MINIATLAS MIKROORGANISMŮ
Seřazení mikroorganismů podle abecedy
Zde uvedené taxonomické zařazení zpracovaných mikrobiálních druhů není úplné, jedná se pouze o náhled do taxonomického zařazení. Přesnější taxonomické zařazení je buď uvedeno přímo u jednotlivých hesel nebo je možné ho vyhledat v odborné taxonomické literatuře.
Doména: Bacteria
Oddělení: Gracilicutes
Sekce: Gramnegativní aerobní tyčky a koky
Čeleď: Pseudomonadaceae
Pseudomonas fluorescens
Burkholderia cepacia
Stenotrophomonas maltophilia
Čeleď: Čeleď: Comamonadaceae
Comamonas testosteroni
Čeleď: Moraxellaceae
Acinetobacter baumannii
Moraxella (B.) catarrhalis
Psychrobacter immobilis
Čeleď: Pasteurellaceae
Pasteurella multocida subsp. multocida
Čeleď: Neisseriaceae
Neisseria subflava
Čeleď: Alcaligenaceae
Alcaligenes faecalis
Čeleď: Flavobacteriaceae
Empedobacter brevis
Chryseobacterium meningosepticum
Myroides odoratus
Flavobacterium psychrophilum
Sekce: Gramnegativní fakultativně anaerobní tyčky
Čeleď: Enterobacteriaceae
Escherichia coli
Salmonella enterica ssp. enterica serovar enteritidis
Serratia marcescens
Proteus vulgaris
Providencia rettgeri
Citrobacter freundii
Enterobacter cloacae
Shigella flexneri
Yersinia enterocolitica
Čeleď: Vibrionaceae
Aeromonas hydrophila
Vibrio parahaemolyticus
Plesiomonas shigelloides
Ancylobacter aquaticus
Sphaerotilus natans
Caulobacter vibrioides
Thermus filiformis
Sekce: Anaerobní, gramnegativní rovné, zakřivené a spirálové
Bacteroides fragilis
Oddělení: Firmicutes
Sekce: Grampozitivní koky
Čeleď: Micrococcaceae
Micrococcus luteus
Kocuria rosea
Staphylococcus aureus ssp. aureus
Staphylococcus saprophyticus ssp. saprophyticus
Staphylococcus epidermidis
Macrococcus equipercicus
Planococcus citreus
Čeleď: Deinococcaceae
Deinococcus radiodurans
Čeleď: Streptococcaceae
Lactococcus lactis subsp. lactis
Lactococcus lactis subsp. cremoris
Streptococcus filant
Streptococcus pyogenes
Streptococcus thermophilus
Peptoniphilus asaccharolyticus
Čeleď: Enterococcaceae
Enterococcus faecalis
Enterococcus faecium
Sekce: Grampozitivní tyčinky a koky tvořící endospory
Čeleď: Bacillaceae
Bacillus cereus
Bacillus mycoides
Bacillus subtilis
Bacillus sphaericus
Brevibacillus laterosporus
Paenibacillus polymyxa
Sporosarcina ureae
Clostridium sporogenes
Sekce: Pravidelné nesporulující grampozitivní tyčky
Čeleď: Lactobacillaceae
Lactobacillus casei ssp.casei
Lactobacillus delbrueckii ssp. bulgaricus
Pediococcus acidilactici
Leuconostoc mesenteroides
Sekce: Nepravidelné nesporulující grampozitivní tyčky
Čeleď: Bifidobacteriaceae
Bifidobacterium bifidum
Bifidobacterium infantis
Čeleď: Brevibacteriaceae
Brevibacterium linens
Čeleď: Propionibacteriaceae
Propionibacterium freudenreuchii
Čeleď: Nocardiaceae
Arthrobacter crystallopoietes
Cellulomonas flavigena
Corynebacterium glutamicum
Mycobacterium phlei
Nocardia carnea
Rhodococcus erythropolis
Tsukamurella paurometabolla
Dermatophilus congolensis
Rothia mucilaginosa
Čeleď: Streptomycetaceae
Streptomyces griseus ssp. griseus
Spirosoma linguale
Leptothrix cholodnii
Ascomycotina:
Aureobasidium pululans
Debaryomyces hansenii
Debaryomyces polymorphus
Dipodascus magnusii
Kluyveromyces lactis
Kluyveromyces marxianus
Pichia anomala
Pichia fermentans
Pichia membranaefaciens
Saccharomyces cerevisiae
Saccharomycodes ludwigii
Schizosaccharomyces pombe
Torulaspora delbrueckii
Yarrowia lipolytica
Basidiomycotina:
Sporidiobolus salmonicolor
Deuteromycotina:
Candida globosa
Candida krusei
Candida rugosa
Candida tropicalis
Candida utilis
Geotrichum candidum
Rhodotorula glutinis
Rhodotorula rubra
Zygomycota:
Rhizopus stolonifer
Mycocladus ramosus
Mucor plumbeus
Ascomycota:
Monascus ruber
Byssochlamys nivea
Emericella nidulans
Eurotium amstelodami
Chaetomium globosum
Mitosporní houby (Deuteromycetes, Fungi imperfecti):
Acremonium murorum
Alternaria alternata
Aspergillus flavus
Aspergillus fumigatus
Aspergillus niger
Aspergillus versicolor
Botrytis cinerea
Chrysonilia sitophila
Cladosporium herbarum
Clonostachys rosea
Epicoccum nigrum
Fusarium culmorum
Paecilomyces variotii
Penicillium chrysogenum
Penicillium roqueforti
Phoma glomerata
Scopulariopsis brevicaulis
Stachybotrys chartarum
Trichoderma viride
Trichothecium roseum
Verticillium luteoalbum
Wallemia sebi