Bi5447 Database Systems in Biomedicine

Faculty of Science
Autumn 2011
Extent and Intensity
1/1/0. 2 credit(s) (fasci plus compl plus > 4). Type of Completion: zk (examination).
Teacher(s)
RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D. (lecturer)
Guaranteed by
prof. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
RECETOX – Faculty of Science
Contact Person: RNDr. Daniel Klimeš, Ph.D.
Course Enrolment Limitations
The course is also offered to the students of the fields other than those the course is directly associated with.
fields of study / plans the course is directly associated with
Course objectives (in Czech)
Cílem předmětu je seznámit studenty s databázovými systémy a jejich využitím v oblasti klinického a biomedicínského výzkumu. Důraz je kladen na praktické dovednosti v práci s relační databází a dotazovací jazyk SQL. Student po absolvování předmětu má představu o současných možnostech databázových technologií, dokáže pracovat s relační databází, čerpat z ní data dle požadovaných podmínek, předzpracovávat rozsáhlá data s využitím SQL jazyka. Dále bude schopen vytvářet databázovou strukturu, vkládat data do databáze jak standardními prostředky SQL, tak pomocí specifických datových pump. Praktická cvičení budou probíhat jak na volně dostupném software, tak nad profesionální komerční databází.
Syllabus (in Czech)
  • Databázové systémy, typy, současná nabídka, relační struktura, metody sběru dat
  • SQL - řídící jazyk pro relační databázové systémy, datové typy
  • SQL DML příkazy (Data manipulation language)
  • SQL DDL příkazy (Data definition language)
  • Databázové transakce, konkureční zpracování dat, řízení přístupu k datům v databázích
  • SQL - pokročilé konstrukce
  • ORACLE - rozšířené SQL - analytické funkce
  • ORACLE - základy procedurálního jazyka PL/SQL
  • Import dat, datové pumpy, software SQLLDR
  • Sběr klinických dat, softwarová řešení, životní cyklus klinického registru
  • Základy XML, datová rozhraní
Teaching methods (in Czech)
Výuka probíhá v počítačové učebně, po úvodní přednášce následuje praktické cvičení.
Assessment methods (in Czech)
zápočet je udělován za vypracování domácího úkolu z oblasti SQL a práce s databází. Zkouška je formou testu, úkolem je vytvořit obdobu SQL příkazů procvičovaných v předchozích praktických hodinách.
Language of instruction
Czech
Further comments (probably available only in Czech)
Study Materials
The course is taught annually.
The course is taught: every week.
The course is also listed under the following terms Autumn 2011 - acreditation, Autumn 2012, Autumn 2013, Autumn 2014, Autumn 2015, Autumn 2016, autumn 2017, Autumn 2018, Autumn 2019, Autumn 2020, Spring 2021, Spring 2022.
  • Enrolment Statistics (Autumn 2011, recent)
  • Permalink: https://is.muni.cz/course/sci/autumn2011/Bi5447