základní přehled organismů Doména Archaea Tato doména nebyla rozpoznána až do konce 70. let minulého století Co se týče morfologie, neliší se archeální buňky od buněk bakteriálních Rozdíly jsou biochemické a genetické Žijí v extrémních stanovištích, proto je lze jen velmi obtížně kultivovat. Methanococcus janaschii http://www.ucmp.berkeley.ed u/archaea/archaea.html Methanobacterium thermoautotrophicum Archaea kde žíjí jsou to jediné organismy, které mohou žít v hydrotermálních pramenech, v hypersalinních vodách, v podmořských vulkanických oblastech, uvnitř mnohobuněčných organismů nově byly ale nalezeny také jako součást planktonu na otevřeném moři jak vypadají buňka je tvořena buněčnou stěnou, plazmatickou membránou a protoplastem. na rozdíl od bakterií se liší jejich chemické složení např. buněčná stěna bakterií je tvořena peptidoglykanem zatímco u archeí je tvořena pseudopeptidoglykanem nebo pseudomureinem největší rozdíl je ve stavbě plazmatické membrány v lipidech, které jsou chemickou složkou plazmatické membrány je vazba éterová (u bakterií esterová) Éterové vazby archeí jsou stabilnější, což může přispívat ke skutečnosti, že archea jsou schopna žít v extrémních teplotách a v kyselých i zásaditých prostředích. Také lipidové ,,ocásky" vykazují odlišnosti, u archeí jsou tvořeny především isoprenem, u ostatních organismů jsou hlavní chemickou složkou mastné kyseliny. Isopreny jsou větvené a opět stabilnější za vyšších teplot. Archea se liší i samotným typem glycerolu: archea mají jiný prostorový izomer této molekuly než ostatní organismy. U některých archeí se namísto běžné fosfolipidové dvouvrstvy vyskytuje jen jednovrstvá membrána. Na takto stavěné membráně jsou ocásky fosfolipidových molekul přiloženy k sobě, čímž v podstatě vzniká jediná molekula s dvěma polárními konci. Archea s tímto typem membrány jsou odolnější k nepřízni životního prostředí Protoplast Stavbou svého protoplastu (obsahu buněk) jsou archea výrazně srovnatelná s bakteriemi. To je také řadí mezi organismy prokaryotického typu. Neobsahují totiž žádné membránové organely, přesto se samozřejmě některé struktury v protoplastu vyskytují. Zásadní funkci v syntéze proteinů zaujímají ribozomy, drobné struktury složené z rRNA a proteinů. Další podstatnou součástí protoplastu je DNA uspořádaná v nukleotidu a v plazmidech. Rozmnožování -výhradně dělením, fragmentací nebo pučením (tj. nepohlavně) jak jsou členěny Korarchaeota hypertermofilní Crenarchaeota hypertermofilní Euryachaeota metanogenní halofilní archea bez buněčné stěny http://www.ucmp.berkeley.edu/archaea/archaeasy.html Doména Bacteria jednobuněčné organismy prokaryotického typu většina se vyznačuje přítomností buněčné stěny neobsahují membránové organely (mitochondrie ani plastidy) ribozómy se sedimentačním koeficientem 70S nukleoid je neohraničený membránou, tvoří jej jedna molekula kružnicové DNA rozmnožují se nepohlavně, binárním dělením nebo pučením jsou autotrofní i heterotrofní Výživa bakterií podle zdrojů uhlíku bakterie autotrofní či litotrofní (zdrojem uhlíku je CO2) bakterie heterotrofní či organotrofní (zdrojem uhlíku je organická látka) podle zdroje energie fototrofní (zdrojem energie je sluneční světlo) fotoautotrofní (sinice) fotoheterotrofní chemotrofní (zdrojem energie je přeměna exogenních chemických látek) chemoautotrofní