VSAG011 Modern technologies for genome analysis

Faculty of Medicine
Autumn 2010
Extent and Intensity
1/0. 2 credit(s). Type of Completion: z (credit).
Teacher(s)
RNDr. Jitka Malčíková, Ph.D. (lecturer)
prof. MUDr. Mgr. Marek Mráz, Ph.D. (lecturer)
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D. (lecturer)
MVDr. Boris Tichý, Ph.D. (lecturer)
Guaranteed by
prof. RNDr. Šárka Pospíšilová, Ph.D.
Department of Internal Medicine, Hematology and Oncology – Joint workplaces with the University Hospital Brno - workplaces of the Bohunice and Mater. Hospital – Faculty of Medicine
Prerequisites (in Czech)
PřF – magisterské navazující a vyšší, LF – bez omezení
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
The capacity limit for the course is 30 student(s).
Current registration and enrolment status: enrolled: 0/30, only registered: 0/30, only registered with preference (fields directly associated with the programme): 0/30
fields of study / plans the course is directly associated with
Course objectives
Seznámit se s genomikou, transkriptomikou a epigenomikou. Porozumět metodám umožňujícím studium celého genomu – čipové technologie a sekvenování nové generace. Obeznámit se s využitím moderních metod v současném biomedicínském výzkumu.
Syllabus
  • Úvod do genomiky; Čipové technologie (CGH, SNP, resekvenační, expresní, proteinové čipy); Sekvenování nové generace (454, SMRT, sequencing by synthesis, sequencing by ligation, iontorent); Metody pro analýzu miRNA; Aplikace nových technologíí v genomice, transkriptomice, epigenomice; Analýza extrahumánního genomu – problematika oportunních infekcí; Detekce chimérismu u pacientů po transplantaci krvetvorných kmenových buněk; Další technologické přístupy: Fluidigm, Sequenom, Luminex, Nanostring
Literature
  • není doporučena žádná literatura
Teaching methods
lectures
Assessment methods
written test
Language of instruction
Czech
Further Comments
Study Materials
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Autumn 2011.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2010, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/med/autumn2010/VSAG011