BIOLOGIE ROSTLIN FYZIOLOGICKÁ ČÁST Doplňkové materiály k přednáškovému kurzu pro posluchače oboru biochemie přírodovědecké fakulty MU v Brně Určeno výhradně pro studijní účely posluchačů Jan Gloser FYZIOLOGIE ROSTLIN studuje životní úkony (procesy) probíhající v rostlinách. Zahrnuje zejména: * problematiku růstových a vývojových procesů, včetně jejich vnitřní a vnější regulace. * problematiku příjmu a využívání vnějších zdrojů hmoty a energie (záření, oxid uhličitý, voda, minerální živiny) v metabolických procesech, * problematiku vzájemných vztahů rostlin s jinými organismy a způsoby přizpůsobení (adaptace) k nepříznivým faktorům prostředí. Hlavním cílem práce v oboru fyziologie rostlin je kvantitativní popis a predikce chování rostliny jako celku (systému) vycházející z fyzikálních a chemických zákonitostí. K tomuto účelu využívá kromě vlastních experimentálních dat i dílčí poznatky z biochemie, biofyziky, molekulární biologie a genetiky. Doporučená literatura k podrobnějšímu studiu: Gloser, J. (1998): Fyziologie rostlin. - Skripta určená především pro studenty biologických oborů naší fakulty. Jsou dostupná v elektronické podobě na internetových stránkách www.sci.muni.cz/~fyzrost. Procházka, S. et al. (1998): Fyziologie rostlin.- Podrobná česká učebnice. Teiz, L., Zeiger, E. (1998): Plant Physiology.- Asi nejlepší (americká) učebnice klasického typu s vyváženým obsahem. Lze si ji vypůjčit ve fakultní ústřední knihovně. Buchanan, B. B., Gruissem, W., Jones, R. L. (2000): Biochemistry and Molecular Biology of Plants.- Špičková americká učebnice obsahující (kromě jiného) i velmi detailní a bohatě ilustrovaný výklad některých témat ,,klasické" fyziologie rostlin. TRANSPORTNÍ PROCESY V ROSTLINÁCH Směr a rychlost toku vody (v celém systému půda ­ rostlina ­ atmosféra) je určován spádem chemického potenciálu vody. Voda tedy proudí z místa kde má vyšší chemický potenciál do místa s potenciálem nižším. Pro práci s rostlinami je výhodné používat upravené hodnoty chemického potenciálu vody, označované jako vodní potenciál. Vodní potenciál Definice: Vodní potenciál je chemický potenciál vody v systému, vyjádřený v jednotkách tlaku a srovnávaný s chemickým potenciálem čisté vody za atmosférického tlaku a téže teploty. = (v r - v o ) / Vv = vodní potenciál (obvykle v megapascalech, MPa) v r = chemický potenciál vody v roztoku (obecně v systému) v o = chemický potenciál čisté vody, Vv = molární objem vody (18,016 cm3 mol-1 ) Chemický potenciál se se běžně vyjadřuje v jednotkách energie - Joule, převod na jednotky tlaku je umožněn vztažením množství energie na jednotku objemu (tlak = energie / objem). Vzhledem k tomu, že za referenční hodnotu (,,0") byl zvolen chemický potenciál čisté vody, vodní potenciál roztoků mívá obvykle záporné hodnoty. Složky vodního potenciálu: V naprosté většině případů rozhodují o celkové hodnotě vodního potenciálu () jen dvě jeho složky: * tlak vody v uvažovaném místě (hydrostatický či turgorový tlak, p, zvyšuje hodnotu ) * množství rozpuštěných látek látek ve vodě (vyjádřené pomocí odpovídající hodnoty osmotického tlaku, , snižuje hodnotu ) = p ­ Doplňující poznámky k hodnotám vodního potenciálu * Hydrostatický tlak (p) při výpočtech vodního potenciálu (v souladu s uvedenou definicí) považujeme za nulový, pokud má stejnou hodnotu jako tlak vzduchu v okolní atmosféře. * Hodnoty vodního potenciálu v