Přehled činnosti studenta DSP Chemie životního prostředí PřF MU – ak.r. 2016/17


Student (jméno a příjmení)

                                                                            Petra Babková

Školitel (jméno a příjmení)

                                                                    Mgr. Radka Chaloupková, Ph.D.

Konzultant (jméno a příjmení)

                                                                   prof. Mgr. Jiří Damborský, Dr.

Začátek studia (měsíc a rok)

                                                                             25. 7. 2014

Druh studia (nehodící se vymažte)

                                                                              prezenční


Shrnutí výsledků za uplynulý rok (max. 15 řádků)

-          Studentka pracovala na přípravě publikace popisující biochemickou charakterizaci
ancestrálních enzymů halogenalkandehalogenas, kterou publikovala v mezinárodním časopise
ChemBioChem (IF 2.706).

-          Současně studentka pokračovala v řešeních krystalových struktur dvou vybraných
ancestrálních enzymů a optimalizaci krystalizace pro zbylé dva předky halogenalkandehalogenas.

-          Mimo svůj klíčový projekt, se studentka podílela na objasnění mechanismu dimerizace u
ancestrálního enzymu halogenalkandehalogenasy a lucifierasy pomocí systému gelové permeační
chromatografie se čtyřmi typy detektorů a dále na přípravě mikro krystalů tohoto enzymu pro časově
rozlišenou krystalografii.

-          V neposlední řadě se studentka věnovala biochemické charakterizaci nových mutantních
variant enzymu LinB s uzavřenými a nově otevřenými vstupními tunely.


Zahraniční stáž během uplynulého roku (místo, datum zahájení a délka trvání stáže)

-          Stáž, příprava krystalů pro časově rozlišenou krystalografii (XFEL-DESY, Hamburg,
Německo, 10.10. - 19. 10. 2016)


Celková publikační činnost během studia

Počet recenzovaných článků v impaktovaném odborném periodiku (druh výsledku Jimp)

                                                                                                                                                 2

Počet konferenčních příspěvků (běžné postery a prezentace nevstupující do RIV)

                                                                                                                                                 4

Počet dalších výsledků - články, knihy, kapitoly v knize, články ve sborníku (≥2 str.), patenty*

                                                                                                                                                 -

Veřejná přednáška v anglickém jazyce (splněna nebo nesplněna - nehodící se vymažte)

                                                                                                                                                ano

 *druh výsledku B, C, D, P


Nejvýznamnější výsledky během studia (max. 5, u publikací uveďte IF, konference, ceny):

                                                 1

Získaní ocenění Brno Ph. D. talent 2014, pořádané v Brně Jihomoravským centrem pro mezinárodní
mobilitu.

                                                 2

Publikace: Jan Brezovsky^†, Petra Babkova^†, Oksana Degtjarik, Andrea Fortova, Artur Gora, Iuliia
Iermak, Pavlina Rezacova, Pavel Dvorak, Ivana Kuta Smatanova, Zbynek Prokop, Radka Chaloupkova, and
Jiri Damborsky, Engineering a de Novo Transport Tunnel, ACS Catal., 2016, 6 (11), pp 7597–7610 (IF
= 9.307).

^

^†Sdílený první autor

                                                 3

Publikace: Petra Babkova, Eva Sebestova, Jan Brezovsky, Radka Chaloupkova, Jiri Damborsky,
Ancestral haloalkane dehalogenases show robustness and unique substrate specificity, ChemBioChem,
2017, DOI: 10.1002/cbic.201700197 (IF 2.706).

                                                 4

International Union Crystallography Poster Competition Prize and IUCr Journals Student Poster Prize
at the International School on Biological Crystallization (ISBC), Granada, Španělsko, 28.5. – 2.6.
2017.

                                                 5


Nepřekračujte celkovou délku formuláře 1 str.