chemoheterotrofní (zdrojem uhlíku i energie jsou organické látky ­ většina bakterií) chemoheterotrofní bakterie zpracovávají organické látky a) v aerobním metabolizmu ­ organické látky oxidují vzdušným kyslíkem až na CO2 a vodu b) v anaerobním metabolizmu ­ kvašením ve vztahu ke kyslíku rozlišujeme -obligátně (striktně) aerobní bakterie ­ aerobní respirace - obligátně (striktně) anaerobní bakterie - fermentativní nebo anaerobně respirační metabolismus -fakultativně anaerobní bakterie ­ kvašení, aerobní respirace, anaerobní respirace -aerotolerantní anaerobní bakterie (anaerobní bakterie, které tolerují kyslík, ale nevyužívají ho) -mikroaerofilní bakterie ­ mohou využívat kyslík, jen v prostředí, kde je jeho koncentrace nižší než ve vzduchu. mají omezenou schopnost dýchání nebo mají enzymy labilní směrem ke kyslíku Systém bakterií sinice ­ Cyanobacteria (Cyanophyta) bakterie ­ dále dělíme podle stavby buněčné stěny Gramnegativní bakterie s buněčnou stěnou (Gracilicutes) ­ koky, tyčky, spirily Grampozitivní bakterie s buněčnou stěnou (Firmicutes) ­ aerobní nebo mikroaerobní tyčky a koky Bakterie bez buněčné stěny (Tenericutes) ­ vláknité nebo koky, saprofytické, parazitické a patogenní příklady užitečných bakterií Lactobacillus (mléčné bakterie) grampozitivní tyčky, zkvašují sacharidy včetně laktózy na kyselinu mléčnou. Ta zastavuje rozmnožování hnilobných a patogenních bakterií. Mléčné bakterie se používají na konzervování zeleniny, na přípravu sýrů, acidofilního mléka, jogurtu. L. acidophilus převzato z www.textbookofbacteriology.net/normalflora.html. Acetobacter aerobní bakterie, které jsou schopny oxidovat etanol na kyselinu octovou. Používají se při výrobě octu. Naopak nepříznivě působí při octovatění vína a piva převzato z http://www.aromadictionary.com/articles/volatileacidity_artic le.html Escherichia coli Gramnegativní pohyblivá paličkovitá bakterie. Žije v tlustém střevu člověka a teplokrevných zvířat. Je komenzál (organismus žijící v hostiteli, aniž by mu způsoboval škodu). Některé kmeny E. coli mohou vyvolat onemocnění močových cest, hnisavá onemocnění ran a průjmy. E. coli slouží jako modelový organizmus pro biochemické a genetické výzkumy. převzato z http://www3.niaid.nih.gov/topics/BiodefenseR elated/Biodefense/PublicMedia/image_library .htm Streptomyces Grampozitivní vláknité bakterie. Je aerobní, saprofytické. Mnohé druhy produkují antibiotika (streptomycín - Streptomyces griseus) a využívají se na průmyslovou antibakteriálních a antifungálních antibiotik. Některé streptomycéty tvoří vitamín B12 (Streptomyces olivaceus). Vyskytují se v půdě, přičemž způsobují její plísňový pach. http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_coelicolor/gfx/h4tkm1m.gif Rhizobium Gramnegativní tyčkovitá bakterie, žije v symbioze s bobovitými rostlinami. bakterie žijí v hlízkách kořenů , kde vážou vzdušný dusík do podoby využitelné rostlinou. http://www.rdg.ac.uk/AcaDepts/sb/rhizobium/images/beans2.jpg http://recursos.cnice.mec.es/biosfera/alumno/1bachillerato/organis/cont enidos6.htm některé patogenní bakterie chlamydie ­ množí se v cytoplazmě obratlovců, mají specifický životní cyklus, mohou způsobovat bronchitidu a záněty horních cest dýchacích Streptococcus pneumoniae ­ zánět mozkových blan Staphylococcus aureus ­ rozličné záněty Clostridium ­ tetanus, botulizmus Listeria