Základy radiochemie (radiobiologie I) – IZMB-6 Prof. RNDr. V. Mornstein, CSc. Biofyzikální ústav Lékařské fakulty Masarykovy university, Brno Tato přednáška se opírá převážně o monografii E. L. Alpen: Radiation Biophysics (1998) a internetové materiály http://www.radiochemistry.org/courses/images/courses_img02.jpg Ionizační a excitační procesy •Většina energie rozptýleného (sekundárního) záření je nesena elektrony, které ionizují prostředí.Tyto vysokoenergetické elektrony vznikly (v radiologických souvislostech) fotoelektrickým jevem a Comptonovým rozptylem záření rentgenového i gama. •Pro nás podstatným prostředím je voda, která tvoří u dospělých kolem 60% váhy těla. •Tzv. první ionizační potenciál vody je 12,6 eV. •Pro srovnání, elektrony o energii 20 keV ztrácejí při interakci s vodou s největší pravděpodobností kvantum energie 22 eV (průměrná velikost ztráty je 60 eV (viz obr.) •Ztráty energie mají v každém případě diskrétní hodnoty. Alpen-6-1-ztráty energie Histogram ztrát energie elektronu při jeho interakcích s látkou (elektrony o relativně nízké energii ve vodě) Dost podobně tomu je s průměrným a nejpravděpodobnějším platem!!!!! Ionizační a excitační procesy •Podle vzhledu ionizačních stop získaných pomocí bublinových komor a množství „předané = ztracené“ energie se tyto události dělí na • –Ostruhy (Spurs) – 6 – 100 eV – jen několik iontů –Kuličky, bloby (Blobs) – 100 – 500 eV – desítky iontů –Krátké stopy (Short tracks) – 500 – 5000 eV – stovky iontů – •Elektron o energii 1 MeV, předává asi 65% energie v „ostruhách“, 15% v „blobech“ a 20% v „krátkých stopách“ (což jsou vlastně ionizační stopy terciárních elektronů) • fig 8.jpg (19526 bytes) http://www.photobiology.com/educational/len/part2.htm Větvení stopy Ionizační a excitační procesy •Výsledek předání energie: –ionizace – 1 nebo více elektronů vyraženo z molekuly –excitace –superexcitace (přijatá energie je vyšší než ionizační, avšak elektron zůstává vázán k původnímu jádru) •Ve všech těchto případech je důsledkem nestabilita, která může vést ke změnám struktury molekuly nebo mezimolekulovým interakcím. •Jednotlivé „ostruhy“, tj, nejmenší skupiny ionizačních událostí, jsou od sebe vzdáleny v průměru 400 nm při vlastní velikosti cca 1nm, vodíkový radikál je schopen difundovat do vzdálenosti v průměru 180 nm, dokud nezanikne. •Důsledek: interakce (rekombinace) volných radikálů vytvářených v různých blobech, ostruhách a krátkých stopách prakticky není možná (pravděpodobná). • Radiochemie vody •Primární produkty radiolýzy vody, které se objevují v čase od 10-16 do 10-12 s: –Excitovaná molekula vody H2O* –Radikály H∙ a OH∙ (důsledek disociace excitované molekuly) –H20+ a e- (důsledek přímé ionizace nárazem) • •Navazující procesy: –H2O+ → H+ + OH∙ –e- + H2O → H2O- –e- + H+ → H∙ –e- + H20 → e-aq (solvatovaný, vodný, hydratovaný elektron, doba života přibližně 0,2 ms) •a také • H2O- → H∙ + OH- http://www.nature.com/nchem/journal/v2/n4/images/nchem.604-f1.jpg Vazba solvatovaného elektronu obklopeného šesti molekulami vody má 3,3 eV, na povrchu vody jen 1,6 eV – měřeno na základě energie dopadajícím světlem vyražených elektronů!! Schéma radiolýzy vody Alpen-6-2-radiolýza vody Pozor, pravděpodobnost obou procesů není stejná – závisí na energii elektronů a dalších faktorech Radiochemie vody •Produkty radiolýzy vody tedy jsou: •H∙, OH∙, e-aq, H+, OH- •Ionty H+ a OH- však nemají z hlediska působení na živou hmotu valný význam, protože jsou ve vodě a vodných roztocích všudypřítomné. •Část volných radikálů