Bi7440 Vědecké výpočty v biologii a biomedicíně

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012
Rozsah
2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc. (přednášející)
Garance
doc. RNDr. Ladislav Dušek, Ph.D.
Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí - Chemická sekce - Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. RNDr. Jiří Hřebíček, CSc.
Dodavatelské pracoviště: Centrum pro výzkum toxických látek v prostředí - Chemická sekce - Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 10:00–11:50 IBA1,02023
Předpoklady
Absolvování předmětů - Bi3101 Úvod do matematického modelování - Bi1011 Aplikační software
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je otevřen studentům libovolného oboru.
Cíle předmětu
V kurzu studenti získají: - znalosti o současných trendech v oblasti vědeckých výpočtů a výpočetní vědy - znalosti pro využítí aplikačních software Maple, MATLAB a SPSS užívaných při vědeckých výpočtech v biologii - zkušenosti ve využití paralerních výpočtů a cloud computing při vědeckých výpočtech - zkušenosti z řešení praktických případových studií
Osnova
  • Základní terminologie (vědecké výpočty; paralelní výpočty; počítačová simulace; cloud computing; atd)
  • Vědecké výpočty a výpočetní věda (Vědecký přístup založený na pozorování: Pozorovací věda; Vědecký přístup založený na experimentech: Experimentální věda; Vědecký přístup založený na teorii: Teoretická věda; Vědecký přístup založený na vědeckých výpočtech: Výpočetní věda; Dva pohledy na výpočetní vědu a vědecké výpočty; Výpočetní simulace)
  • Stručná historie vědeckých výpočtů (Vývoj v zahraničí; Vývoj v České republice)
  • Vývoj a omezení vědeckých výpočtů (Výpočetní prostředí; Grafika ve vědeckých výpočtech; Chyby ve vědeckých výpočtech; Výpočetní náročnost)
  • Neurčitost a citlivost ve vědeckých výpočtech (Analýza neurčitosti; Zobrazovací metody a lokální analýza citlivosti; Globální analýza citlivosti)
  • Aplikační software pro vědecké výpočty (Vědecké výpočty s využitím Maple; Vědecké výpočty s využitím MATLABu; Vědecké výpočty s využitím SPSS)
  • Paralelní výpočty (Úvod; Paralelní výpočty v Maple; Paralelní výpočty v MATLABu)
  • Případové studie (Modelování šíření znečištění ve vodě; Modelování znečištění v ovzduší)
Literatura
    doporučená literatura
  • GANDER, Walter a Jiří HŘEBÍČEK. Solving Problems in Scientific Computing Using Maple and MATLAB. čtvrté. Heidelberg: Springer, 2004. 476 s. Mathematics. ISBN 3-540-21127-6. URL info
Výukové metody
Přednášky doplněné domácí prací a prezentacemi studentů
Metody hodnocení
Výuka přemětu v semestru týdně dle rozvrhu. V průběhu semestru jsou vyžadovány jednoduché domácí práce. Přemět je ukončen ročníkovou prací a ústní zkouškou.
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2005, podzim 2006, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014.

Relevantní odkazy 

Nahoru | Aktuální datum a čas: 24. 5. 2013 04:20, 21. (lichý) týden

Kontakty: istech(zavináč/atsign)fi(tečka/dot)muni(tečka/dot)cz, studijní odd., správci práv, is-technici, e-technici, IT podpora | Více o informačním systému