• • Základní metody výzkumu • • Základy metodologie – Empirické metody – Logické metody – Metody vyhodnocení získaných dat – Nevědecké (alternativní) přístupy v medicíně – – Prof.MUDr. Augustin Svoboda,CSc. – Biologický ústav LF MU Brno – Metodologie pojednává o tom, jak se poznává. Jejím předmětem jsou poznávací metody. Zajímá se o jejich používání a o jejich vývoj – tak jak postupuje poznání. Metoda ( z lat. methodus) je způsob, jak se získávají a vyjadřují vědecké poznatky a jak se s poznatky zachází. V užším slova smyslu je metodologie nauka o tom, jak při vědeckém studiu klást správně otázky a jak na ně hledat odpovědi. • • Metodologie biologických věd, • mezi něž patří také lékařství, se nezajímá ani tak o předmět biologického studia, ale především o způsob, jak se předmět zkoumá. • Metodologie genetiky se tedy nezajímá o dědičnost, ale jak se dědičnost zkoumá: • metody křížení, cytogenetické postupy, • metody molekulární genetiky • • Metodologie vědy se rozvíjí většinou současně s rozvojem poznání v tom kterém oboru • Např. studium struktury a funkce buňky stimuluje vývoj příslušných metod • Příklad: mikroskopie v procházejícím světle • fázový kontrast • elektronová mikroskopie • fluorescenční mikroskopie • imunofluorescenční mikroskopie • konfokální mikroskopie • • • Satava7 Sc11 Sc20 Sc_fáz1 Mikroskopické metody studia kvasinkových buněk – světelný mikroskop Procházející světlo Fázový Fázový -obrácený fluorescenční interferenční Sc1 Elektronová mikroskopie kvasinkových buněk Ultratenký řez, fixovaná buňka Mrazové lámání, buňka fixovaná reversibilně • – Metodologie biologických věd je ovlivněna dvěma specifickými znaky živých soustav, které mají vliv na vědeckou přesnost výpovědí biologických věd: • · systémovost • · proměnlivost a adaptabilita (přizpůsobivost) Systémovost: • Každá složka živých soustav je subsystémem výše organizovaného subsystému: • Systémová analýza společenstva •molekuly •komplexy molekul •organely. •kompartmenty •buňky •tkáně •orgány •orgánové soustavy •jedinec •populace •společenstvo Struktura a chování buňky závisí na jejím okolí – zda je subsystémem tkáně nebo je buňkou samostatnou Animal tissue untitled Buňky TK Buňky ledvinné tkáně • 2. Proměnlivost a přizpůsobivost (adaptace) • Organismus nebo buňka nemusí reagovat na stejný podnět stejným způsobem, jako např. molekula NaCl, která disociuje vždy na Na + Cl. Živý organizmus může v mezích svého genotypu volit některou z alternativ svého chování, své reakce na podnět: • měnit intenzitu, rychlost a směr reakce, přizpůsobit se a učit se.. • images sporeformers Sporulace u bakterií v důsledku hladovění Trigo1 Trigo2 Dimorfizmus u kvasinky Trigonopsis variabilis: triangulární buňky - v mediu bohatém na aminokyseliny Elipsovité buňky – v mediu chudém • • Mnohé děje v živých soustavách jsou z hlediska určité rozlišovací úrovně deterministické nebo pravděpodobnostní • (stochastické ) • (poznatky, které určitý děj popisují , jsou pak jednoduše • definované nebo jsou to poznatky statistické) • • Příklad: • tok genetické informace: DNA ® RNA ® bílkovina – děj deterministický • utváření výšky postavy (170 +- 20 cm) – děj stochastický • • Poznatek obsahuje informaci o skutečnosti. Může být vyjádřen –slovně (verbálně): slovní tvrzení, závěr z pokusu, hypotéza aj. (každá buňka obsahuje jádro) –neverbálně – matematickou rovnicí, grafem, chemickým vzorcem (Na + Cl = NaCl) • •Základní termíny metodologie biologických věd: • Metoda: způsob poznávání, určený souborem pravidel, kterými se řídíme (elektronová mikroskopie) • Metodika: technika, způsob výkonu určité vědecké činnosti • Např. technika ultratenkých řezů, DNA hybridizace in situ • Objekt - předmět výzkumu. • Objektivní: nalézající se mimo nás, mimo naše vědomí (např. lymfocyty v mikroskopickém preparátu) • • Subjekt: člověk a jeho vědomí. • Subjektivní: vlastní