Monogenně dědičná onemocnění Renata Gaillyová LF 2008 - ZL Genetická onemocnění • Vrozené chromosomové aberace • Monogenně podmíněné nemoci • Polygenně a multifaktoriálně dědičná onemocnění • Mitochondriální choroby Zastoupení genetických chorob a vývojových vad podle etiologie • 0,6 % populace má vrozenou chromosomovou aberaci • incidence vážných monogenně podmíněných chorob odhadnuta na 0,36% u živě narozených novorozenců (studie na 1 000 000 dětí), méně než 10% se manisfestuje po pubertě • až 80 % populace onemocní do konce života multifaktoriálně podmíněnou chorobou (genetická predispozice + vliv zevního prostředí) Monogenně dědičná onemocnění Typy dědičnosti • Autosomálně recesivní - AR • X-recesivní – XR • Autosomálně dominantní - AD • X- dominantní - XD • Mitochondriální DNA / RNA analýza Autosomálně recesivní dědičnost • Pokud se autosomálně recesivní fenotyp vyskytne u více než jednoho člena rodokmenu, je to obvykle pouze u sourozenců probanda, nikoli u rodičů, potomstva nebo jiných příbuzných. • U většiny autosomálně recesivních chorob jsou muži i ženy postiženi se stejnou pravděpodobností. Autosomálně recesivní dědičnost • Rodiče postiženého dítěte jsou asymptomatičtí přenašeči mutantních alel. • Rodiče postiženého jedince mohou být v některých případech konsanguinní, to je pravděpodobné zejména tehdy, je-li gen zodpovědný za postižení v populaci vzácný. • Riziko opakování pro každého sourozence probanda je 1:4 (25%). Autosomálně Recesivní • Recesivní alela na autosomu • horizontální typ dědičnosti • riziko pro sourozence 25% • poměr pohlaví 1:1 • postižení se objeví pouze u homozygotů • častější u příbuzenských sňatku • Cystická fibrosa, Fenylketonurie, Kongenitální adrenální hyperplasie,Spinální muskulární dystrofie… Choroby AR dědičné • Cystická fibrosa - CF • Fenylketourie – PKU – porucha metabolismu bílkovin • Kongenitální adrenální hyperplasie – CAH, Adrenogenitální syndrom –AGS, deficit 21-hydroxylázy steroidů • Spinální muskulární atrofie – SMA • Nejčastější příčina dědičné nesyndromové ztráty sluchu • Dědičné poruchy metabolismu některé Cystická fibrosa • Lokalizace 7q • Frekvence nemocných v ČR cca 1/2000 – 1/3000 • Frekvence přenašečů v ČR cca 1/25-1/29 • Gen zmapován v roce 1989 • V roce 2008 známo 1300 mutací Mutace v genu cystické fibrosy Indikace k analýze CFTR genu na OLG FN Brno • Suspektní Cystická fibrosa • Cystická fibrosa v rodině - vyhledávání zdravých nosičů, vyšetření partnerů • Neprospívání + patol. potní test • Infertilita ženy ??? (2x SA, opakovaně neúspěšný IVF cyklus) • Infertilita muži (patologický SPG, azoospermie) • Zátěž v rodě ??? (úmrtí v kojeneckém a dětském věku) • Příbuzenský vztah Klinické příznaky • Respirační trakt • GIT • Iontová dysbalance, zvýšená koncentrace chloridů v potu (slané dítě) • Poruchy reprodukce • Poruchy růstu, neprospívání Průběh onemocnění • Typické formy • Atypické formy Přirozený průběh • V době stanovení diagnosy průměrný věk 6-8 měsíců, 66% do 1 roku • Závažnost limituje především postižení plic • Medián přežití v roce 1976 - 18 let, v roce 1995 - 30 let, od 1990 velmi malé zlepšení, dnes v Německu cca 36 let • Klinická heterogenita na základě mutací CFTR genu Strategie genetického vyšetření • F508del - 68,8% • 6 mutací - více než 80% • 36 mutací - cca 95% • skrínovací metody, sekvenace • nepřímá DNA analýza Typy využívaných analýz • Základní mutační analýza – 6 mutací, které se vyskytují asi u 83% CF pacientů v ČR • Základní mutační analýza + polythimidinové alelické varianty v intronu 8 CFTR genu (sterilita muži) • Rozšířená mutační analýza CFTR genu – Inno-lipa 17 + 19 mutací CFTR genu • Sekvenace celé kódující oblasti CFTR genu Genetické poradenství u CF • Retrospektivní - po porodu dítěte s cystickou fibrosou - riziko opakování pro dalšího sourozence 25% bez rozdílu pohlaví • Prospektivní - prevence prvního výskytu CF - steriliní a infertinlí páry, příbuzní partneři, vyhledávání dalších osob v riziku - přenašečů v CF rodinách , vyšetření partnerů zdravých nosičů mutace CFTR genu nebo nemocného CF