Bi5491 Praktikum z molekulární diagnostiky

Přírodovědecká fakulta
podzim 2006
Rozsah
0/3/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: kz. Jiná možná ukončení: z.
Vyučující
učitelé GMB (cvičící)
doc. Mgr. Petr Beneš, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Petr Kuglík, CSc. (cvičící)
prof. RNDr. Roman Pantůček, Ph.D. (cvičící)
doc. RNDr. Vladislava Růžičková, CSc. (cvičící)
Garance
doc. RNDr. Petr Kuglík, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Petr Kuglík, CSc.
Předpoklady
( SOUHLAS || ( B4070 Obecná mikrobiologie || B4090 Obecná mikrobiologie || B4090p Obecná mikrobiologie - p || Bi4090c Obecná mikrobiologie - cv. || BX090 || BMB22 Obecná mikrobiologie || B2050 Obecná mikrobiologie || Bi2050c Zákl. obecné mikrobiologie cv. )) && ( Bi4035 Molekulární biologie - lab.cv. || Bi4020c Molekulární biologie - cvičení )
Molekulární struktura a funkce prokaryotického a eukaryotického genomu. Základní znalosti mikrobiologických metod. Znalosti výpočtu složení roztoků.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.

Předmět si smí zapsat nejvýše 10 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/10, pouze zareg.: 0/10
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět patří k základnímu kurzu Molekulární biologie pro studenty oboru Buněčná a molekulární diagnostika. Obsahuje praktické úlohy, sloužící k osvojení si základních metodických postupů v molekulární biologii bakterií a jejich virů.
Osnova
  • 1. Makrorestrikční analýza genomové DNA pomocí pulzní-gelové elektroforézy. 2. Neradioaktivní značení sond digoxigeninem. 3. Southernův přenos a selektivní hybridizace bakteriální DNA se specifickými sondami. 4. PCR detekce specifických genů u bakterií. 5. Izolace proteinu z zivocisnych bunek, elektroforeza SDS-PAGE, westernovy prenos, protilatkova detekce specifickeho proteinu. 6. Stanovení počtu živočišných buněk v populaci s použitím hemocytometru a mikroskopie. 7.-12. Specializované úlohy z molekulární diagnostiky prováděné na externích odborných pracovištích.
Literatura
  • Návody k úlohám jsou dostupné u vyučujících
  • PCR Protocols for Emerging Infectious Diseases :a supplement to Diagnostic molecular microbiology : principles and applications. Edited by David H. Persing. Washington: ASM Press. xii, 180 s. ISBN 1-55581-108-6. 1996. info
  • PERSING, D.H., T.F. SMITH, F.C. TENOVER a T.J. WHITE. Diagnostic molecular microbiology. Washington, D.C.: ASM Press. 642 s. ISBN 1-55581-056-X. 1993. info
  • MILLER, Jeffrey H. A Short course in bacterial genetics : a laboratory manual and handbook for Escherichia coli and related bacteria. New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press. 456 s. ISBN 0879693495. 1992. info
  • SAMBROOK, J., E.F. FRITSCH a T. MANIATIS. Molecular Cloning. A laboratory Manual. Second Edition. Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISBN 0-87969-309-6. 1989. info
Metody hodnocení
Výuka: praktické cvičení, zápočet: písemné testové otázky, protokoly.
Informace učitele
Studenti by měli svojí účastí zvládnout zadané úlohy. Průběžně je hodnocena dovednost posluchačů, schopnost vyhodnotit výsledky zdůvodnit případné negativní výsledky. Odevzdat na závěr výuky protokoly z provedených úkolů a absolvovat závěrečný test
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2005, podzim 2007, podzim 2008, podzim 2009.