Informace o předmětu

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 6/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 6/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 15:00–19:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 15/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 15:00–19:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 3/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 14:00–18:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.
Vyučováno částečně online.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Petr Lapčík, Ph.D. (pomocník)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Út 14:00–18:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet pokročilé biochemické metodiky. V rámci kurzu se studenti naučí samostatně provádět izolaci a separaci biomolekul (nukleové kyseliny, proteiny, nízkomolekulární látky), aplikovat metody pro stanovení aktivit enzymů, metody pro stanovení hladin mRNA a proteinů (qPCR, proteomika na bázi kvantitativní hmotnostní spektrometrie), práci s tkáňovými kulturami a moderními diagnostickými metodami, zpracovávat, statisticky vyhodnocovat a interpretovat získaná data.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést nativní elektroforézu a stanovit enzymovou aktivitu - Izolovat proteiny z nádorových buněčných linií a stanovit celkovou koncentraci proteinu - Provést štěpení proteinů trypsinem a purifikovat získané peptidy v rámci proteomického experimentu - Provést databázové prohledávání proteomických LC-MS/MS dat, statisticky vyhodnotit a interpretovat výsledky - Provést molekulární klonování - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést PCR-RFLP analýzu - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha A: Analýza izoenzymů askorbát peroxidasy pomocí nativní PAGE a aktivity phenylalanin-amoniak lyasy Úloha B: Porovnání proteotypů nádorových buněčných linií pomocí kvantitativní hmotnostní spektrometrie Úloha C: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha D: Identifikace neznámého elicitinu na základě jeho aktivity Úloha E: Identifikace jednotlivých druhů václavek ze vzorku půdy

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Student musí absolvovat všechny úlohy a odevzdat z nich požadované protokoly.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. David Novák (pomocník)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

předmět má 8 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést PCR-RFLP analýzu - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést 2D-elektroforézu - Provést nativní elektroforézu - Provést expresi rekombinantních proteinů v E. coli a jejich izolaci - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: z.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést PCR-RFLP analýzu - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést 2D-elektroforézu - Provést nativní elektroforézu - Provést expresi rekombinantních proteinů v E. coli a jejich izolaci - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Doporučované ukončení: z. Jiná možná ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Výstupy z učení

Student bude po absolvování předmětu schopen: - Provést PCR-RFLP analýzu - Izolovat RNA z biologického materiálu - Provést reverzní transkripci - Provést qPCR a vyhodnotit data - Provést 2D-elektroforézu - Provést nativní elektroforézu - Provést expresi rekombinantních proteinů v E. coli a jejich izolaci - Provádět kritické hodnocení získaných dat

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Gabriela Lochmanová, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Čt 9:00–13:50 C15/211

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Úloha č.1: Identifikace jednotlivých druhů Václavek ze vzorku půdy Úloha č.2: Vliv polymorfismu v genu pro alkoholdehydrogenázu na její aktivitu Úloha č.3: Klonování PCR produktu do plasmidu Úloha č.4: Studium změn proteomu bakterie Paracoccus denitrificans při přechodu z aerobních do anaerobních růstových podmínek pomocí dvourozměrné elektroforézy Úloha č.5: Detekce aktivity askorbát peroxidasy v polyakrylamidovém gelu Úloha č.6: Stanovení změny exprese genů pro pathogenesis related (PR) proteiny u rostlin tabáku Úloha č.7: Exprese a purifikace rekombinantních proteinů Úloha č.8: Využití bioluminiscence v přípravě bakteriálních vakcín.

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/0/5. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/5/0. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Rozvrh

St 8:00–11:50 C05/108

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30

Mateřské obory/plány

předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/5/0. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Rozvrh

Čt 10:00–13:50 C05/108

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30

Mateřské obory/plány

• Biochemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/5/0. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Předpoklady

C4220 Biochemie-lab.cvič. && C6200 Biochemické metody
C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 24 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/24, pouze zareg.: 0/24, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/24

Mateřské obory/plány

• Biochemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

0/5/0. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30

Mateřské obory/plány

předmět má 7 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

C7195 Pokročilé praktikum z biochemie

Rozsah

0/5/0. 5 kr. (plus ukončení). Ukončení: kz.

Vyučující

doc. Mgr. Jan Lochman, Ph.D. (cvičící)
prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D. (cvičící)
doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D. (cvičící)

Garance

prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.
Ústav biochemie – Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Tomáš Kašparovský, Ph.D.

Předpoklady

C4220 Biochemie - laboratorní cvičení C6200 Biochemické metody

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30

Mateřské obory/plány

• Biochemie (program PřF, M-CH)

Cíle předmětu

Cílem laboratorního kurzu je prakticky si vyzkoušet nejpoužívanější biochemické metodiky. V rámci tohoto kurzu se studenti naučí samostatně provádět: separaci a izolaci biomolekul (proteiny, nukleové kyseliny, nízkomolekulární látky), purifikaci biomolekul (afinitní chromatografie), měření interakcí mezi biomolekulami, metody pro stanovení aktivit enzymů, imunochemické metody, práce s tkáňovými kulturami, moderní diagnostické metody.

Osnova

• Klonování genu FerB do plasmidu pGEM T-Easy Identifikace jednotlivých druhů václavek z půdy pomocí nested PCR-RFLP analýzy Stanovení změny exprese genu pro PR1a protein Studium změn v proteomu tabáku během obranné reakce pomocí dvourozměrné elektroforézy Identifikace glykoproteinů krevního séra pomocí SDS-PAGE a Western blot analýzy Detekce izoenzymů askorbát peroxidasy a peroxidasy pomocí nativní PAGE Izolace enzymu FerB z buněk Paracoccus denitrificans Studium interakce ligand-protein

Literatura

• Návody ke cvičením - viz Studijní materiály

Výukové metody

Laboratorní cvičení

Metody hodnocení

Před každým cvičením se píše test ověřující připravenost studenta na danou úlohu. Student musí absolvovat všechny úlohy.

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.

• Statistika zápisu (nejnovější)