MBKM071p Klinická mikrobiologie II - přednáška

Lékařská fakulta
podzim 2015
Rozsah
2/0. 4 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
doc. MUDr. Milan Dastych, CSc., MBA (přednášející)
MUDr. Jana Juránková, Ph.D. (přednášející)
MUDr. Alena Ševčíková (přednášející)
Michaela Gregorovičová (pomocník)
Garance
doc. MUDr. Milan Dastych, CSc., MBA
Katedra laboratorních metod – Pracoviště nelékařských oborů – Lékařská fakulta
Kontaktní osoba: Michaela Gregorovičová
Dodavatelské pracoviště: Katedra laboratorních metod – Pracoviště nelékařských oborů – Lékařská fakulta
Rozvrh
Út 9:00–11:50 C05/114
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Výuka předmětu Lékařská mikrobiologie staví na základech, které získali studenti absolvováním bakalářského studia.
Cílem teoretické části přípravy je poskytnout rozšířené informace o vlastnostech lékařsky významných mikroorganismů a o patogenezi, klinice, epidemiologii a terapii infekčních onemocnění a podrobné informace o mikrobiologických vyšetřovacích postupech vč. zásad indikace mikrobiologických vyšetření, správného odběru a zasílání infekčního materiálu a správné interpretace výsledků vzhledem ke klinickému stavu pacienta včetně možností antibiotické terapie. V praktické části přípravy je cílem získat praktické zkušenosti a dovednosti v analýze biochemických vlastností, v analýze antigenní, proteomické a molekulárně biologické.
Po absolvování předmětu bude student orientován v detailní diagnostice jednotlivých etiologických agens infekčních chorob: bakterií, virů, parazitů a kvasinek a plísní. Bude moci provádět diagnostika jednotlivých etiologických agens na základě detailních znalostí biochemie, antigenní struktury, složení bílkovin a molekulárně biologických vlastností mikroorganismů. Bude seznámen se základními i specializovanými mikrobiologickými postup, včetně znalosti práce na přístrojích, dostupných v současné laboratorní mikrobiologické praxi. Bude schopen interpretovat výsledek laboratorního vyšetření. Bude cvičen ve schopnostech kombinačních, chápání širších souvislostí infekčních onemocnění. Bude se schopen orientovat v problematice nozokomiálních nákaz. Bude znát zásady racionální antibiotické terapie a antibiotické politiky na národní i mezinárodní úrovni. Bude seznámen se zásady managementu kvality v lékařské mikrobiologii.
Osnova
  • Teoretická část obecná:
  • Úvod do klinické mikrobiologie, historie mikrobiologie
  • Metody mikroskopie, barvící postupy v mikrobiologii
  • Kultivační metody, příprava kultivačních půd
  • Biochemické metody druhové identifikace bakterií
  • Imunologické metody identifikace mikroorganizmů
  • Proteomické metody identifikace bakterií
  • Molekulárně biologické metody identifikace mikroogranizmů
  • Imunologie (specifika antimikrobiální imunity)
  • Epidemiologie jednotlivých infekcí (šíření infekčního agens, cesty přenosu, epidemické šetření a protiepidemická opatření)
  • Nozokomiální infekce, jejich prevence a profylaxe
  • Zásady antibiotické terapie, antibiotická politika
  • Výpočetní technika v mikrobiologické laboratoří
  • Teoretická část speciální:
  • Druhová identifikace jednotlivých mikroorganizmů nebo jejich skupin za použití specifických metod biochemických, imunologických, proteomických a molekulárně biologických:
  • Enterobakterie (salmonely, shigely, escherichie a další), vibria a kampylobaktery
  • Gramnegativní nefermentující tyčinky a kokobacily (pseudomonády, burkholderie, acinetobaktery, legionely.)
  • Kultivačně náročné gramnegativní tyčinky (hemofily, bordetely, francisely, brucely aj.)
  • Gramnegativní koky (neisserie, moraxelly, branhamelly aj.)
  • Grampozitivní koky (stafylokoky, streptokoky, enterokoky aj.)
  • Grampozitivní tyčinky aerobní (bacily, listerie, korynebakteria, nokardie)
  • Anaerobní mikroby (klostridia, aktinomycety, peptostreptokoky, bakteroidy aj.)
  • Mykobakteria
  • Spirochety
  • Mykoplasmata
  • Rickettsie, ehrlichie, chlamydie aj.
  • Kvasinky (kandidy, kryptokoky, pneumocysty) a plísně (aspergily, dermatofyta)
  • RNA-viry (pikornaviry, rotaviry, orthomyxoviry, paramyxoviry, rhabdoviry, retroviry, togaviry)
  • DNA-viry (papilomaviry, adenoviry, hepadnaviry. herpesviry, poxviry) a priony
  • Patogenní prvoci (trichomonády, lamblie, toxoplasmy, plasmodia, leishmanie, trypanosomy), mnohobuněční endoparaziti (motolice, tasemnice, hlístice) a ektoparaziti (vši, blechy, zákožky aj.)
  • Klinické mikrobiologie (běžná mikroflóra jednotlivých orgánových soustav, nejběžnější patogeny v jednotlivých lokalizacích), souvislostí mezi mikrobiologickým nálezem a klinickým stavem pacienta.
  • Teoretická část metodická:
  • Principy mikroskopických technik
  • Principy barvicích technik
  • Kultivační techniky: použití jednotlivých kultivačních půd, využití různého složení atmosféry pro kultivaci, využití různých růstových teplot
  • Metody biochemické identifikace bakterií
  • Metody imunologické identifikace mikroorganizmů
  • Metody proteomické identifikace bakterií
  • Metody molekulárně biologické identifikace mikroorganizmů
  • Průkaz metabolitů mikroorganizmů
  • Provedení testů ciltivosti na antibiotika: diskové difúzní testy, metody stanovení minimální inhibiční koncentrace
  • Stanovení produkce betalaktamáz
  • Stanovení hladiny antibiotik v tělních tekutinách
  • Nepřímý průkaz mikrobů (serologické postupy obecně, jednotlivé serologické reakce a interpretace serologických nálezů)
Literatura
Výukové metody
přednáška s využitím audiovizuálních učebních opor (pp-prezentace, komentovaná videa) včetně interaktivních vstupů;
Metody hodnocení
ústní zkouška
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016, podzim 2017, podzim 2018, podzim 2019, podzim 2020, podzim 2021, podzim 2022, podzim 2023.