PřF:Bi7201c Genomika - cvičení - Informace o předmětu
Bi7201c Základy genomiky - cvičení
Přírodovědecká fakultapodzim 2011 - akreditace
Údaje z období podzim 2011 - akreditace se nezveřejňují
- Rozsah
- 0/3/0. 3 kr. (příf plus uk plus > 4). Doporučované ukončení: k. Jiná možná ukončení: z.
- Vyučující
- doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. (cvičící)
RNDr. Eliška Nejedlá, CSc. (cvičící)
RNDr. Alena Kuderová, CSc. (cvičící)
RNDr. Hana Konečná (cvičící)
Mgr. Tereza Dobisová, Ph.D. (cvičící)
Mgr. Markéta Pernisová, Ph.D. (cvičící) - Garance
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
Ústav experimentální biologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. RNDr. Jan Hejátko, Ph.D. - Předpoklady
- NOW ( Bi7201 Genomika )
Předpokladem pro porozumění předmětu je absolvování základů biochemie nebo molekulární biologie a genetiky. - Omezení zápisu do předmětu
- Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 36 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/36, pouze zareg.: 0/36, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/36
Jiné omezení: pro zápis do cvičení je nutné absolvování teoretické přednášky Bi7201 - Mateřské obory/plány
- Biofyzika (program PřF, N-FY)
- Biochemie (program PřF, N-BCH)
- Chemie životního prostředí (program PřF, N-CH)
- Molekulární biologie a genetika (program PřF, N-BI)
- Obecná biologie (program PřF, N-BI)
- Cíle předmětu
- Studenti získají praktické zkušenosti se základními metodami funkční genomiky, t.j. především metody identifikace inzerčních mutantů pomocí PCR: Od navržení primeru, jejich přípravy pomocí syntézy DNA, provedení vlastní PCR reakce, identifikace PCR produktů na gelu a potvrzení specificitry produktů pomocí Southern blot a hybridizace se značenou sondou až po fragmentační analýzu na automatickém sekvenátoru. Práce probíhá ve skupinách po 2 a každý si tak může prakticky vyzkoušet samostatný přístup jak k plánování experimentu, tak i jeho provedení. Na konci tohoto kurzu získají studenti přehled o základních přístupech funkční genomiky, které budou schopni využít při řešení problémů vlastní odborné praxe.
- Osnova
- Design sekvence oligonukleotidů
- Syntéza oligonukleotidů
- Analýza genové exprese pomocí transkripční fůze
- Izolace rostlinné genomové DNA
- Identifikace inzerčního mutanta pomocí PCR
- Práce s databázemi molekulárně-biologických informací
- Přenos DNA na membránu, příprava značené sondy a hybridizace
- Detekce hybridizované sondy
- Fragmentační analýza
- Literatura
- Výukové metody
- Praktické řešení problémů demonstrujících využití základních nástrojů funkční genomiky.
- Metody hodnocení
- Ukončení kurzu formou kolokvia. Úspěšné zakončení je podmíněno včasným dodáním všech požadovaných protokolů a absolvováním závěrečného pohovoru.
- Navazující předměty
- Informace učitele
- Výuka předmětu "Bi7201c Základy genomiky, cvičení", proběhne v podzimním semestru 2009 blokově ve třech bězích (23.-27.11., 30.11.-4.12. a 7.-11.12. 2009). Na jednotlivé běhy budou vypsány seminární skupiny, do kterých se přihlašte tak, jak vám to bude časově lépe vyhovovat. NUTNOU podmínkou možnosti abslovovat cvičení je úspěšná zkouška z předmětu Bi7201 Základy genomiky (blíže viz stránky předmětu).
- Další komentáře
- Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá blokově.
- Statistika zápisu (podzim 2011 - akreditace, nejnovější)
- Permalink: https://is.muni.cz/predmet/sci/podzim2011-akreditace/Bi7201c