Fenylketonurie • Dědičná porucha metabolismu – primární defekt je deficit enzymu fenylalaninhydroxylázy (PAH), který katalyzuje přeměnu fenylalaninu na tyrozin • Frekvence 1/4000-1/12000 novorozenců, přenašeči cca 1/40 • Novorozencký screening • Časná diagnostika • Bezbílkovinná dieta co nejdříve- restrikce Phe • Neléčená PKU – progresivní poškození vyvíjejícího se mozku, mentální retardace, epilepsie, spasticita, psychiatrické problémy • Maternální PKU Spinální Muskulární Atrofie • 5q12.2-13.3 - gen SMN1 • typ I, II a III • Hypotonie, úmrtí v dětském věku • vyhledávání homozygotů - nemocných - časná postnatální diagnostika • prenatální diagnostika • vyhledování přenašečů X-recesivní dědičnost • Incidence znaku je mnohem vyšší u mužů než u žen. • Heterozygotní ženy jsou většinou nepostižené, ale některé mohou postižení exprimovat s různou závažností, kterou určuje i model X inaktivace. • Gen zodpovědný za postižení je přenášen z postiženého muže přes všechny jeho dcery. Každý ze synů jeho dcer má 50% pravděpodobnost, že postižení zdědí. X-recesivní dědičnost • Gen zpravidla nebývá nikdy transmitován z otce na syna, ale je přenášen postiženým mužem na všechny jeho dcery. • Gen může být transmitován přes několik žen-přenašeček, po několik generací, pokud se tak stane, jsou postižení muži příbuzní přes ženy. X-recesivní dědičnost • Dcery ženy přenašečky mají riziko 50%, že budou opět přenašečkami, synové ženy přenašečky mají riziko 50%, že budou postižení. • Významná část izolovaných případů je důsledkem nových mutací. X- Recesivní • postižený je většinou muž, jeho synové jsou zdraví a dcery jsou přenašečky onemocnění • ženy-přenašečky mají 1/2 synů nemocných a 1/2 dcer přenašeček • vzácně výskyt u žen - dcera postiženého muže a ženy přenašečky, ženy s karyotypem 45,X, 46,XY, female…. X- recesivně vázaná onemocnění • Hemofilie A a B • Duchenneova / Beckerova svalová dystrofie • Daltonismus – barvoslepost • Některé dědičné poruchy metabolismu Duchenneova/Beckerova svalová dystrofie • XR, lokalizace Xp21 • incidence u chlapců asi 1/3-6 000 • dystrofinopathie - chybění proteinu dystrofin ve svalových buňkách • DMD -progresivní dystrofie, úmrtí kolem 20 roku věku • BMD - pomalá progrese Duchennova svalová dystrofie DMD/BMD • molekulárně genetické vyšetření - 60% mutací jsou velké delece • vyhledávání žen přenašeček - nepřímá DNA diagnostika, neurologie, UZ, emg, biochemie ( JT, CK), svalová biopsie, RNA dg. imunohistochemické vyšetření, FISH • prenatální dg. Duchnneova/Beckerova svalová dystrofie (Xp) • časná diagnostika • vyhledávání přenašeček • prenatální diagnostika DMD po IVF - kasuistika • 1990 - partner - agenese testis, 46,XX • 2000 - partneři - prekoncepční vyšetření, azoospermie u partnera (agenese testes) • partnerka 46,XX • partner 47,XXY/46,XX,non delece AZF a,b,c, gen CFTR non: F508del, CFTR dele2,3)21kb), G542X, G551D, R553X DMD po IVF - kasuistika • 1. cyklus IVF/AID úspěšný, těhotenství bez komplikací, porod sekcí v termínu, 4200/55 • chlapec zdráv, vyšetřen v 1/2 roce po infekci močových cest oš. pediatrem, zjištěna hepatopathie, vyloučena infekční etiologie, susp. nervosvalové onemocnění • DNA analýza potvrdila DMD - delece exonu 45-50 v genu pro dystrofin DMD po IVF - kasuistika • Rodinná anamnesa je negativní • Matka je přenašečka pro DMD de novo (nepřímá DNA analýza. mRNA, FISH) • Sestra matky má 2 chlapce ve věku 11 a 3 roky, plánovala zařazení do programu dárkyň oocytů-není přenašečka, matka partnerky není přenašečka DMD (nepřímá DNA analýza) • 2.IVF cyklus s využitím IVF/AID/PGD - DMD neúspěšný Detekce delece DMD exonů Metoda MLPA® Multiplex Ligation Probe Amplification Hemofílie • časná diagnostika • vyhledávání žen - přenašeček • prenatální diagnostika • specializovaná péče o gravidiní - přenašečku Hemofílie, perninatální péče na specializovaném pracovišti, informovaný ošetřovatelský tým Hemofílie • Hem A - Xq28, deficit f VIII • frekvence cca 1/5 000 chlapců • Hem B - Xq27.1-27.2, deficit faktoru IX • frekvence cca 1/25-30 000 chlapců Autosomálně dominantní