LÁTKOVÉ SLOŽENÍ ORGANISMŮ Úvod do biologie 1.r. Př 1/0/0 Doc. RNDr. B. Rychnovský, CSc. Kat. biologie PdF MU Živá hmota – skladba ze sloučenin odlišného charakteru než hmota neživá. Shodná prvková podstata Prvkové složení v jednoduché formě, jednoduchých, ale i složitých sloučeninách. Biogenní prvky - tj. prvky obsažené v živé hmotě - asi 60 A.1. Prvky ve větších množstvích: O - 65 %, C - 21 %, H - 10 %, N - 3 %, Ca -2%, P - 1 % 2. P. v malých množstvích: Cl, F, S, K, Na, Mg, (Al) 3. P. v nepatrných množstvích: Fe,Cu,I,Si,Mn,Zn,Br, B,Sr,Ti, Ba,F,Rb,Se,Mo, Hg,Ra) 4. P. ve stopách: As,Li,Pb,Sn,Co,Ni B. Makroelementy (1O - 1O-2) (po Fe) Mikroelementy (10-3 - 10-5) (po I) Ultramikroelementy (<10-5) (Hg, Ra a další) C. I. Invariabilní (ve všech živých organismech) a) makrobiogenní (1-60%) O,C,H,N,Ca,P b) oligobiogenní (0,05-1%) Mg,S,Cl,Na,K,Fe c) mikrobiogenní (<0,05%) Cu,Co,Zn,Mn,F,I,Mo II. Variabilní (jen u některých skupin) a) mikroprvky Br,Si,B b) stopové prvky Li,As D. Stálé prvky prvotní (1-60%) O,C,H,P (nepostradatelné) " " druhotné K,Na,Mg,Ca,Fe,S,Cl " " mikrosložky (100 Ak-zbytků). Stejně jako u polysacharidů jsou bílkoviny nepolární. peptid vazba Protaminy (bazické polypeptidy s mnoho argininem v mlíčí). Peptidové hormony hypofýzy (ocytocin a vasopresin), slinivky břišní (insulin, glukagon). Antibiotika a jedy (penicilin aj., faloidin, amanitin) peptid Akj ednodu Ak obec Ak kys Ak aromat Ak vzorce Ak nekód Esenciální (nepostradatelné) „lidské“ aminokyseliny: Valin, leucin izo-, treonin, metionin, lyzin, arginin tyrozin a tryptofan Aminokyseliny nepolární alanin valin isoleuci leucin fenylala tryptofa methioni prolin Aminokyseliny polární glycin threonin serin tyrosin asparagi glutamin cystein Aminokyseliny kyselé kysgluta kysaspar Aminokyseliny bazické lysin arginin histidin Primární struktura proteinů - posloupnost aminokyselin (kódovaných Ak, tj. určených genetickým kódem) v polypeptidovém řetězci. Nekódované (nestandardní) Ak vznikají dodatečnou změnou kódovaných, např. dva zbytky cysteinu se spojují disulfidickou vazbou na cystin, hydroxylace Sekundární struktura proteinu – prostorové uspořádání peptidického řetězce udržované vodíkovými můstky mezi karboxylovou a amino-skupinou &-helix šroubovice Β-struktura skládaného listu Terciární struktura – prostorové uspořádání dílčích úseků udržovaná vodíkovými můstky, elektrostatickými silami postranních skupin, disulfidickými vazbami. Význam: postranní řetězce nabývají jiné prostorové vztahy a vytváří ligandy, vazebná místa. Denaturace proteinů – změna prostorové struktury se ztrátou vazebných případně katalytických vlastností tj. ztráta biologické aktivity). Vratná (mírná) versus nevratná denaturace. Přechod z vysoce uspořádaného stavu do stavu „náhodného“ klubka (snadnější štěpení) Globulární bílkoviny (sféroproteiny) - rozpustné koloidní látky s polárními skupinami. Protáhlé molekuly koloidu – značná viskozita“ stav sol – tekutý → stav gel polotuhý. Nerozpustné bílkoviny (skleroproteiny – fibrin, β-kreatin, &-keratin, myosin, fibrinogen a kolageny). Funkce bílkovin: strukturální a stavební, energetická, mechanicko-chemická, informační a regulační, obranná. bílk strukt Další dusíkaté látky Alkaloidy - dusíkaté rostlinné sloučeniny většinou toxické pro živočichy. Meziprodukt vzniku nikotinu tabáku amid kyseliny nikotinové (vitamin řady B) je složkou koenzymů NAD (nikotinamid-adenin-dinukleotid) a NADP (n…fosfát) pro přenos vodíku v buňce alkaloidy Nukleotidy – trojsložková makroergní sloučenina (viz dál): ● N-cyklická báze (viz nukleové kysel.) ● pentóza (ribóza nebo deoxyribóza) ● kyselina trihydrofosforečná nukletid kompl nukleoti Další nepolární látky Zmíněné uhlovodíky – hlavně rostlinného původu. Odvozeny od izoprenu (2-metylbutadienu) Izoprenoidy vznikají kondenzací nejméně dvou pětiuhlíkatých jednotek – viz limonen z citrusů. Patří sem i karotenoidy (žlutá a červená barviva rostlin), významné i pro živočichy jako vitamin A. Od izoprenoidů odvozujeme i málo polární steroly. Živočišný cholesterol se vyskytuje v membránách. Odvozují se od něj živočišné steroidní hormony, žlučové kyseliny i vitamin D. Uh karot cholest Uh LIPIDY obecně jsou estery vyšších karboxylových kyselin (tuky, vosky, a složené lipidy jako fosfolipidy, lecitiny, kefaliny, sulfamidy, steroly, glykolipidy, lipoproteidy aj. Tuky jsou estery vyšších mastných kyselin (MK) a glycerolu. Nerozpustné ve vodě, nezbytná součást výživy živočichů, dlouhodobý a zásobní zdroj energie. Nasycené a nenasycené MK (s dvojnými vazbami). Nízký obsah kyslíku v molekule tuku. Vosky - estery jednosytných víceuhlíkatých alkoholů a MK. Stálejší než tuky. Rostlinné i živočišné vosky (včelí v. - myricin – ester k palmitové s myricialkoholem C30H61OH). Mastné kyseliny MK: Nasycené: Máselná 4C máslo (3-4 %) Kapronová 6C máslo, kozí mléko, kokosový o., palmový o. Kaprylová 8C dtto Kaprynová 10C dtto Laurová 12C tuk: vavřín (35), kokos (<50), palm. ořech Myristová 14C palmový olej (<47), kokos (<18), vorvaní tuk (16) Palmitová 16C palm.t. (<47), bavlněný o. (<23), kostní tuk (20), máslo (<29), sádlo (v. <32, h. <33) Stearová 18C lůj (<29), kost.t. (20), sádlo (<16), máslo (<11), palm.o. (<8) Arachová 20C o.podzemnicový (<4), řepkový o. behenová, lignocerová, feritová Nenasycené: Palmitoolejová 16C II rybí o., máslo (4) Olejová 18C II všechny oleje (80), tuky (30-50) Eruková 22C II o.řepkový (45-55), hořčič.(>30) Linolová 18C II.II o.(±50): lněný, mak.,slunečnic. Linolenová 18C II.II.II o. vysých.: (lněný, konopný) Eleostearová 18C II.II.II.II. dtto (čín.dřev.) Arachidonová 20C II.II.II.II. jater.tuky, fosfolipidy Klupanodonová 22C II.II.II.II.II rybí o., fosfolipidy K. linolová, linoleová a arachidonová nepostradatelné (esenciální) – vitamín „F“ Membránové lipidy – stavbou podobné tukům: dva dlouhé nepolární řetězce a silně polární skupina. Fosfolipidy – zbytek kyseliny trihydrofosforečné s malou polární organickou molekulou (třeba cholin) Glykolipidy – hexóza nebo polysacharid, s trisacharidem N-acatylglukosamin-galaktoza-fukóza (0) jsou součástí krevních skupin fosfolipid glykolipidy Nukleové kyseliny mají také nerozvětvený řetězec z nukleotidů. Základ nukleotidu tvoří cukr - pentóza (ribóza RNA nebo deoxyribóza DNA), fosfát (zbytek kyseliny fosforečné) a postranní (komplementární) dusíkaté báze Purinové: adenin A guanin G ││ │││ Pyrimidinové: tymin T cytozin C (uracyl U) Dvouřetězcový útvar mezi komplementárními řetězci s vazbami komplementárních bází je stočený do dvoušroubovice. Řetězce jsou antiparalelní. Stabilní. Denaturací se oba řetězce oddělí (tají). RNA: většinou jednořetězcová (někdy intramolekulární komplementární sekvence), méně dvouřetězcová DNA: jedno – čtyřřetězcová. Viry: jedno- a dvouřetězcová, buňky dvouřetězcová v podobě dvoušroubovice báze NK řetěz nukletid kompl nukleoti Makroergní nukleotidy (pro srovnání) replik transkripce transkripce translace K čemu? Replikace transkripce výsledná translace