Bi7921 Pokročilé zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
Ing. Marek Brabec, PhD. (přednášející), prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (zástupce)
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
( Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology ) && Bi7920 Analýza dat
Základní biostatistické metody, obecný lineární model, zobecněný lineární model.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Cílem přednášky je představit vybrané metody pokročilé analýzy dat, zaměřené na analýzu dat s korelacemi.
Výstupy z učení
Student bude po absolvování předmětu schopen: - charakterizovat metody GLS, LME a GEE - sestavit lineární prediktor z dostupných vysvětlujících proměnných - navrhnout správný experimentální design - aplikovat uvedené metody na data
Osnova
  • 1) Korelované data. 2) Experimentální design: Nested, Split-plot, Pseudoreplikace. 3) Analýza časových řad. 4) Prostorová analýza. 5) Smíšené modely: GLS, LME a GEE. 6) Fylogenetické korekce.
Literatura
    povinná literatura
  • Pekár S. & Brabec M. 2012. Moderní analýza biologických dat. 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. Masaryk University Press, Brno.
Výukové metody
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů.
Metody hodnocení
Ústní zkouška.
Informace učitele
Literatura: Pekár S. & Brabec M. 2012. Moderní analýza biologických dat. 2. Lineární modely s korelacemi v prostředí R. Masaryk University Press, Brno.
Další komentáře
Předmět je vyučován jednou za dva roky.
Poznámka k periodicitě výuky: jarní semestr lichých let.
Výuka probíhá každý druhý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2023, jaro 2025.