člověku a jeho vědomí. • Např. subjektivní chyba v pozorování – popis barvy či tvaru pozorovaného objektu • Vědecký jazyk: množina uspořádaných znaků a termínů, jimiž se vyjadřuje poznaná skutečnost. Např. věta: DNA molekula je tvořena dvěma řetězci polynukleotidových řetězců, které jsou spojeny vodíkovými vazbami. • Termín – odborný název. • např. chromosom, DNA, mikroskop,PCR • • Pojem je myšlenkový obraz určité skutečnosti vyjádřený temínem • Termín červená krvinka je odborný termín. Krvinka je myšlenkový obraz pozorovaného erytrocytu doplněný o další poznatky, zjištěné studiem • • Definice: vyjadřuje nejpodstatnější, nejcharakterističtější a stálé znaky pojmu, které jej odlišují od pojmů ostatních. • Prokaryont je pojem definovaný cirkulárním chromosomem a nepřítomností mitózy. • Bakterie vyhovuje této definici a proto je prokaryont • Gen je úsek polynukleotidového řetězce, nesoucí informaci pro struktury bílkoviny nebo pro RNA, která nepodléhá translaci • Hypotéza (domněnka) je neověřený výrok, založený na ověřitelných předpokladech. • Příklad: Mitochondrie vznikly endosymbiózou bakterií • Teorie: soubor tvrzení, které popisují a vysvětlují jevy v rozsáhlé oblasti skutečnosti • Příklad: evoluční teorie • Zákon: výpověď, která přesně a jednoznačně vyjadřuje všeobecnou platnost a neměnnost určité skutečnosti • Z hlediska závislosti na vnějších podmínkách se rozlišují zákony dynamické a zákony statistické • Příklad: Archimedův zákon, Newtonovy zákony – jsou dynamické • Hardyův a Weinbergův zákon o stálém poměru genotypů v populaci – platí za určitých podmínek – zákon statistický • Biologické zákony jsou statistického charakteru – vztahují se na hromadné jevy • Skutečnost vnímáme smysly, jejichž účinnost zesilujeme přístroji (mikroskop, elektroforéza). • Nové poznatky pak získáváme empirickými metodami - pokusem, pozorováním a měřením. • Těmito postupy získáváme objektivní údaje, data. Získaná data hodnotíme metodami teoretickými (logickými) – indukcí, dedukcí, analýzou, syntézou, srovnáváním • •Empirické metody • • objektivní údaje • • vědecké poznatky • •Teoretické metody • •Pomocí empirických metod získáváme objektivní údaje – data •Objektivní údaje: informují o skutečnosti existující nezávisle na subjektu (pozorovateli), takže mohou být kdykoliv a kdekoliv opakovány. •Empirické poznatky jsou založeny na určitém počtu pozorování a pokusů •Pozorování: • - soustředěné, záměrné vnímání tvaru a vlastností předmětů a jevů. Je to odraz skutečnosti zprostředkovaný smysly a upřesňovaný pomocí přístrojů. • • 50 let věděli bádatelé, že v jádře lidských buněk jsou chromosomy, než dospěli k správnému závěru o jejich počtu. V r. 1909 – Winniwater zjistil 47 chromosomů, Painter v r. 1933 48 chromosomů a správný počet – 46 byl zjištěn teprve v r. 1955 (Hansen – Melanderová) a definitivně potvrzen v r. 1960 • •Pozorování zahrnuje subjektivní i objektivní chyby. 8_2 graphic11 Chromosomy v lidských buňkách Chromosomy značené technikou FISH Metoda proužkování chromosomů Mitotické chromosomy v elektronovém mikroskopu •Měření: určování kvantitativních vlastností biologických objektů • rozměry, počty - výška, váha, tepová frekvence, počty krevních buněk atd. • •Upřesňuje se pomocí přístrojů • Bürkerova komůrka se nahrazuje různými cytometry • podobně jako hladiny různých molekul v plasmě – nikoliv např. vážením ale sofistikovanými přístroji •Experimentování •– pozorování nebo měření za podmínek, které určuje výzkumný pracovník •Má 2 podoby: •· buď měníme jednu z vnějších podmínek nebo působíme novým faktorem • (promýváme červené krvinky od plasmy- vodou nebo solným roztokem a pozorujeme změnu tvaru ery.) •· nebo zevní podmínky zůstávají stejné a měníme určité vlastnosti objektu •(nejprve ozařujeme určitou dávkou záření mladé krysy a pak staré, nebo samce a pak samičky) • • Kontrolní pokus: • probíhá