Demonstrativní obrázky z analýzy SRR074262
Obr. 2 Quality scores across all bases bez trimmingu
Trimming sekvence SRR074262 na Obr. 2 zobrazuje kvalitativní skóre
před trimingem, kdy od délky readu 18 již kvalita není příliš dobrá. Na Obr. 1 je zobrazena sekvence, která prošla TrimGalore!, zde je vidět, že se
kvalitativní skore vylepšilo v readech od délky 18 výrazně a v předchozích také.
Obr. 1 Quality scores across all bases po trimmingu TrimGalore
Obr. 3Distribuce CG přes všechny sekvence po trimmingu TrimGalore!
Obr. 4 Distribuce CG přes všechny sekvence bez trimmingu
Distribuce CG v sekvenci bez trimmingu (Obr. 4) vykazuje v oblasti 48-52 délky readu extrémní počet oproti předpokladu normálního rozdělení.
Toto rozdělení TrimGalore! přiblížil očekávané distribuci (Obr. 3).