Elektroforetické metody Petr Breinek Logo MU.jpg Elektroforéza-I 2012 Elektroforéza je analytická metoda založená na rozdílné pohyblivosti nabitých částic v elektrickém poli v tekutém mediu. Pohyblivost částic závisí na: • velikosti náboje • velikosti a tvaru částice • hmotnosti částice • vlastnostech prostředí Bílkoviny: elektrický náboj Elfo náboj bílkovin.jpg Při pH = 8,6 putují bílkoviny od katody (-) k anodě (+) 1.Volná (Arne W. Tiselius – Nobelova cena;1948) Vodné roztoky (elektrolyty) Částice putují k elektrodě s opačnou polaritou Problém: vznikající teplo,…. Rozdělení elektroforetických technik apparatus.jpg 225px-Arne_Tiselius.jpg 1.Volná 2.Zónová na nosičích 3. Izoelektrická fokuzace (IEF) SDS gelová elektroforéza Dvojrozměrná (two-dimensional, 2-DE)) Kapilární elektroforéza (CE) Izotachoforéza 1. Rozdělení elektroforetických technik Nosiče -Papír -Acetátcelulozová folie -Gel Agarózový gel Škrobový gel PAGE - SDS Polyakrylamidový gel (PAGE,polyacrylamide gel electrophoresis) sítový efekt; endoosmóza,.. - - Postup (zjednodušeně): -Aplikace vzorků -Dělení -Fixace a barvení -Odbarvení -Sušení -Vyhodnocení -pH = 8,6 Elektroforéza bílkovin v krevním séru Automatický elektroforetický přístroj Hydrasys (Sebia,Francie) Vyhodnocení elektroforeogramů image002.gif v vizuální hodnocení v denzitometricky v skener v …….. IZOENZYMY 15 ISO LD LIPOPROTEINY IMMUNOFIXACE 4 IF PAGE SDS elektroforéza Elfo SDS PAGE.jpg SDS = dodecylsíran sodný Zrušení disulfidických vazeb, bílkoviny získají stejný elektrický náboj, pohyblivost závisí na molekulové hmotnosti PROTEINURIE 5 PROTEINURIE • • IEF je technika rozdělující bílkoviny podle jejich izoelektrických bodů (pI) • •Dělení probíhá v gelu s lineárním pH gradientem vytvořeným směsí amfolytů (100-200), každý amfolyt má jiný izoelektrický bod • Izoelektrická fokuzace (IEF) • Příklad využití IEF •Stanovení oligoklonálních pásů IgG v likvoru • •Bez zahuštění likvoru •Současně se analyzuje sérum a likvor (ve stejné koncentraci) •Imunochemická detekce a barvení • • • • Stanovení oligoklonálních IgG pásů v likvoru a v krevním séru metodou izoelektrické fokuzace s následným imunofixačním barvením umožňuje kvalitativní vyjádření intratekální syntézy IgG. 9 IEF a pasy3 Dvojrozměrná elektroforéza (2-DE) üNejdříve jsou proteiny rozděleny podle svých izoelektrických bodů (IEF) üa následně se proteiny dělí v závislosti na jejich molekulové hmotnosti (SDS-PAGE) Použití: Separace komplexních směsí bílkovin (proteomika) Až několik tisíc proteinových skvrn! a.jpg Kapilární elektroforéza ØJe technika založená na principu elektrokinetické separace v kapiláře malého vnitřního průměru (10 až100 µm), dlouhé 20 až 200 cm; naplněné elektrolytem při vysokém napětí (7 700 V) ØRůzné provedení (gel, IEF, volná,…) ØVýsledkem je rychlá a velice účinná separace molekul s výborným rozlišením. ØRoztok putuje kapilárou najednou PRINCIP KAPILÁRNÍ ELEKTROFORÉZY DETEKTOR Migrace Kontrolovaná teplota Pufr Pufr Zdroj vysokého napětí Kladný náboj z pufru Záporný náboj na stěně capiláry Elektro-osmotický tok (EOT) je mnohem silnější než elektrické pole. Ve výsledném efektu, jsou všechny bílkoviny unášeny ke katodickému konci kapiláry. Anoda + síla EOT Síla electrického pole Migrace bílkovin DETEKCE NASÁTÍ VZORKU CAPILLARYS 20