„Next generation sequencing“ v onkologii Doc. MUDr. Mgr. Marek Mraz, PhD IHOK FN Brno and CEITEC MU zavedení NGS Current (2015) ~1 days ~$1000 30-50X Courtesy of Dr. Kurzrock DŮLEŽITÉ!!! POOLED Analysis Meta-analysis ARMS type R Rate (%) PFS (Mos) OS (Mos) RR (%) PFS (Mos) OS (Mos) Non-personalized targeted 4 2.6 8.7 7.5 2.5 8.3 Cytotoxic 12 3.3 9.4 16.1 3.3 9.3 Personalized targeted 30 6.9 15.9 31.3 6.1 13.7 Horší odpověď Lepší odpověď Meta Analýza 32,149 pacientů Z Fáze II klin. studií Schwaederle……Kurzrock, JCO, 2015 Courtesy of Dr. Kurzrock This observation suggests that impacting aberrant pathways by directly affecting the cognate target, or by an effect mediated downstream of it, can both be effective Indeed, non-personalized targeted arms had very poor outcomes compared to either personalized targeted therapy or to cytotoxics, with median RR being 4%, 30% and 11.9%; median PFS, 2.6, 6.9, and 3.3 měsíc; and OS, 8.7, 15.9, and 9.4 měsíc (all P≤0.05) Taken together, the data suggests that the worst outcomes were associated with use of targeted agents in a non-personalized strategy. Targeted personalized therapy resulted in the best outcomes. Center for Personalized Cancer Therapy at Moores Cancer Center Developmental Therapeutics Phase I Trials/Immunotherapy San Diego Biotech, Pharma, Genomics UCSD Super Computer Center Discovery to Bedside Enabling Program Rare Tumor Clinic Molecular Tumor Board Adolescent and Young Adult Clinic Molecular Pathway Clinic Financial Aid Laboratory Processing UCSD, Salk, Scripps, Sanford-Burnham Hereditory Cancer PredispositonGenetic Counselling Courtesy of Dr. Kurzrock > Molecular Tumor Board •Multidisciplinární diskuze •Molekularní profilování (clinical-grade) (N ~ 8000) •Cílená léčba • • Courtesy of Dr. Kurzrock komprehensivní profilování Tumor PREDICT/ IPREDICT Clinical Trial Comprehensive molecular profiling: •Next-Generation DNA Sequencing •Protein analysis •Immune signature analysis •Liquid biopsy (cancer DNA detection from blood ) “MATCH” the therapy based on the profiling. Personalized/Precision Medicine approach. Courtesy of Dr. Kurzrock • • Lék-Centrická studie (Tradiční) Lék/ kombiance A Pacient 1 Pacient 2 Pacient 3 Strategie: Najít sdílenou vlastnost mezi pacienty (např. druh nádoru nebo mol. aberaci) a všem dát stejnou léčbu Courtesy of Dr. Kurzrock • • • • Pacient-Centrické studie (N=jeden) Pacient 1 Aberace A, B, C Pacient 2 Aberace A, E, F Strategie: Molekulární párování každého pacienta s kombinací léčiv Lék A Lék A Lék F Lék B Lék E Drug C Courtesy of Dr. Kurzrock Liquid biopsie •Časná detekce rezistence • •Časná detekce odpovědi • •Predikce odpovědi na immunoterapii Checkpoint inhibitory „Boj“ rovného s rovným •4% odpovědí u nádorů s málo mutacemi •26% odpovědí u nádorů se středně mutacemi •45% odpovědí u nádorů s hodně mutacemi •67% odpovědí u nádorů s opravdu hodně mutacemi • • Čím více mutovaný nádor tím lepší odpověď na immunoterapii Mutanomem-cílená Immunotherapie Spojení mezi genomikou a immuno terapií Courtesy of Dr. Kurzrock Přečtětě si tento článek..je to krásné a srozumitelné čtení https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5822744/ Děkuji za pozornost Marek Mraz CEITEC MU and FN Brno Marek.mraz@email.cz • •