A) Postup

















                             SSR a CAPS markery použité pro mapování ly

5. chromozom

         Název      Pozice  Typ    Polymorfismus (bp)       PCR cyklus

                                                Col              S96



*      CIW15   8,5 cM  SSR       177           72                         2

*      CIW17   9,0 cM  CAPS    2203     1228/805                14

*      nga 225 13,3 cM  SSR       119         189                        2

*      nga 76   68,4 cM  SSR                                            4

*      FM4      93,1 cM    CAPS       630/450  1100                     12



                                               Postup

45 vzorků DNA ly z F[2

]Kontroly: rodiče, F[1

]

*      Reakční směs pro SSR markery

*      ELFO



*      Reakční směs pro CAPS markery

*      Štěpení enzymem AccI 37 şC 3h -- CIW17

                                   AflII                --  FM4       

*      ELFO









                                    Využití mapovacího softwaru
                                             MapManager

Umožňuje

*      konstrukci genetických map

*      lokalizaci genů determinujících sledovaný znak

Co potřebujeme

*      Segregující populaci získanou křížením 2 rostlin odchylných fenotypů

*      Genetické markery (DNA)

*      Hodnocení znaku u rodičovských rostlin, F1 a v segregující populaci





                                               Úkoly

1. Určit počet genů determinujících   odolnost k padlí travnímu v uvedeném zdroji odolnosti ječmene,
statisticky ověřit

2. Určit typ dědičnosti genu/genů odolnosti

3. Určit SSR markery ve vazbě (použití SW)

4. Se kterými markery jsou vázány geny odolnosti (použití SW)

                    Genetická mapa Hordeum vulgare s lokalizovanými SSR markery