Informace o předmětu

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 19. 2. až Ne 26. 5. Pá 9:00–9:50 Kontaktujte učitele, Pá 10:00–10:50 Kontaktujte učitele

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (cvičící)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Pá 9:00–9:50 Kontaktujte učitele, Pá 10:00–10:50 Kontaktujte učitele

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Pá 9:00–9:50 Kontaktujte učitele, Pá 10:00–10:50 Kontaktujte učitele

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Po 1. 3. až Pá 14. 5. Pá 9:00–9:50 C04/118, Pá 10:00–10:50 C04/211

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučováno prezenčně.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Rozvrh

Pá 9:00–9:50 C04/57, Pá 10:00–10:50 C04/57

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Výstupy z učení

At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
Mgr. Pavel Kadeřávek, Ph.D. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Practical NMR Spectroscopy of Biomolecules

Rozsah

1/0/1. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have basic knowledge of NMR theory, previous passing the course C5320 is an advantage but not absolutely necessary.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on experience with using NMR spectrometers with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important experimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data acquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to use independently the sophisticated NMR instrumentation for routine measurements of spectra of proteins and nucleic acids, as well as most other common samples.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. 1D proton spectroscopy and water suppression techniques 5. 1D NMR spectroscopy of nuclei other than H-1 6. Homonuclear 2D experiments 7. Heteronuclear experiments for natural abundance and isotopically labeled samples 8. Data processing, apodization functions, linear prediction, non-uniform sampling 9. Analysis of protein NMR spectra 10. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

doporučená literatura
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Výukové metody

Lectures plus laboratory practice

Metody hodnocení

Written test of NMR theory plus test of practical operation of the NMR spectrometer.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Navazující předměty

• C6770 NMR Spectroscopy of Biomolecules

Informace učitele

http://www.ncbr.muni.cz/~fiala/

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Studijní materiály
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. Building blocks of pulse sequences 5. Programming of pulse sequences 6. Water suppression techniques 7. Homonuclear 2D experiments 8. Heteronuclear double and triple resonance experiments 9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN) 10. Data processing 11. Analysis of protein NMR spectra 12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at the spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. Building blocks of pulse sequences 5. Programming of pulse sequences 6. Water suppression techniques 7. Homonuclear 2D experiments 8. Heteronuclear double and triple resonance experiments 9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN) 10. Data processing 11. Analysis of protein NMR spectra 12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at the spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. Building blocks of pulse sequences 5. Programming of pulse sequences 6. Water suppression techniques 7. Homonuclear 2D experiments 8. Heteronuclear double and triple resonance experiments 9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN) 10. Data processing 11. Analysis of protein NMR spectra 12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at the spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup and calibrations 3. Pulse sequence programming 4. 2D and 3D heteronuclear experiments for proteins and nucleic acids 5. Data processing and analysis

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at the spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Chemická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Další komentáře

Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory. At the end of the course, the students will be able to prepare independently a biomolecular sample for NMR spectroscopy, choose the appropriate experiments, set up the measurements, and process and evaluate the data.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling
  2. Spectrometer setup
  3. Spectrometer calibrations
  4. Building blocks of pulse sequences
  5. Programming of pulse sequences
  6. Water suppression techniques
  7. Homonuclear 2D experiments
  8. Heteronuclear double and triple resonance experiments
  9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN)
  10. Data processing
  11. Analysis of protein NMR spectra
  12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info
• CAVANAGH, John. Protein NMR spectroscopy : principles and practice. 2nd ed. Amsterdam: Elsevier, 2007, xxv, 885. ISBN 9780121644918. info
• BERGER, Stefan a Siegmar BRAUN. 200 and more NMR experiments : a practical course. Weinheim: Wiley-VCH, 2004, xv, 838. ISBN 3527310673. info
• CAVANAGH, John a Wayne J. FAIRBROTHER. Protein NMR Spectroscopy. Principles and Practice. San Diego: Academic Press, 1996, 587 s. ISBN 0-12-164490-1. info

Výukové metody

Lectures, laboratory practice, work on a project

Metody hodnocení

Presence at the practical sessions in the NMR laboratory is required. Final examination will be based on the results of individual student projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

C7995 Advanced Methods of Biomolecular NMR

Rozsah

2/0. 2 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.

Vyučující

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc. (přednášející)
prof. Mgr. Lukáš Žídek, Ph.D. (přednášející)

Garance

doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.
Národní centrum pro výzkum biomolekul – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Radovan Fiala, CSc.

Předpoklady

Students should have good knowledge of NMR theory at the level of the courses C5320 and/or C6770.

Omezení zápisu do předmětu

Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.

Mateřské obory/plány

předmět má 6 mateřských oborů, zobrazit

Cíle předmětu

The students will get hands-on knowledge of sofisticated experiments used in modern NMR spectroscopy with an accent on techniques for spectroscopy of proteins and nucleic acids. All important exprimental issues from sample preparation and spectrometer setup and calibration trough data aquisition and processing up to spectra evaluation will be discussed as well as practically performed in the laboratory.

Osnova

• 1. NMR sample, preparation and handling 2. Spectrometer setup 3. Spectrometer calibrations 4. Building blocks of pulse sequences 5. Programming of pulse sequences 6. Water suppression techniques 7. Homonuclear 2D experiments 8. Heteronuclear double and triple resonance experiments 9. 3D experiments for proteins and nucleic acids (HNCO, HNCa, HCCH-TOCSY, HCN) 10. Data processing 11. Analysis of protein NMR spectra 12. Analysis of NMR spectra of nucleic acids

Literatura

• NMR of macromolecules : a practical approach. Edited by Gordon C.K. Roberts. Oxford: Oxford University Press, 1993, 399 s. ISBN 0-19-963224-3. info

Metody hodnocení

Presence in practical sessions at the spectrometer is required. Final examination will be based on results of individual projects.

Vyučovací jazyk

Angličtina

Informace učitele

http://ncbr.chemi.muni.cz/~fiala/AdvancedMethods.html

Další komentáře

Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.

• Statistika zápisu (nejnovější)