současně s vlastním pokusem . Nepůsobíme vlastním faktorem ale např. neutrálním. • Účinek antibiotika na bakterie – antibiotikum je rozpuštěno v metanolu a tak v kontrolním pokuse zjišťujeme, zda samotný metanol nepůsobí na bakterie • •Pokus heuristický – odpovídáme na otázku: co se stane, když... •Pokus ověřovací - stane se skutečně to, když udělám to a to...? • •Např. Fleming si všiml, že kolonie bakterií se neobjevují v blízkosti kolonií plísně Penicilium notatum“, zjišťoval pak, jak na bakterie působí lyzát plísní •Když zjišťujeme citlivost izolovaného bakteriálního kmene na paletu antibiotik,děláme zpravidla ověřovací pokus • Schema pokusu • • 1. Studium literatury • 2. formulace problému (otázky) • 3. zvolení metodiky, materiálu • 4. provedení pokusu a zjišťování výsledků • 5. hodnocení výsledků • 6. závěr – vlastní odpověď na položenou otázku • Např. podstata krevních skupin systému AB0 •Teoretické (logické) metody • •Údaje zjištěné empirickými metodami – empirické výsledky – jsou pouze výchozím materiálem, který se dále zpracovává teoretickými (logickými metodami. •Žádná empirická věda se nemůže spokojit pouze s registrováním poznatků. Pomocí logických metod z nich vyvozuje obecněji platné závěry. •Vědecké poznání používá dva logické postupy pro další zpracování dat: indukce a dedukce •V konkrétní aplikaci se oba postupy doplňují a hovoříme o induktivně – deduktivní metodě vědy •Indukce: •vyvozování závěrů z jednotlivých méně obecných dat: •Induktivní postup probíhá podle schématu: •1. Hodnocení dat získaných pozorováním a pokusy •2. Předběžné zhodnocení výsledků v podobě pracovní hypotézy •3. Ověřování hypotézy novým pozorováním a pokusy •4. vyvození obecného závěru případně stanovení zákona • • Příklad: Buněčná teorie, Rozdělení buněk na prokaryota a eukaryota • Dedukce • – logický postup, kdy vyvozujeme z obecných předpokladů závěry jiné obecné závěry nebo i dílčí závěry , které se vztahují na jednotlivé případy •Příklad: V 19. stol. mikrobiologie prokázala bakteriální původce některých chorob a induktivně bylo zobecněno, že všechny choroby určitého typu jsou vyvolány bakteriemi. Deduktivním postupem bylo usuzováno, že bakterie jsou původcem i dalších infekčních chorob. To bylo u některých chorob potvrzeno, u jiných chorob se našly jiné mikroorganismy plísně, prvoci, resp. virusy • • Při induktivně deduktivních postupech se uplatňují i další méně obecné metody: • Metoda srovnávání • Analýza a syntéza • Analogická metoda • Modely a modelování • • Modelové organismy: zvířata, tkáně, buňky •Zákony, hypotézy a teorie •Vztahy mezi poznanými vědeckými poznatky mají různý charakter, který vyjadřujeme uvedenými termíny. •Zákon, vědecký zákon, vyjadřuje určitý, konstantní vztah mezi věcmi a procesy v určité oblasti skutečnosti, který vyplývá z jejich struktury a uspořádání a který se projevuje v jejich interakci. •Vědecký zákon vyžaduje přesnou formulaci z přesných dat. •V přírodních vědách existují 2 typy zákonů • •zákony dynamické (podmínky relativně stálé, nezávislé na jiných: • Newtonovy zákony pohybu těles ve sluneční soustavě, Archimedův zákon) •zákony statistické – vztahují se na hromadné jevy v celku, neplatí pro jednotlivé případy hromadného jevu. • Mendlovy zákony: při křížení homozygotů se objeví znaky homozygotních rodičů v poměru 3:1, dědičnost pohlaví 1:1 • •Metody vyhodnocování vědeckých fakt •Variabilita (proměnlivost živých organismů je příčinou nejednoznačné odpovědi v pozorování a pokuse • Při měření hodnoty určitého znaku (výšky postavy) v souboru jedinců dostaneme množinu dat, které se pohybují v určitém rozsahu. Tuto variabilitu lze měřit statistickými postupy: • · Měření průměrných hodnot • · Charakteristiky variability • • • •Průměrné hodnoty: • •Aritmetický průměr je dán vztahem: • •n … počet provedených paralelních měření sledované veličiny •xi … naměřená