Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Rozvrh
Pá 9:00–10:50 B11/306
Předpoklady
C3580 Biochemie || C3181 Biochemie I || Bi4010 Základy molekulární biologie || B4020 Molekulární biologie || Bi4020 Molekulární biologie
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 20 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem této přednášky je aby studenti získali základní znalosti o přípravě proteinů v dostatečném množství a kvalitě na krystalizaci, NMR analýzu a pro jiná biochemická měření. Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět různým přístupům klonování do různých expresních vektorů s využitím afinitních kotviček i bez a s následnou purifikací těchto rekombinačních proteinů afinitně nebo klasicky; odstranit fúzní protein (kotvičku); uchovat protein v solubilním stavu; detekovat různými metodami proteiny v průběhu purifikačních postupů.
Osnova
  • 1. Molekulární principy pro pochopení vlastnosti proteinů. 2. Výpočty v molekulární biologii 3. Důležité vlastnosti bílkovin a jak je zkoumat. 4. Klonování DNA. 5. Exprese proteinů. 6. Desintegrace buněk. 7. Fúzní proteiny a afinitní purifikace. 8. Chromatografie pro purifikaci proteinů. 9. Kvalita bílkovin. 10. Analytické metody používané ke studiu proteinů. 11. Značení proteinů. 12. Zvaná přednáška.
Literatura
    doporučená literatura
  • PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
  • High throughput protein expression and purification : methods and protocols. Edited by Sharon A. Doyle. Totowa, N.J.: Humana Press, 2009, xii, 322. ISBN 9781588298799. info
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
Výukové metody
Hlavní výukovou metodou jsou přednášky, obsahující konkrétní příklady vlastní vědecké praxe jednotlivých přednášejících a demonstrace řešení konkrétních problémů.
Metody hodnocení
Písemný test + ústní zkouška
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2012 - akreditace.

Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace

Přírodovědecká fakulta
jaro 2010
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. et Mgr. Veronika Oškerová, Ph.D. (pomocník)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Předpoklady
Bi8202 Základy proteomiky
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 21 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem této přednášky je aby studenti získali základní znalosti o přípravě proteinů v dostatečném množství a kvalitě na krystalizaci, NMR analýzu a pro jiná biochemická měření. Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět různým přístupům klonování do různých expresních vektorů s využitím afinitních kotviček i bez a s následnou purifikací těchto rekombinačních proteinů afinitně nebo klasicky; odstranit fúzní protein (kotvičku); uchovat protein v solubilním stavu; detekovat různými metodami proteiny v průběhu purifikačních postupů.
Osnova
  • 1. Molekulární principy pro pochopení vlastnosti proteinů. 2. Výpočty v molekulární biologii 3. Důležité vlastnosti bílkovin a jak je zkoumat. 4. Klonování DNA. 5. Exprese proteinů. 6. Desintegrace buněk. 7. Fúzní proteiny a afinitní purifikace. 8. Chromatografie pro purifikaci proteinů. 9. Kvalita bílkovin. 10. Analytické metody používané ke studiu proteinů. 11. Značení proteinů. 12. Zvaná přednáška.
Výukové metody
Teoretická příprava
Metody hodnocení
Písemný test + ústní zkouška
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace.

Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012

Předmět se v období jaro 2012 nevypisuje.

Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 43 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem této přednášky je aby studenti získali základní znalosti o přípravě proteinů v dostatečném množství a kvalitě na krystalizaci, NMR analýzu a pro jiná biochemická měření. Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět různým přístupům klonování do různých expresních vektorů s využitím afinitních kotviček i bez a s následnou purifikací těchto rekombinačních proteinů afinitně nebo klasicky; odstranit fúzní protein (kotvičku); uchovat protein v solubilním stavu; detekovat různými metodami proteiny v průběhu purifikačních postupů.
Osnova
  • 1. Molekulární principy pro pochopení vlastnosti proteinů. 2. Výpočty v molekulární biologii 3. Důležité vlastnosti bílkovin a jak je zkoumat. 4. Klonování DNA. 5. Exprese proteinů. 6. Desintegrace buněk. 7. Fúzní proteiny a afinitní purifikace. 8. Chromatografie pro purifikaci proteinů. 9. Kvalita bílkovin. 10. Analytické metody používané ke studiu proteinů. 11. Značení proteinů. 12. Zvaná přednáška.
Literatura
    doporučená literatura
  • PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
  • High throughput protein expression and purification : methods and protocols. Edited by Sharon A. Doyle. Totowa, N.J.: Humana Press, 2009, xii, 322. ISBN 9781588298799. info
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
Výukové metody
Hlavní výukovou metodou jsou přednášky, obsahující konkrétní příklady vlastní vědecké praxe jednotlivých přednášejících a demonstrace řešení konkrétních problémů.
Metody hodnocení
Písemný test + ústní zkouška
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace.

Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012 - akreditace

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi8202 Základy proteomiky
Předpokladem pro porozumění předmětu je znalost základů biochemie nebo molekulární biologie.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 21 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Cílem této přednášky je aby studenti získali základní znalosti o přípravě proteinů v dostatečném množství a kvalitě na krystalizaci, NMR analýzu a pro jiná biochemická měření. Na konci tohoto kurzu bude student schopen: porozumět různým přístupům klonování do různých expresních vektorů s využitím afinitních kotviček i bez a s následnou purifikací těchto rekombinačních proteinů afinitně nebo klasicky; odstranit fúzní protein (kotvičku); uchovat protein v solubilním stavu; detekovat různými metodami proteiny v průběhu purifikačních postupů.
Osnova
  • 1. Molekulární principy pro pochopení vlastnosti proteinů. 2. Výpočty v molekulární biologii 3. Důležité vlastnosti bílkovin a jak je zkoumat. 4. Klonování DNA. 5. Exprese proteinů. 6. Desintegrace buněk. 7. Fúzní proteiny a afinitní purifikace. 8. Chromatografie pro purifikaci proteinů. 9. Kvalita bílkovin. 10. Analytické metody používané ke studiu proteinů. 11. Značení proteinů. 12. Zvaná přednáška.
Literatura
    doporučená literatura
  • PRICE, Nicholas C. a Jacqueline NAIRN. Exploring proteins : a student's guide to experimental skills and methods. Oxford: Oxford University Press, 2009, xv, 512. ISBN 9780199205707. info
  • High throughput protein expression and purification : methods and protocols. Edited by Sharon A. Doyle. Totowa, N.J.: Humana Press, 2009, xii, 322. ISBN 9781588298799. info
  • HARDIN, Charles. Cloning, gene expression and protein purification : experimental procedures and process rationale. New York: Oxford University Press, 2001, viii, 435. ISBN 0195132947. info
Výukové metody
Hlavní výukovou metodou jsou přednášky, obsahující konkrétní příklady vlastní vědecké praxe jednotlivých přednášejících a demonstrace řešení konkrétních problémů.
Metody hodnocení
Písemný test + ústní zkouška
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011.

Bi8980 Příprava a charakterizace proteinů I - Exprese a purifikace

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011 - akreditace
Rozsah
2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Ukončení: zk.
Vyučující
RNDr. Lubomír Janda, Ph.D. (přednášející)
Ing. Blanka Pekárová, Ph.D. (přednášející)
Mgr. Radka Dopitová, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Lubomír Janda, Ph.D.
Předpoklady
Bi8202 Základy proteomiky
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je určen pouze studentům mateřských oborů.
Mateřské obory/plány
předmět má 21 mateřských oborů, zobrazit
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace.