C7940 Bioanalytika I - Biomakromolekuly

Přírodovědecká fakulta
podzim 2005
Rozsah
2/0/0. 2 kr. Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
doc. Mgr. Jan Havliš, Dr. (přednášející)
Garance
doc. Mgr. Jan Havliš, Dr.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Pá 8:00–9:50 Kontaktujte učitele
Předpoklady
Předpokladem je základní znalost biochemie (C3181 Biochemie I, C4182 Biochemie II). Doporučenou přednáškou je C7895 Hmotnostní spektrometrie biomolekul
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
předmět má 14 mateřských oborů, zobrazit
Cíle předmětu
Předmět shrnuje základní vědomosti z analytických postupů při analýze biomakromolekul a suprabiomolekulárních struktur.
Osnova
  • - analytické postupy v bioanalytice náročnost; high throuput, shotgun analysis, standardizace; afinitní metody princip, provedení, použití (separace, interakční studie), IMAC, APAGE
  • - imunoanalytické metody princip; imunoanalýza precipitační, aglutinační, imunoeseje, metody: FIA, LIA, RIA, EIA, ELISA, IAC, IACE, SELDI
  • - gelová elektroforéza principy, provedení (1D, 2D); blotting
  • - genomika (analýza DNA) základy genetiky (struktura, funkce DNA), analytické postupy: PCR, restrikční enzymy; sekvence; metylace DNA a její analýza
  • - proteomika (analýza proteinů a jejich komplexů) základy proteomiky (struktura proteinů a proteinových komplexů); expresní proteomika metodologie, metody (2D HPLC, 2D PAGE, MS: bottom-up, top-down)
  • - funkční proteomika - metodologie, metody (TAP-značení, Two-Hybrid, SEAM strategie)
  • - bioinformatika v MS-asistované proteomice identifikace proteinu v organizmech se sekvenovaný a nesekvenovaným genomem (MS BLAST, MultiTag)
  • - kvantitativní analýza proteinových komplexů metoda vnitřního standardu; hmotnostní značka (ICAT, ICMT, TMT, MCAT, GIST, SILAC, SIL), absolutní kvantifikace proteinů a peptidů pomocí MS
  • - strukturní proteomika metodologie (chemical cross-linking), metody (FTICR MS)
  • - lipidomika (analýza lipidů a buněčných membrán) základy lipidomiky (struktura funkce buň. membrán a jejich složek), analytické postupy: extrakce lipidů, TLC, GC, LC, SFC, GPC, MS (PIS, HGS, FAS)
Metody hodnocení
Přednáška je založena na prezentaci, která bude k dispozici ve formátu PDF. Předmět je ukončen ústní zkouškou.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2007 - akreditace, podzim 2000, podzim 2001, podzim 2002, podzim 2003, podzim 2004, podzim 2006, podzim 2007, podzim 2008.