i iontů rekombinuje (spojuje se do původních celků). •Následuje chemická fáze, popsatelná souhrnnou rovnicí: •H2O (ozářená) → H∙, e-aq, OH∙, H30+, H2, OH-, HO2∙, O2, O2-, HO2-, H2O2 Superoxidový anion "hydroperoxyl" nebo "perhydroxy radikál" Superoxid vodíku Hodnota G •Hodnota G – měřítko chemického výtěžku. •G je počet molekul vytvořených nebo rozpadlých v důsledku předání 100 eV energie sekundárního elektronu. •Vybrané hodnoty G při neutrálním pH: •H∙ 0,6 •e-aq 2,6 •OH∙ 2,6 •H2 0,45 •H2O2 0,75 •Oxidace iontů železnatých (Fe2+) na železité (Fe3+). Využití pro dosimetrické účely je omezené (což platí i pro jiné chemické dozimetry), protože hodnota G silně závisí na LET. Jde však o cenný model interakce volných radikálů s jejich lapači. Jde o následující systém reakcí: •H∙ + O2 → HO2∙ 2 •HO2∙ + Fe2+ → HO2- + Fe3+ 3 •HO2- + H+ → H2O2 4 •OH∙ + Fe2+ → OH- + Fe3+ 5 •H2O2 + Fe2+ → OH- + Fe3+ +OH∙ 6 •H∙ + H2O → OH∙ + H2 7 Frickeův dozimetr jako model radiochemické reakce Frickeův dozimetr jako model radiochemické reakce •Reakce (7) nastává jen za absence kyslíku •Prostudování těchto reakcí vede k závěru, že za přítomnosti kyslíku a v kyselém prostředí každý vodíkový radikál způsobí oxidaci tří železnatých iontů. –V reakci (2) vzniká superoxidový radikál HO2∙, který následně oxiduje první železnatý iont. –Ze superoxidového aniontu a vodíkového iontu vzniká peroxid vodíku, který pak oxiduje druhý iont Fe2+. –V této reakci (6) vzniklý hydroxylový radikál pak oxiduje třetí iont Fe2+ (5). •Je dále zjevné, že jiným způsobem (radiolyticky) vzniklý H2O2 sám poskytuje 2 ionty Fe3+ (reakce 5,6). Radiolyticky vzniklý radikál OH∙ (reakce (1), která není v předchozím přehledu reakcí uvedena) stvoří v reakci (5) další iont Fe3+. Frickeův dozimetr jako model radiochemické reakce • •Pro celkový výtěžek Fe3+ pak můžeme napsat: •G(Fe3+) = 2G(H2O2) + 3G(H∙) + G(OH∙) • •Za nepřístupu kyslíku analogicky •G(Fe3+) = 2G(H2O2) + G(H∙) + G(OH∙) • Frickeův dozimetr jako model radiochemické reakce •Pro g-záření Co-60 o nízkém LET jsou platné hodnoty: –G(H2O2) = 0,75 –G(H) = 3,65 –G(OH) = 3,15 •Takže s ohledem na •G(Fe3+) = 2G(H2O2) + 3G(H∙) + G(OH∙), •je G(Fe3+) rovno 15,6 • •a za nepřítomnosti kyslíku analogicky 8,30. Tyto hodnoty jsou ovšem nižší než jejich teoretický odhad, protože část energie záření nevyvolá změny lapače radikálů (železnatých iontů nebo jiných redukujících molekul). •Za předpokladu spotřeby 17 eV na vytvoření jednoho páru H∙ a OH∙ by hodnota G měla vyjít pro Fe3+ 23,53. Přímý a nepřímý účinek •Přímý účinek: místo molekul vody jsou zasahovány přímo biologicky významné molekuly, zejména DNA. Počet nepoškozených molekul N po působení dávky D je dán původním počtem nepoškozených molekul N0: Kde k je tzv. inaktivační konstanta s jednotkou Gy-1, jejíž převrácená hodnota udává dávku (D = 1/k), která sníží počet nepoškozených molekul faktorem 1/e, tj. na 37% původní hodnoty (N = N0.e-1). Tato dávka se označuje též D0 nebo D37. Úvahy platí, pokud jediný zásah inaktivuje biomolekulu. Přímý a nepřímý účinek •Zejména v souvislosti s tzv. zásahovou teorií má velký význam pojem terče. Tímto terčem myslíme zpravidla nějakou molekulu. Existuje vztah mezi molekulovou hmotností a velikostí terče (v.t.) - lze považovat molekulovou hmotnost přímo za velikost terče (při inaktivaci jediným zásahem). •D37 považujeme za inaktivační dávku. Je-li experimentálně zjištěná hodnota průměrného množství energie předané při jedné interakční události 75 eV, platí: Pro pochopení rovnic: „energie