hodnota sledované veličiny pro i-té měření •medián - střední hodnota z výběru seřazeného podle velikosti - při jeho určení z velkého souboru dat zcela ztrácíme informace obsažené ve všech výsledcích kromě jednoho či dvou výsledků •modus – nejčetnější hodnota znaku • Směrodatná odchylka • Směrodatná odchylka je jednou z nejpoužívanějších měr kolísavosti výkonnosti fondu. Vyjadřuje rozptyl hodnot kolem střední hodnoty, tj. vypovídá o tom, jak se hodnoty od této střední hodnoty (průměru) liší, resp. jak hustě jsou kolem tohoto průměru seskupeny. • Obecně se vypočítá dle vzorce: • • • • • kde xi je hodnota i-tého pozorování, n je počet pozorování a je průměrná hodnota všech pozorování iq-gaussova-krivka Gaussova křivka Gaussova křivka – křivka charakterizující normální rozdělení statistické veličiny, tj. např. některých kvantitativních znaků v populaci výšky, tlaku krve aj.. Má charakteristický „zvonovitý“ tvar s maximem výskytu průměrných veličin a s poklesem směrem k oběma extrémům Modus Medián Variační šíře Cholesterolemie1 Hladina cholesterolu u zdravých lidí a lidí se zvýšeným rizikem arteriosklerózy •Při všech měřeních vznikají chyby, jimiž jsou výsledky zatíženy •Chyby se dělí na: • chyby náhodné - vyskytují se nepravidelně, lze je statisticky vyhodnotit • chyby systematické - lze je předvídat a vypočítat, provést korekci výsledků • chyby hrubé - lze jim zabránit pečlivou prací • •Systematické chyby se nejčastěji dělí podle svých zdrojů na: •chyby přístrojů - všechna zařízení mají určitou konečnou hranici přesnosti •chyby chemikálií - všechny chemikálie obsahují určitá malá množství nečistot •chyby metod - způsobené například určitou rozpustností sraženiny •chyby subjektivní - způsobené například špatným odečtem spotřeby na byretě • • Nevědecké (alternativní) přístupy v medicíně • Homeopatie • Akupunktura • Jiné metody léčitelství a diagnostiky • Psychotronika, aurikulodiagnostika, iridodiagnostika aj • •Homeopatie je založena přibližně na deseti principech. Mezi nejdůležitější z nich patří •Léčba podobného podobným (similia similibus curentur •Velmi malé dávky, případně až princip nekonečně malého dávkování resp. infinitezimálního ředění •Metody a léčiva se volí podle příznaků bez zkoumání patologických procesůÚčinky přípravků musí být testovány na zdravých lidech, protože na nemocných je nelze rozlišit od projevů nemoci • •Skeptický výkladový slovník (J.Heřt) označuje homeopatii za absurdní výmysl, který dnes nemá žádné opodstatnění, její principy jsou v příkrém rozporu s přírodními zákony i s vědeckými poznatky a lze je snadno vyvrátit věcnými i logickými argumenty • • Happening 10:23 • 30. ledna 2010 v 10:23 uspořádali britští skeptici po celé Anglii protestní happening 10:23, během kterého se veřejně "předávkovali" údajně velmi silnými homeopatickými léky - demonstrativně spolkli celé balení (až 100 cukrových tabletek). Bez jakýchkoli účinků. • Empiricky tak prokázali neexistenci proklamovaných účinků. • Akupunktura je léčebná metoda, která patří do systému tradiční čínské medicíny. • Jedná se o nabodávání jehel do akupunkturních bodů na lidském těle. Podle tradiční čínské nauky leží tyto body na akupunkturních drahách neboli drahách energie, tzv. meridiánech. Těmi podle této nauky proudí životní energie čchi a jsou spojeny s jednotlivými orgány. Akupunktura se snaží předcházet nerovnováze v toku této hypotetické energie a odstraňovat ji. Vědecky se dosud nikdy nepodařilo prokázat existenci akupunkturních bodů a drah. ohraku Aurikulodiagnostika Na povrchu boltce lze najít aktivní body o velikosti asi 0,2 mm, které odpovídají tělesným orgánům. Drážděním těchto bodů lze orgány aktivovat, zklidňovat atd. AUSS-LABS%20PLAKATS irido_04_big Irisdiagnostika:projekce orgánů lidského těla do duhovky Změny barvy a struktury duhovky mohou upozornit na nemocný orgán a na povahu jeho postižení