dědičnost • Fenotyp se obvykle objevuje v každé generaci, každý postižený jedinec má postiženého rodiče. • V klinické genetice se objevují tyto výjimky nebo zdánlivé výjimky z uvedeného pravidla: • a) případy vzniklé na základě nových mutací v gametě fenotypově normálního rodiče, • b) případy, kdy není postižení u rodiče exprimováno – nepenetruje, neprojevuje se nebo je u jedince, který zdědil příslušný gen, exprimováno jen mírně. Autosomálně Dominantní dědičniost • Každé dítě postiženého rodiče má 50% riziko, že znak zdědí. Toto platí pro většinu rodin, v nichž je druhý rodič fenotypově normální. Statisticky je každý člen rodiny výsledkem „náhodné události“, a proto může dojít v jedné rodině k výraznému posunu od očekávaného poměru 1:1. Autosomálně Dominantní dědičnist • Fenotypově normální členové rodiny nepřenášejí patologický fenotyp na své děti. Selhání penetrance nebo velmi mírná exprese postižení může vést ke zdánlivé výjimce z tohoto pravidla. • Muži a ženy mají stejnou pravděpodobnost, že předají fenotyp dětem obou pohlaví, riziko onemocnění je pro obě pohlaví stejné. • Významnou část izolovaných případů mají na svědomí nové mutace. Autosomálně Dominantní • dominantní mutace na autosomu • vertikální typ dědičnosti • postižení většinou heterozygoti • riziko opakování pro potomky a sourozence 50% bez rozdílu pohlaví • často nové mutace, variabilní expresivita, neúplná penetrance AD dědičná onemocnění • Myotonická dystrofie I a II • Neurofibromatosa • Huntingtonova choroba • Syndrom prodlouženého QT intervalu – dědičné arytmie srdeční • Leidenská mutace v genu pro f V – dědičné trombofilie Neurofibromatosa typ I • Frekvence onemocnění cca 1/3000 • Lokalizace 17q11.2 • Dědičnost - autosomálně dominanantní s téměř 100% penetrancí a velmi variabilní expresivitou • Cca 50% případů jsou nové mutace • Progredující onemocnění Neurofibromatosa typ II • Onemocnění mnohem vzácnější • Výskyt neurinomů akustiku, mnohočetných Schwanomů a meningeomů • Kožní projevy mírné • Lokalizace genu 22q11 • Dědičnost AD Neurofibromatosa I Klinické projevy • Skvrny café au lait - 6 a více o průměru nad 1cm • mnohonásobné pigmentové anomálie • četné fibromy nebo neurofibromy, jiné intra- či subkutánní dysplastické nádory , tu podél nervových kmenů, tu jiných orgánů (mutace v tumor - supresorovém genu) • časté neurologické nebo oční poruchy • často anomálie skeletu • PMR asi v 10% • makrokranie, neurofibrom víčka, zákal rohovky, Lishovy uzlíky na iris Molekulárně genetická analýza • Gen NF I - 60 exonů • Nejsou známa místa s vyšší frekvencí mutací • 50% onemocnění způsobeno de novo mutacemi • V rodinách s opakovaným výskytem je možná nepřímá DNA analýza • V současné době ukončujeme přímou DNA analýzu 8 exonů, které představují asi 13% genu a záchyt mutací byl rovněž 13% • Pokračujeme v zavedené RNA dg. celé kódující oblasti jako první krok mol. genetické analýzy • Rozvoj MLPA • Gen NF II - 17 exonů • DNA diagnostika - SSCP • RNA analýza – přímá sekvenace • Achondroplasie (ACH) • 1964 Maroteaux-Lamy • Výskyt 1 : 15 000-40 000 • dědičnost autozomálně dominantní • 90% jsou děti zdravých rodičů • Starší otcové • Identifikace genu FGFR3 • 2 mutace vedoucí k záměne jedné AMK (98% c.1138G-A, 1-2% c.1138G-C) • Paternální původ mutací • FGFR3 nukleotid mutovaný u ACH se jeví jako najvíce mutovaný nukleotid v lidském genomu Huntingtonova chorea • AD, lokalizace 4p • presenilní demence, atetoidní mimovolní pohyby • amplifikační mutace - expanze CAG 30-100x • nástup v dospělosti • asociované problémy Huntingtonova chorea • diagnostické testování • testování osob v riziku • genetické poradenství • prenatální diagnostika Preventivní vyšetření - LQT syndrom • 10% nosičů mutace má během života klinické potíže, první projev onemocnění může být náhlá srdeční srmt • diagnostika • vyhledávání nosičů mutace v rodinách • preventivní terapie positivně testovaných na kardiologii • prenatální diagnostika - málo využívaná Trombofilie • Preventivní vyšetření v rodinách s positivní anamnesou trombembolických příhod a u