Petra Pospíšilová
 je metoda využívaná v molekulární
biologii a evolučních vědách, která je založena
na předpokladu, že míra mutací v DNA či
v proteinu je za určitý čas přibližně konstantní.
 Díky tomu je možné odhadnout evoluční
vzdálenost, zpravidla mezi dvěma druhy.
 Mutace v kódující DNA se odráží v odlišné stavbě
aminokyselin, situace je však zkomplikována tím,
že ne všechny mutace se projeví na stavbě
proteinu (tzv. tiché mutace).
 Kromě toho tato metoda naráží na fakt, že
mutační rychlost je zřejmě velice proměnlivá.
Ve 4 liniích molekulární hodiny běží stejně rychle, přesto v časovém úseku
došlo v jednotlivých liniích k různému počtu substitucí.
Tabulka ukazuje rychlost chodu molekulárních hodin pro různé geny (počet
substitucí za rok).
Největším problémem je, že molekulární hodiny pro tentýž gen tikají
různě rychle u různých skupin. Rychlost chodu molekulárních hodin
se mění v evoluční linii.
 Zda je substituční rychlost napříč stromem
proměnlivá lze testovat pomocí ratio testu
 Při takovém testu porovnáváme dvě hypotézy
(složitější a jednodušší hypotézu)