Klinická mikrobiologie Jana Juránková OKM FN Brno Septické stavy •Sepse X Bakteriémie, virémie, fungémie • –Bakteriémie, virémie, fungémie: přítomnost bakterií, virů nebo hub v krevním oběhu –Sepse: těžké onemocnění, reakce makroorganismu na přítomnost mikroorganismů v krevním oběhu Diagnostika sepse •Klinické příznaky: zvýšení i snížení teploty, zvýšení dechové frekvence, zrychlení tepu, zmatenost •Hematologické příznaky:zvýšení i snížení počtu leukocytů, snížení počtu trombocytů •Biochemické příznaky: hemokoagulační poruchy, metabolicko-respirační acidosa, zvýšení CRP Diagnostika sepse •Bakteriologická diagnostika: pozitivní hemokultivace • BactAlert 1 lahvičky Sepse •Primární – patogen jen v krevním řečišti – po i.v.aplikaci léčiv, drog •Sekundární – v těle je primární ložisko a sekundárně se patogeny vyplaví do krevního oběhu •Katetrové – původce pochází z kolonizace zavedeného cévního katetru Původci sepse •Ranné sepse – Streptococcus pyogenes, Staphylococcus aureus •Urosepse – Escherichia coli •Intraabdominální sepse – enterobakterie, anaeroby •Nosokomiální sepse – Pseudomonas aeruginosa, enterobakterie s produkcí beta-laktamáz, kvasinky, Staphylococcus koaguláza negativní Infekce centrálního nervového systému •Zdroj –Hematogenní – meningokoky –Per continuitatem – pneumokoky, hemofily –Podél nervů – virus herpes simplex, virus vztekliny –Přímo – při poranění hlavy • Meningitidy •Meningitidy aseptické – virové –Enteroviry, virus herpes – simplex, varicella-zoster, virus klíšťové menigoencefalitidy •Meningitidy purulentní –Streptococcus agalactiae, Haemophilus influenzae, Neisseria meningitidis, Streptococcus pneumoniae, Listeria monocytogenes • – Meningitidy •Chronické meningitidy –Mycobycterium tuberculosis (bazilární meningitida), Cryptococcus neoformans Encefalitidy •Akutní encefalitidy virové etiologie • –Virus klíšťové encefalitidy, virus herpes simplex, enteroviry, virus parotitidy Mozkové abscesy •Akutní – bakteriální –Smíšená aerobní a anaerobní flóra, Staphylococcus aureus, nokardie •Chronické – bakteriální, mykotické, parazitární –Mycobacterium tuberculosis, Nocardia asteroides –Cryptococcus neoformans, Aspergillus spp. –Cysticerkosa (Taenia solium), echinokokosa – Respirační infekce •Infekce nosu a nosohltanu –Rýma, zánět nosohltanu •Rhinoviry,koronaviry •Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus,Streptococcus pneumoniae •Nosičství •Neisseria meningitidis Infekce dutiny ústní a mandlí •Virové –Rhinoviry, koronaviry, adenoviry, EB virová tonsilitida, herpangína •Bakteriální : angína –Streptococcus pyogenes, Corynebacterium diphteriae, anaerobní Plautova-Vincentova •Kvasinkové –soor Infekce středního ucha a vedlejších nosních dutin •Akutní zánět středního ucha a dutin –Respirační viry –bakteriální: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Branhamella catharralis, Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Bacteroides spp., Peptostreptococcus spp. Infekce středního ucha a vedlejších nosních dutin •Chronické • –bakteriální: Pseudomonas aeruginosa, Proteus mirabilis, peptostreptokoky Infekce příklopky hrtanové •Epiglottitis • –Haemophilus influenzae typ b Infekce laryngu a trachey •Virové –Viry influenzy, parainfluenzy, RS virus •Chlamydia pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae •Bakteriální –Corynebacterium diphteriae, ostatní infekce sekundární po virech Infekce bronchů •Virové –Viry chřipky, adenoviry, RS virus •Bakteriální –primární: Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae, Bordetella pertussis –Sekundární: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Branhamella catharralis, Staphylococcus aureus, Pseudomonas aeruginosa, Burkholderia cepacia Infekce plic •Akutní zánět –Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Staphylococcus aureus, Branhamella catarrhalis, Klebsiella pneumoniae –Mycoplasma pneumoniae, Chlamydia pneumoniae –Chřipka A,B, RS virus Infekce plic u oslabených jedinců •Enterobakterie – Klebsiella pneumoniae •Legionella pneumophila •Pneumocystis jirovecii •Nocardia