Pokročilé metody analýzy dat v neurovědách
RNDr. Eva Koriťáková, Ph.D.
Pokročilé metody analýzy dat v neurovědách
Chapter contains:
1
Study text
Chapter contains:
1
PDF
4
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 25/2/2019 to 3/3/2019.
Chapter contains:
1
PDF
1
Study text
Teacher recommends to study from 22/4/2019 to 28/4/2019.
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 11/3/2019 to 17/3/2019.
Chapter contains:
1
PDF
4
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 18/3/2019 to 24/3/2019.
Chapter contains:
1
PDF
3
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 25/3/2019 to 31/3/2019.
Chapter contains:
1
PDF
1
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 1/4/2019 to 7/4/2019.
Chapter contains:
1
PDF
6
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 8/4/2019 to 14/4/2019.
Chapter contains:
1
PDF
6
Study Materials
1
Study text
Teacher recommends to study from 15/4/2019 to 21/4/2019.

Úvodní informace

Cíle kurzu
Cílem předmětu je prohloubit Vaše teoretické a praktické znalosti analýzy dat o pochopení a osvojení principů pokročilých vícerozměrných metod analýzy dat s ohledem na specifika datových souborů a výpočtů z oblasti neurovědního výzkumu. Důraz bude kladen především na správnou aplikaci těchto metod v praxi a na interpretaci dosažených výsledků. Probíraná teorie vždy bude následována praktickými příklady s využitím software SPSS, STATISTICA, R či MATLAB, které jsou na Masarykově univerzitě volně dostupné.

Přínos kurzu

  • Orientace v principech vícerozměrné analýzy dat s důrazem na zpracování medicínských dat, a to především z neurovědního výzkumu.
  • Schopnost zvolit a aplikovat adekvátní metodu analýzy a klasifikace dat k dosažení požadovaných výsledků.
  • Schopnost správné interpretace dosažených výsledků včetně vyhodnocení úspěšnosti klasifikace.
  • Schopnost praktické analýzy dat v software MATLAB, STATISTICA, R či SPSS (studenti a zaměstnanci MU mohou tento software získat zde: https://inet.muni.cz/app/soft/licence).

Organizace výuky
Výuka bude probíhat v tříhodinových blocích v průběhu 8 týdnů každou středu od 27. 2. 2019 do 24. 4. 2019 kromě 6. 3.
vždy od 15:00 do 18:00 v počítačové učebně IBA LF MU na Kamenici 126/3.

Požadavky k ukončení kurzu
Kurz je ukončen kolokviem sestávajícím se z analýzy praktických příkladů na počítači. K úspěšnému ukončení je nutné porozumět probíraným tématům a umět aplikovat vícerozměrné statistické metody při analýze reálných datových souborů.

Kontakt
koritakova@iba.muni.cz


Poděkování
Příprava výukových materiálů předmětu „DSAN02 Pokročilé metody analýzy dat v neurovědách“ byla finančně podporována prostředky projektu FRMU č. MUNI/FR/0260/2014 „Pokročilé metody analýzy dat v neurovědách jako nový předmět na LF MU“.

Blok 1 - Úvod do pokročilé vícerozměrné analýzy dat

V této přednášce se seznámíte s:

  • významem, cíli a příklady využití vícerozměrné analýzy dat
  • vícerozměrnými daty, jejich popisem a vizualizací
  • předzpracováním dat

Blok 2 - Vícerozměrné statistické testy a rozložení

V této přednášce se seznámíte s:

  • vícerozměrnými charakteristikami
  • vícerozměrným normálním rozdělením
  • vícerozměrným t-testem
  • vícerozměrnou analýzou rozptylu
  • transformacemi a jinými úpravami vícerozměrných dat

Blok 3 - Podobnosti a vzdálenosti ve vícerozměrném prostoru

V této přednášce se seznámíte s:

  • úvodem do metrik podobností a vzdáleností
  • metrikami pro určení vzdálenosti mezi dvěma objekty
  • metrikami pro určení podobnosti mezi dvěma objekty
  • metrikami pro určení vzdálenosti mezi dvěma skupinami objektů
  • asociačními maticemi

Blok 4 - Shluková analýza

V této přednášce se seznámíte s:

  • podstatou a cíli shlukové analýzy dat
  • shlukovou analýzou hierarchickou – hierarchickým aglomerativním shlukováním
  • shlukovou analýzou hierarchickou – hierarchickým divizivním shlukováním
  • shlukovou analýzou nehierarchickou
  • identifikací optimálního počtu shluků

Blok 5 - Ordinační analýzy I

V této přednášce se seznámíte s:

  • principy redukce dimenzionality dat
  • selekcí a extrakcí proměnných
  • analýzou hlavních komponent (PCA)
  • faktorovou analýzou (FA)
Error: The referenced object does not exist or you do not have the right to read.
https://is.muni.cz/el/med/jaro2019/DSAN02/um/53004119/FA_ukazka.R
Error: The referenced object does not exist or you do not have the right to read.
https://is.muni.cz/el/med/jaro2019/DSAN02/um/53004119/FA_data.xlsx

Blok 6 - Ordinační analýzy II

V této přednášce se seznámíte s:

  • analýzou nezávislých komponent (ICA)
  • korespondenční analýzou (CA)
  • vícerozměrným škálováním (MDS)
  • redundanční analýzou (RDA)
  • kanonickou korelační analýzou (CCorA)

Blok 7 - Klasifikace I

V této přednášce se seznámíte s:

  • úvodem do klasifikace dat
  • klasifikací pomocí diskriminačních funkcí:
    • lineárními diskriminačními funkcemi
    • Bayesovým klasifikátorem
  • klasifikací pomocí minimální vzdálenosti
  • klasifikací pomocí hranic:
    • Fisherovou lineární diskriminační analýzou

Blok 8 - Klasifikace II

V této přednášce se seznámíte s:

  • klasifikací pomocí hranic - metodou podpůrných vektorů (SVM)
  • dalšími metodami klasifikace
  • hodnocením úspěšnosti klasifikace a srovnáním klasifikátorů