Bi1508 Syntetická biologie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2015
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi1510 Mgr. SZZ z protein ing
Základní znalosti biochemie, mikrobiologie, molekulární biologie a genetiky.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
Na konci tohoto kurzu bude student rozumět podstatě syntetické biologie a bude schopen uvést příklady jejího využití v rozmanitých aplikacích. Absolventi kurzu budou mít teoretické základy a komplexní přehled v oboru důležitý pro jejich budoucí uplatnění ve výzkumných laboratořích, biomedicínském výzkumu a vývoji nebo biotechnologickém průmyslu.
Osnova
  • 1) Úvod do problematiky, vymezení syntetické biologie coby samostatného vědního oboru v historickém kontextu, doporučená literatura. 2) "High-throughput" syntéza a sekvencování DNA, design syntetických genetických okruhů a spínačů v buňce. 3) Systémová biologie, matematické modelování živých systémů, bioinformatické nástroje v syntetické biologii. 4) Design a registrace nových biologických komponent v syntetické biologii, orthogonální systémy. 5) Hostitelské organismy v syntetické biologii, "minimální genom" a "minimální buňka", buněčná šasi. 6) Syntetický genom, syntetický život (buňka), nástroje pro editaci genomu. 7) Syntetická biologie v metabolickém inženýrství. 8) Biosensory, mezibuněčná komunikace, de novo protein design. 9) Bezbuněčné systémy. 10) Etické aspekty syntetické biologie.
Literatura
  • Synthetic biology : tools and applications. Edited by Huimin Zhao. Amsterdam: Elsevier. xviii, 333. ISBN 9780123944306. 2013. info
  • Synthetic biology : a primer. Edited by Geoff Baldwin. London: Imperial College Press. xiv, 179. ISBN 9781848168626. 2012. info
  • SCHMIDT, Markus. Synthetic biology : industrial and environmental applications. Weinheim: Wiley-Blackwell. xxvi, 240. ISBN 9783527331833. 2012. info
Výukové metody
Při výuce jsou používány Powerpointové prezentace, před každou lekcí jsou k dispozici PDF materiály pro tisk a poznámky.
Metody hodnocení
Závěrečné hodnocení kurzu bude vycházet z výsledků závěrečného souhrnného testu, který je písemný a je vypisován v běžném zkouškovém období.
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět není v akademickém roce 2015/2016 vypisován.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2016.