Bi7910 Metody environmentální mikrobiologie

Přírodovědecká fakulta
podzim 2011
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
doc. Ing. Martin Krsek, CSc., MSc (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jan Šmarda, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Ing. Martin Krsek, CSc., MSc
Předpoklady
Bi8555 Environ. mikrobiol.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit posluchače s metodami používanými v environmentální mikrobiologii s důrazem na nejnovější molekulární metody.
Osnova
  • Úvod, metody odběru a zpracování environmentálních vzorků z různých prostředí, detekce mikroorganismů v půdě, izolace mikroorganismů, stanovení biomasy, detekce mikrobiální aktivity, metody izolace mikrobiální R/DNA, tvorba metagenomových knihoven, určení diverzity mikrobiálních společenstev, využití metod PLFA a FAME ve studiu diverzity mikrobiálních společenstev, fingerprintové metody v environmentální mikrobiologii (T/DGGE, SSCP, LH-PCR, T-RFLP), metoda reasociace environmetální DNA, využití metagenomových knihoven a pyrosekvenování v environmentální mikrobiologii, izotopové metody a jejich využití a význam, chromatografick metody (plynová a kapalinová chromatografie) v environmetální mikrobiologii.
Literatura
    doporučená literatura
  • Methods for Studying the Ecology of soil Micro-organisms, D Parkinson, TRG Gray, ST Williams, Blackwell Scientific Publications, 1971
  • Environmental microbiology :current technology and water applications. Edited by Keya Sen. Norfolk: Caister Academic Press. ISBN 9781904455707. 2011. info
  • PEPPER, Ian L. a Charles P. GERBA. Environmental microbiology : a laboratory manual. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier. xvii, 209. ISBN 0125506562. 2004. info
  • BITTON, Gabriel. Encyclopedia of environmental microbiology. New York, N.Y.: John Wiley & Sons. vi, 577-11. ISBN 0471360473. 2002. info
Výukové metody
přednáška
Metody hodnocení
Aktivní účast na přednáškách, závěrečná ústní zkouška
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
  • Statistika zápisu (nejnovější)
  • Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011/Bi7910