Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2024
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 19. 2. až Ne 26. 5. Po 11:00–12:50 D31/238
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 10/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2025
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biol.II
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2023
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 11:00–12:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 17/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2022
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučováno prezenčně.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 11:00–12:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 2/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2021
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 1. 3. až Pá 14. 5. Po 11:00–12:50 online_B5
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 2/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2020
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 11:00–12:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz || Bi5560 Základy statistiky pro biology
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R.
Výstupy z učení
Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2019
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 18. 2. až Pá 17. 5. St 12:00–13:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2018
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 14:00–15:50 B11/333
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2017
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 20. 2. až Po 22. 5. Po 15:00–16:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 1/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2016
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 11:00–12:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2015
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
St 13:00–14:50 D32/329
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
    povinná literatura
  • PEKÁR, Stano a Marek BRABEC. Moderní analýza biologických dat. 1. vyd. Praha: Scientia, 2009, x, 225. ISBN 9788086960449. info
    doporučená literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2014
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý druhý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2013
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Čt 10:00–11:50 BR4
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Rozvrh
Po 12:00–13:50 BR2
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován jednou za dva roky.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2010
Rozsah
0/2/1. 2 kr. (plus 1 za zk). Doporučované ukončení: zk. Jiná možná ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Studijní materiály
Předmět je vyučován naposledy.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2009
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2008
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
Ing. Marek Brabec, Ph.D. (přednášející), prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (zástupce)
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako jsou zobecněný lineární model a lineární smíšený model.
Osnova
  • 1) Úvod: Statistický software. Prostředí R. 2) Popisná statistika: Formát a druhy dat. Tabulková a grafická analýza. Momenty. 3) Experimentální design: Náhodný, Nested, Split-plot, Latinské čtverce. Pseudoreplikace. 4) Statistické modely. Základní typy rozložení. 5)Analýza dat z normálního rozložení 5) Analýza dat z gama rozložení 6) Analýza dat z Poissonova rozložení. 7) Analýza dat z negativně-binomického rozložení. 8) Analýza dat z binomického rozložení. 9) Analýza dat z binárního rozložení. 10) Analýza přežívání. 11) Smíšené modely: Transformace dat. Split-plot a nested design. Opakovaná pozorování.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2007
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. RNDr. Jaromír Vaňhara, CSc.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako jsou zobecněný lineární model a lineární smíšený model.
Osnova
  • 1) Úvod: Statistický software. Prostředí R. 2) Popisná statistika: Formát a druhy dat. Tabulková a grafická analýza. Momenty. 3) Experimentální design: Náhodný, Nested, Split-plot, Latinské čtverce. Pseudoreplikace. 4) Statistické modely. Základní typy rozložení. 5)Analýza dat z normálního rozložení 5) Analýza dat z gama rozložení 6) Analýza dat z Poissonova rozložení. 7) Analýza dat z negativně-binomického rozložení. 8) Analýza dat z binomického rozložení. 9) Analýza dat z binárního rozložení. 10) Analýza přežívání. 11) Smíšené modely: Transformace dat. Split-plot a nested design. Opakovaná pozorování.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat v systému SPSS

Přírodovědecká fakulta
podzim 2002
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D. (cvičící)
Garance
RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D.
Předpoklady
SOUHLAS || B5040 Biostatistika || Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
podzim 2005

Předmět se v období podzim 2005 nevypisuje.

Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jaromír Vaňhara, CSc.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
podzim 2004

Předmět se v období podzim 2004 nevypisuje.

Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (cvičící)
Garance
prof. RNDr. Jaromír Vaňhara, CSc.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat v systému SPSS

Přírodovědecká fakulta
podzim 2003

Předmět se v období podzim 2003 nevypisuje.

Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: z.
Vyučující
RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D. (cvičící)
Garance
RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: RNDr. Ondřej Komárek, Ph.D.
Předpoklady
SOUHLAS || B5040 Biostatistika || Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2012 - akreditace

Údaje z období jaro 2012 - akreditace se nezveřejňují

Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus 2 za zk). Ukončení: zk.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Dodavatelské pracoviště: Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 30 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/30, pouze zareg.: 0/30, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/30
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován každoročně.
Výuka probíhá každý druhý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2011 - akreditace
Rozsah
0/2/0. 2 kr. (plus ukončení). Ukončení: k.
Vyučující
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Ústav botaniky a zoologie – Biologická sekce – Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Základy biostatistiky, ovládání programu R (základní matematické operace a tvorba grafů).
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako je obecný lineární model a zobecněný lineární model v prostředí R. Na konci tohoto kurzu by student měl vědět jak správně analyzovat jednorozměrná data.
Osnova
  • 1) Úvod: Proč právě software R? 2) Popisná statistika: Statistické momenty. Tabulková a grafická analýza. 3) Experimentální design: znáhodněný, latinské čtverce, opakování, kontrola. 4) Statistické modely. Základní typy rozdělení. 5) Analýza dat z normálního rozdělení. 6) Analýza dat z lognormálního a gama rozdělění. 7) Analýza dat z Poissonova rozdělení. 8) Analýza dat z negativně-binomického rozdělení. 9) Analýza dat z binomického a Bernoulliho rozdělení.
Literatura
  • CRAWLEY, Michael J. Statistics : an introduction using R. Chichester: John Wiley & Sons, 2005, xiii, 327. ISBN 0470022973. info
Výukové metody
Teoretická příprava zahrnující domácí řešení příkladů
Metody hodnocení
Výuka je postavena na řešení konkrétních biologických příkladů. Zkoušení je průběžné - v podobě řešení domácích úkolů. Návštěva přednášek je nezbytná.
Navazující předměty
Další komentáře
Předmět je vyučován jednou za dva roky.
Výuka probíhá každý týden.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2008 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.

Bi7920 Zpracování biologických dat

Přírodovědecká fakulta
jaro 2008 - akreditace
Rozsah
0/2/0. 2 kr. Ukončení: zk.
Vyučující
Ing. Marek Brabec, Ph.D. (přednášející), prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (zástupce)
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D. (přednášející)
Garance
prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta
Kontaktní osoba: prof. Mgr. Stanislav Pekár, Ph.D.
Předpoklady
Bi5040 Biostatistika - základní kurz
Omezení zápisu do předmětu
Předmět je nabízen i studentům mimo mateřské obory.
Předmět si smí zapsat nejvýše 20 stud.
Momentální stav registrace a zápisu: zapsáno: 0/20, pouze zareg.: 0/20, pouze zareg. s předností (mateřské obory): 0/20
Jiné omezení: výuku zajišťují jednotlivé katedry biologické sekce, před zápisem je nutno kontaktovat jednotlivé vyučující z biologických kateder
Mateřské obory/plány
Cíle předmětu
Přednáška má za cíl naučit studenty analyzovat data použitím moderních jednorozměrných statistických metod, jako jsou zobecněný lineární model a lineární smíšený model.
Osnova
  • 1) Úvod: Statistický software. Prostředí R. 2) Popisná statistika: Formát a druhy dat. Tabulková a grafická analýza. Momenty. 3) Experimentální design: Náhodný, Nested, Split-plot, Latinské čtverce. Pseudoreplikace. 4) Statistické modely. Základní typy rozložení. 5)Analýza dat z normálního rozložení 5) Analýza dat z gama rozložení 6) Analýza dat z Poissonova rozložení. 7) Analýza dat z negativně-binomického rozložení. 8) Analýza dat z binomického rozložení. 9) Analýza dat z binárního rozložení. 10) Analýza přežívání. 11) Smíšené modely: Transformace dat. Split-plot a nested design. Opakovaná pozorování.
Další komentáře
Předmět je dovoleno ukončit i mimo zkouškové období.
Předmět je vyučován každoročně.
Nachází se v prerekvizitách jiných předmětů
Předmět je zařazen také v obdobích jaro 2011 - akreditace, podzim 2002, jaro 2007, jaro 2008, jaro 2009, jaro 2010, jaro 2011, jaro 2012, jaro 2012 - akreditace, jaro 2013, jaro 2014, jaro 2015, jaro 2016, jaro 2017, jaro 2018, jaro 2019, jaro 2020, jaro 2021, jaro 2022, jaro 2023, jaro 2024, jaro 2025.