Typická Java EE aplikace

klientské webové rozhraní,

to komunikuje se servlety a stránkami JSP, JSF...

aplikační logika realizovaná Session Beans (mezi tím příp. fasáda)

komponenty Entity Beans s perzistencí zajištěnou relační databází.

Namísto EJB se dnes často používá objektově-relační mapování běžných (POJO) objektů,

pro řízení na vyšších vrstvách se využívají webové rámce.