F8510 Fyzika biopolymerů

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
2/0/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
Mgr. Naděžda Špačková, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
St 18:00–19:50 F1 6/1014
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Předmět je zaměřen na popis, vysvětlení a pochopení molekulární struktury, dynamického chování a fyzikálních vlastností biopolymerů (především DNA, RNA a proteinů).
Hlavním cílem předmětu je umožnit studentům
- porozumět struktuře a chování biopolymerů
- popsat a vysvětlit základní fyzikální vlastnosti biopolymerů, které ovlivňují a určují jejich biologickou funkci
- aplikovat tyto znalosti na vysvětlení působení vnějších faktorů na biopolymery
Osnova
  • 1. Primární, sekundární a terciární struktura nukleových kyselin
  • 2. Primární, sekundární a terciární struktura proteinů
  • 3. Nekovalentní interakce v biopolymerech
  • 4. Chování biopolymerů v roztoku, interakce s ionty a ligandy
  • 5. Interakce biopolymerů s elektromagnetickým zářením, spektroskopické metody
  • 6. Difrakční metody, rentgenová krystalografie
  • 7. Optické vlastnosti biopolymerů, lineární a cirkulární dichroismus
  • 8. Elektrické vlastnosti biopolymerů
  • 9. Magnetické vlastnosti biopolymerů, nukleární magnetická resonance
  • 10. Mechanické vlastnosti biopolymerů
  • 11. Teoretické studium biopolymerů
Literatura
  • S. Neidle, Principles of Nucleic Acid Structure, Academic Press , 2007, 302 p., eISBN: 9780080553528
  • A.V. Finkelstein, O. Ptitsyn, Protein Physics : A Course of Lectures, Academic Press, 2002, 375 p., eISBN: 9780080492186
  • J.N. Israelachvili, Intermolecular and Surface Forces, Academic Press, 2011, 674 p., ISBN: 978-0-12-391927-4
Výukové metody
přednášky, diskuse v hodině
Metody hodnocení
ústní zkouška na základě vybraných tématických otázek
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2005, jaro 2006, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.