asteroides •Aspergillus spp. •Cytomegalovirus • Pneumonie chronické •Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium bovis • •Aspirační pneumonie - anaeroby • Infekce ran, kostí a měkkých tkání • Infekce ran •Povrchové zranění – Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes • •Anaerobní traumatosy – Clostridium perfringens, Clostridium septicum, Clostridium tetani (toxin) Infekce operačních ran •Infekce endogenní – z okolí rány: • Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, čeleď Enterobacteriacae, Bacteroides sp. Infekce po kontaktu se zvířetem •Pokousání - ústní mikroflora zvířete –Stapfylococcus aureus, Pasteurella multocida, Capnocytophaga canimorsus •Kontakt bez kousnutí – Francisella tularensis, Erysipelothrix rhusiopathiae, Bartonella henselae Osteomyelitidy •Akutní: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes, Haemophilus influenzae, Salmonella spp. •Chronická: Pseudomonas aeruginosa, enterobakterie, Mycobacterium tuberculosis Infekce kůže •Bakteriální –Impetigo: Staphylococcus aureus, Streptococcus pyogenes –Folliculitis : Staphylococcus aureus –Acne vulgaris: Propionibacterium acnes –Erysipel: Streptococcus pyogenes – Bakteriální infekce projevující se na kůži •Produkce toxinů způsobujících vyrážky: –Spála – Streptococcus pyogenes –Syndrom toxického šoku – Staphylococcus aureus –Neisseria meningitidis –Erytema chronicum migrans – Borrelia spp. • Virová onemocnění kůže •Exantematické virózy –Spalničky, zarděnky, erytema infectiosum (5.dětská nemoc, parvovirus B19), exantema subitum (HHV 6) •Vesikulární exantém (puchýřky) –Herpesviry, poxviry •Bradavice –Papillomaviry •Petechie –Hemoragické horečky (Lassa, Ebola, u nás Hantaan) Kožní mykosy •Candida albicans – intertrigo, vulvovaginitida, soor • •Dermatofyta – tinea pedis (Trichophyton rubrum) Parazitární onemocnění kůže •Svrab • •Pedikulóza – zavšivení • •Poštípání členovci Infekční průjmy •Bakteriální –Salmonely, shigely, kampylobaktery, yersinie –Enterotoxická, enteroinvazivní enterohemoragická Eschericha coli –Clostridium difficile –Aeomonas spp., Plesiomonas shigeloides – Infekční průjmy •Virové –Rotaviry, adenoviry, kaliciviry (Norwalk), astroviry •Parazitární –Giardia lamblia, Entamoeba hystolytica, Cryptosporidium parvum Otravy z potravin •Bakterie vylučující toxiny • –Staphylococcus aureus, Bacillus cereus, Clostridium botulinum Močové infekce •Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Streptococcus agalactiae •Chlamydia trachomatis, Ureaplasma urealyticum, Mycoplasma hominis •Candida albicans •Trichomonas vaginalis Sexuálně přenosné infekce •Bakteriální –Neisseria gonorrhoeae, Treponema pallidum,(Haemophilus ducrey, Calymmatobacterium granulomatis •Chlamydia trachomatis •Virové –HIV, HSV 2, papilomaviry, molluscum contagiosum, Hepadnavirus (hepatitida B) •Parazitární –Trichomonas vaginalis, ektoparazité • Infekce v souvislosti s těhotenstvím •Virové infekce se závažným průběhem –Hepatitida E, chřipka •Bakteriální infekce –Streptococcus pyogenes (porod či potrat, horečka omladnic), Staphylococcus aureus, Streptococcus agalactiae (mastitidy) Infekce plodu a novorozence •Vrozené –Virové: zarděnky, cytomegalovirus,varicella-zoster, HIV –Bakteriální: syfilis, listeriosa –Parazitární: toxoplasmosa Infekce plodu a novorozence •Perinatální a neonatální –Bakteriální: Neisseria gonorrhoeae, Streptococcus agalactiae, Listeria monocytogenes –Chlamydia trachomatis –Virové: hepatitida B, HIV, Nosokomiální infekce •Nákazy získané v souvislosti s pobytem ve zdravotnickém zařízení •Endogenní – infekce vlastní mikroflórou •Exogenní – infekce zavlečená zvenčí (ruce personálu) Nosokomiální infekce •Bakteriální –Bakterie citlivé na ATB –Bakterie rezistentní na ATB •Selekce rezistentních kmenů působením ATB na citlivé kmeny –MRSA, VRE, Pseudomonas aeruginosa, Stenotrophomonas maltophilia •Indukce tvorby betalaktamáz působením ATB –Širokospektré batalaktamázy, induktivní betalaktamázy – Nosokomiální infekce •Virové –Hepatitidy, rotaviry, adenoviry •Parazitární –Roupy, svrab