabolismu. Biologické oxidace, makroergní sloučeniny.
  • Metabolismus sacharidů. Glykolýza. Glukoneogeneze. Syntéza a odbourávání glykogenu. Pentosový cyklus.Vzájemné přeměny sacharidů v buňce, vznik derivátů cukrů.
  • Metabolismus bílkovin a aminokyselin. Obecné mechanismy biodegradace aminokyselin, ureosyntéza. Metabolismus jednotlivých aminokyselin a jejich uhlíkatého skeletu.
  • Syntéza a odbourání mastných kyselin, ketogeneze. Syntéza triacylglycerolů. Metabolismus fosfolipidů a glykolipidů. Vznik ikosanoidů. Syntéza a přeměny cholesterolu, žlučové kyseliny.
  • Vzájemné vztahy přeměny živin. Citrátový cyklus. Mitochondrie. Enzymy dýchacího řetězce, vznik ATP v procesu aerobní fosforylace.
  • Syntéza hemu. Struktura hemoglobinu, její vztah k transportním funkcím. Saturační křivka, ovlivnění saturace hemoglobinu kyslíkem a transportní funkce pro kyslík. Bohrův efekt. Základní typy hemoglobinů v lidské krvi, koncentrace. Pozměněné typy hemoglobinu.
  • Biosyntéza a degradace nukleotidů a jejich bází. Jaderný chromatin, replikace a transkripce DNA, regulace transkripce.
  • Proteosyntéza a posttranslační úpravy polypeptidového řetězce.
Literatura
    povinná literatura
  • MURRAY, Robert K., David A. BENDER, Kathleen M. BOTHAM, Peter J. KENNELLY, Victor W. RODWELL a P. Anthony WEIL. Harperova ilustrovaná biochemie. Translated by Bohuslav Matouš. Páté české vydání, prv. Praha: Galén. xii, 730. ISBN 9788072629077. 2012. info
    doporučená literatura
  • LIEBERMAN, Michael a Alisa PEET. Marks' basic medical biochemistry : a clinical approach. Illustrated by Matthew Chansky. 5th edition. Philadelphia: Wolters Kluwer. xii, 1051. ISBN 9781496387721. 2018. info
  • VASUDEVAN, D. M., S. SREEKUMARI a Kannan VAIDYANATHAN. Úvod do všeobecnej a klinicky aplikovanej biochémie. Edited by Jozef Čársky. Prvé slovenské vydanie. Bratislava: Balneotherma s.r.o. 669 stran. ISBN 9788097015688. 2015. info
Výukové metody
Přednášky.
Metody hodnocení
Student přechází do pokračující výuky předmětu Biochemie II v dalším semestru bez povinnosti ověření znalosti z předmětu Biochemie I.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2022, podzim 2023.