potřebná pro inaktivaci terče dělená inaktivační energií na gram poskytuje počet gramů připadajících na jeden terč“. Numerický výraz ve druhém či třetím jmenovateli je přepočítací faktor z Gy, tj. J.kg-1, na eV.g-1. Přímý a nepřímý účinek •Molekulová hmotnost terče je dána součinem Avogadrovy konstanty a velikosti terče vyjádřené jako hmotnost v gramech. Po výpočtu s využitím výrazu z předchozího obrázku dostáváme: D37 je dosazena za převrácenou hodnotou k a je ji nutno vyjadřovat v eV.g-1. Mezi mol. hmotností určenou z radiochemického experimentu a mol. hmotností určenou nezávisle na ozáření je značná shoda, což naznačuje platnost jednozásahové inaktivační hypotézy. Teorie platí v plném rozsahu pro molekuly v suchém stavu, ve vodném prostředí se více uplatňuje nepřímý účinek. Přímý a nepřímý účinek •Nepřímý účinek: poškození terčové biomolekuly je zprostředkováno radikálovými produkty radiolýzy vody. Proces je řízen difuzí. •Pokusy se specifickými lapači radikálů ukázaly, že rozhodující význam má pro poškození biomolekul radikál OH∙ Rekombinace, restituce, oprava •3 způsoby obnovy stavu molekul před ozářením. •Rekombinace může nastat prakticky jen velmi krátce po interakční události – s ohledem na rychlost difuze je tento čas kratší než 10-11 s. Rekombinace je prostým znovuspojením iontového nebo radikálového páru. •Restituce je chemická (neenzymová) obnova původní molekuly. Dochází k ní v časech kratších než je jedna ms. Příkladem takového procesu je reakce radikálu DNA s molekulou obsahující sulfhydrylovou skupinu: •Příklad: •DNA∙ + RSH → RS∙ + DNA (s obnoveným H) • •Opravy jsou enzymatické a vyžadují podstatně delší čas. Makromolekulární terč v buňce •Dnes je jasné, že hlavním terčem je DNA, ať se jedná o účinek přímý nebo nepřímý. •Ostatní makromolekuly (bílkoviny i RNA) mohou být poměrně snadno nahrazeny resyntézou. •Důkazy: –korelace existence dvouvláknových zlomů DNA se ztrátou biologické aktivity. –Buňky neschopné oprav DNA nebo s chemicky zablokovanými opravami DNA jsou mnohem citlivější na působení ionizujícího záření. Chemické reakce vyvolané produkty radiolýzy vody •Není jisté, které z následujících radikálových reakcí jsou nejdůležitější pro nepřímé poškození DNA, ale uplatňují se zřejmě všechny. •1. Vytržení vodíkového atomu –R-H + H∙ → R∙ + H2 –R-H + OH∙ → R∙ + H2O •2. Disociativní reakce –R-NH3+ + e-aq → R∙ + NH3 –R-NH2 + H∙ → R∙ + NH3 Chemické reakce vyvolané produkty radiolýzy vody •3. Adiční reakce –R-CH=CH-R + OH∙ → R-CHOH-CH∙-R •4. Restituce –R∙ + R-SH → R-H + R-S∙ •5. Fixace poškození (radikálu biomolekuly) vazbou kyslíku – vzniká peroxid –R∙ + O2 → R-O-O∙ •Peroxidový radikál je dosti stabilní, nepodléhá restituci, ale není to finální produkt. Reakce s DNA •Jedná se o interakce s OH∙, H∙ a e-aq, přičemž nejdůležitější jsou interakce s hydroxylem: •Funkční skupiny na bázích a cukrech mohou být změněny – chybný nukleotid •Poškození bází může být tak silné, že dochází k jejich ztrátám, vznikají místa bez purinů nebo pirimidinů v DNA. •Přesun radikálu z báze na cukr-fosfátovou páteř může vést ke ztrátě báze. •Vznikají jednovláknové a dvouvláknové zlomy. Blízké (max. 10 bází vzdálené) zlomy na obou řetězcích se označují jako dvouvláknové – vedou k přerušení dvoušroubovice. •V experimentech s viry se zjistilo, že hydroxylový radikál nejčastěji napadá vodík deoxyribózy v poloze 4 (obr.), odnímá jej cukrovému zbytku za vzniku vody. •Látky se sulfhydrylovými skupinami vznik radikálů na DNA tlumí (mechanismem restituce), přítomnost