F9601 Optické studium jednotlivých molekul

Přírodovědecká fakulta
podzim 2014
Rozsah
2/1. 3 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
doc. RNDr. František Vácha, PhD. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Josef Humlíček, CSc.
Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: doc. Mgr. Karel Kubíček, PhD.
Dodavatelské pracoviště: Ústav fyziky kondenzovaných látek – Fyzikální sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
znalosti fyzikálních principů flourescence, fosforescence, struktury nukleových kyselin a proteinů
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Mateřské obory/plány
  • Biofyzika (program PřF, N-FY)
  • Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Aplikovaná biofyzika)
  • Biofyzika (program PřF, N-FY, směr Molekulární biofyzika)
Cíle předmětu
Cílem předmětu je seznámit studenty s principy studia (bio)molekul pomocí pokročilých spektroskopických a mikroskopických metod - FRET, UV/Vis, konfokální mikrospie, etc.
Osnova
  •   Teoretický úvod:
    vlastnosti světla, interakce světelného záření s hmotou, procesy absorpce a emise.
      Fyzikální principy detekce jednotlivých molekul:
    spektroskopie a mikroskopie (epi-fluorescenční, konfokální, v blízkém poli), zdroje světla, detekce a zpracování velmi slabého signálu, základy nízkoteplotních optických experimentů.
      Studium jednotlivých molekul při nízkých teplotách:
    molekulární fyzika, dynamika pevné matrice, nelineární a kvantová optika.
      Studium jednotlivých molekul při pokojových teplotách:
    měření dob života excitovaných stavů, kvantové skoky, polarizační spektroskopie, difuze molekul, chemické reakce, procesy přenosu náboje, Foersterův přenos excitační energie.
      Aplikace spektroskopie jednotlivých molekul v biofyzice, biochemii a molekulární biologii:
    enzymatické reakce, konformace proteinů, difuze molekul lipidů v membránách, funkce ATP-ázy, molekulární motory, interakce virů s buňkou, fotosyntetické systémy.
      Další jednočásticové metody v biologickém výzkumu:
    elektronová mikroskopie a jednočásticová analýza, AFM.
Literatura
  • JACKSON, John David. Classical electrodynamics. 2nd ed. New York, 1975, 848 s. ISBN 0-471-43132-X. info
Výukové metody
přednáška
Metody hodnocení
zkouška
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích podzim 2011, podzim 2011 - akreditace, jaro 2012 - akreditace, podzim 2012, podzim 2013, podzim 2015.