pacientek s opakovanými fetálními ztrátami • Preventivní vyšetření a dispenzarizace na hematologii, předoperační vyšetření apod., vyšetření příbuzných • Preventivní péče v graviditě Leidenská mutace G1691A f V • frekvence v bílé evropské populaci asi 5 - 9% • AD dědičnost • zvýšení rizika trombembolismu u homozygotů 50-100x, u heterozygotů 5-10x • asociace s rizikem časných fetálních ztrát není potvrzena • zvyšuje riziko fetálních ztrát od konce I. trimestru, ve II. a III. trimestru G20210A f II Prothrombin • v heterozygotním stavu se mutace vyskytuje asi u 2-3% populace • zvýšení rizika trombembolismu • nosičství je spojeno se zvýšeným rizikem fetálních ztrát, abrupce, preeklampsie, IUGR • riziko časných SA není potvrzeno Vznik mutací u člověka Pohlavní rozdíly • Mutace genomové – aneuploidie – numerické chromosomové aberace • Mutace chromosomové – strukturální chromosomové aberace • Mutace genové – změny genů Vrozené mutace u člověka • Spermatogenese • Nepřetržitý sled buněčných dělení probíhající po celý život, jejichž výsledkem je asi miliarda spermií • „Copy errors“ – spermie je produktem • asi 200 dělení u 20ti letého muže • asi 430 dělení u 30ti letého muže • asi 770 dělení u 45ti letého muže Frekvence nových mutací • Např. u 27-letého muže je spermie produktem asi 300 buněčných dělení tedy – každá spermie ponese odhadem 3 x 10^2 x 6 x10^9 x 10^-10 = 180 nových mutací jako důsledek chyb při replikaci • Odhaduje se, že novou „škodlivou mutaci“ ponese asi jedna z 10 spermií Riziková onemocnění, která mohou souviset s vyšším věkem otce • Achondroplasie • Crouzonův syndrom • Apertův syndrom • Mentální retardace nejasné etiologie • Autismus • Schizofrenie • Mnohočetná endokrinní neoplasie • Neurofibromatosa I • Hemofilie B Molekulární biologie • Metodiky využívané stále častěji v laboratorní praxi mnoha oborů • Využití v klinické genetice je jednou z možností využití metod molekulární biologie Diagnostika chorob na molekulární úrovni • Stále se rozšiřuje počet onemocnění s objasněnou molekulární podstatou • Stále se zvyšuje počet onemocnění s možností DNA diagnostiky • Stále se rozšiřuje spektrum metod využívaných v DNA diagnostice - při vyhledávání mutací způsobujících závažná dědičná onemocnění DNA analýza dědičných onemocnění • Přímá – detekce mutací – potvrzuje klinickou diagnosu • Nepřímá – segregační – nepotvrzuje klinickou diagnosu DNA analýza dědičných onemocnění • Diagnostické testy – potvrzení klinické diagnosy na molekulární úrovni, případně potvrzení segregace patologické alely v rodině • Prediktivní testování – onemocnění s pozdním nástupem klinických příznaků, onkologie • Vyhledávání zdravých nosičů patologické alely • Prenatální testy Genetické poradenství a DNA analýza • Vyšetření na molekulární úrovni by vždy mělo doprovázet genetické poradenství • Diagnostika na molekulární úrovni musí být vždy prováděna s informovaným souhlasem pacienta nebo jeho zákonného zástupce • Výsledek molekulárně genetického vyšetření by měl být vždy interpretován erudovaným lékařem – klinickým genetikem Molekulárně genetické vyšetření • Protokolární postupy – cílené vyšetření vysoce suspektního onemocnění • Pokud možno přesná klinická dg. • Informovaný souhlas • Interdisciplinární spolupráce klinika a klinického genetika a pacienta • Genetické poradenství před prováděným molekulárně genetickým vyšetřením a při předání – interpretaci výsledku vyšetření Genetická prevence u monogenních dědičných chorob • konfirmace klinického stavu na molekulární úrovni • časná diagnostika • vyhledávání heterozygotů (AR,XR) • prenatální diagnostika • presymptomatické testy • genetické poradenství, preventivní léčba, je-li možná DNA banka • Slouží k uchování biologického materiálu, který bude možno využít v případě zavedení nových metodik, postupů či vyšetření u různých dědičných onemocnění • Izolace a uložení DNA v DNA bance vždy se souhlasem pacienta nebo rodiny. • Umožňuje zachování vzácného materiálu, který v budoucnu může umožnit rodinám využít diagnostické, presymptomatické či prenatální vyšetření