kyslíku je naopak stabilizuje. o3_5 Přerušení řetězce DNA •Jednovláknový zlom – single-strand break (SSB): Poměrně snadná reparace, v radiačním poškození buněk hraje jen malou roli. •Dvouvláknový zlom – double-strand break (DSB): Reparace obtížná, protože pro ni chybí templát (předloha), časté chyby projevující se mutacemi. Různé mechanismy vzniku: –a) Jeden zásah DNA vede k přímému vzniku DSB v komplementárních místech řetězce. –b) Jeden zásah DNA může vést k tzv. kooperativnímu vzniku DSB v blízkých místech obou řetězců. –c) Dva nezávislé zásahy komplementárních řetězců v místech vzdálených od sebe max. 10 bází. Při větší vzdálenosti udrží dvoušroubovici vcelku vodíkové i jiné vazby. •JEDNOVLÁKNOVÉ I DVOUVLÁKNOVÉ ZLOMY MOHOU VZNIKNOUT TAKÉ JAKO DŮSLEDEK NEPŘÍMÉHO ÚČINKU - PŮSOBENÍ VOLNÝCH RADIKÁLŮ. Alpen-6-4-SSB-DSB Vliv konfigurace DNA na její radiační poškození •V živých buňkách se DNA nachází ve vysoce kondenzovaném stavu (supercoil, nadšroubovice, supervinutí – viz biofyzika, přednáška o struktuře živé hmoty) a v pevné vazbě s histony. Tato vazba je ovlivňována ionizujícím zářením již při dávkách řádově jednotek Gy. •Relaxace „supervinutí“ (tj. rozvinutí onoho supervinutí) v důsledku dvouvláknových zlomů zřejmě znemožňuje reparační procesy. Reparace DNA •Odhaduje se, že počet DSB v jedné buňce je 15-60 na 1 Gy, zatímco počet SSB je více než 1000 na 1 Gy. Poškození DNA však působením SSB vzniká jen minimálně. •Poškození DNA v důsledku působení ionizujícího záření: a)DSB a SSB v dvoušroubovici b)Chemické změny bazí c)Chemické změny cukrových zbytků d)Vznik spojek (cross-links) mezi bílkovinnou matrix a DNA nebo v DNA samotné. •Tato poškození jsou opravována několika různými způsoby, jejichž detailní popis je předmětem zájmu molekulární biologie. Reparace DNA – Excizní oprava •Excizní oprava – typická pro jednovláknové zlomy v nereplikujících se molekulách DNA. •Templát (předloha) komplementárního vlákna musí být k dispozici! •Dochází k odbourání dalších bází z okolí zlomu a pak se od 3‘-hydroxylového konce vlákna doplňuje chybějící sekvence (působením DNA-polymerázy I). •Podobně se opravují poškozené báze nebo cukrové zbytky. Rekombinační oprava DSB •Opravy DSB patří mezi tzv. error-prone (k chybám náchylné) opravy. Klíčovou roli v těchto opravách hraje bílkovina recA (mutace genu pro recA podstatně zvyšuje citlivost k radiačnímu poškození). Prokázáno u bakterií a něco podobného se projevuje i u savčích buněk. •Pro částečnou rekonstrukci místa s DSB je využito homologního duplexu = chromosomu (u diploidní buňky). •Rekombinační oprava začíná odbouráním jednoho vlákna duplexu exonukleázou na obou fragmentech. Bílkovina recA se váže k obnaženým „jednovláknům“ a iniciuje výměnu vláken s homologním duplexem, čímž vznikají dvě blízká rekombinační místa. Další postup viz obr. Rekombinační oprava DSB recombination repair A – dvouvláknový zlom, B – částečné odbourání jednoho z vláken v okolí zlomu a asociace s homologní dvoušroubovicí (duplexem), C – pod vlivem recA nastává rekombinace poškozených a nepoškozených úseků, D – syntéza komplementárních řetězců (vláken) DNA polymerázou, E – opravené dvoušroubovice Věrnost oprav (repair fidelity) •Excizní opravy SSB jsou všeobecně považovány za téměř bezchybné. Pravděpodobnost chyb je vyjadřována poměrem 1 : 107 až 1 : 1011. •Pravděpodobnost bezchybného spojení DSB je odhadována na jen asi 75% a dochází k němu zejména během prvních dvou hodin po poškození. •Autor: Vojtěch Mornstein • •Poslední revize: březen 2015