B7540 Zpracování dat v ekologii společenstev

Přírodovědecká fakulta
podzim 2000
Rozsah
2/1/0. 3 kr. Ukončení: kz.
Vyučující
prof. RNDr. Milan Chytrý, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Milan Chytrý, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Milan Chytrý, Ph.D.
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Úvod k metodám ekologie společenstev.
Sběr dat v terénu: rozmístění, velikost, tvar ploch, velikost vzorku.
Sledované kvantitativní znaky: frekvence, denzita, pokryvnost, bazální plocha, biomasa; typy kvantitativních dat.
Patternová analýza: distanční a kvadrátové metody.
Měření diverzity: indexy diverzity, ekvitabilita, alfa, beta a gama diverzita, křivky dominance-diverzity.
Úprava dat pro numerické zpracování: redukce, transformace, standardizace.
Koeficienty podobnosti.
Numerická klasifikace: aglomerativní metody a shlukovací algoritmy, divizivní monotetická klasifikace a TWINSPAN.
Teorie gradientové analýzy: lineární a unimodální model, přímá a nepřímá gradientová analýza, faktory prostředí.
Regresní modely: lineární regrese, vážené průměrování, mnohonásobná regrese.
Kalibrace, bioindikace a indikační hodnoty druhů.
Ordinace: analýza hlavních komponent (PCA), korespondenční analýza (CA) a detrendovaná korespondenční analýza (DCA).
Ordinace s omezením: kanonická korespondenční analýza (CCA), testování významnosti faktorů prostředí.
Statistické modely sukcese: markovské řetězce, hodnocení přechodových matic.
Práce s počítačovými programy SYN-TAX, CANOCO, SPSS, TURBEK, TWINSPAN.
Rozbor případových studií.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 1999, podzim 2001.