rostlinách se nejčastěji pohybují v rozmezí od nuly (=nejvyšší hodnota) do -3 MPa. * Podíl koncentrační (osmotické) a tlakové složky na celkové hodnotě vodního potenciálu se může v různých částech rostliny rychle měnit. * Osmotickým příjmem vody se může uvnitř buněk zvýšit hydrostatický tlak natolik, že zcela kompenzuje negativní působení rozpuštěných látek (snižujících vodní potenciál). Buňka jako osmotický systém Do buňky obklopené čistou vodou pronikají molekuly vody tak dlouho, dokud postupně se zvyšující vnitrobuněčný tlak (turgor) nezabrání jejich dalšímu průniku. Hodnota toho tlaku je pak numericky rovna hodnotě osmotického tlaku roztoků v buňce. Vodní potenciál buňky se turgorovým tlakem zvýší na maximální hodnotu (0 MPa), tedy shodnou s hodnotou vodního potenciálu čisté vody. Hlavní odchylky buňky od ideálního osmotického systému: * v okolí buňky nebývá čistá voda, ale také roztok (i když obvykle mnohem méně koncentrovaný), * buňka je částečně roztažná (i když většinou velmi málo), * plazmatická membrána není vždy dokonale polopropustná. Vnitřní řízení osmotických dějů v rostlinných buňkách a jeho význam * Rostlinné buňky mohou rychle měnit svůj osmotický tlak, a to především transportem iontů draslíku přes plasmatickou membránu v obou směrech, * Díky pevné buněčné stěně mohou rostlinné buňky zvýšit turgorový tlak (a tím i vodní potenciál) již při osmotickém příjmu velmi malého množství vody, * Osmoticky dosažené zvýšení hodnot vodního potenciálu zvyšuje rychlost biochemických procesů, * Osmoticky dosažené zvýšení turgoru je nutné pro zajištění mechanické pevnosti orgánů rostliny a je také nutnou podmínkou pro prodlužovací růst buněk. Příklady hodnot vodního potenciálu 1 M roztok glukózy -2,5 MPa 1 M roztok NaCl -4,4 MPa vlhká půda - 0,01 až - 0,05 MPa suchá půda (vadnutí rostlin) < -1,5 MPa kořeny mezofytních rostlin 0 až -1,5 MPa listy mezofytních rostlin 0 až -3 MPa vzduch při rel. vlhkosti 100 % 0 MPa vzduch při rel. vlhkosti 98 % -2,7 MPa vzduch při rel. vlhkosti 50 % -93,3 MPa Základní principy radiálního transportu vody * Při příčném (radiálním) toku od povrchu kořenů do xylému jsou hojně využívány i buněčné stěny, nicméně voda je nucena přestupovat i přes plasmatické membrány buněk (vzhledem k apoplastové transportní bariéře v endodermis). * Při transmembránovém transportu vody mají rozhodující úlohu transportní proteiny akvaporíny (na jejich množství závisí prostupnost membrán pro vodu). Základní principy xylémového transportu vody * Rychlost toku vody v xylému závisí na rozdílu tlaku na začátku a na konci transportní dráhy, a dále na vodivosti transportních cest. Vodivost cév a cévic exponenciálně roste s jejich vnitřním průměrem. * Tlakového rozdílu v xylému se dosahuje převážně silným snížením tlaku v mikrokapilárách buněčných stěn při zakončení xylému v listech. V xylému je tudíž téměř stále podtlak (=tlak menší než atmosférický). * Výjimečně se může dosáhnout tlakového rozdílu i osmoticky řízeným zvýšením tlaku v cévách kořenů (jako důsledek nahromadění solí v xylémové šťávě v nočních hodinách při zpomalení průtoku vody). Výsledný efekt se označuje jako kořenový vztlak vody. * Z energetického hlediska je tok vody rostlinou zajišťován převážně tepelnou energií spotřebovávanou na výpar vody z nadzemních orgánů Příklady maximálních rychlostí toku vody v xylému u různých skupin rostlin Jehličnaté stromy 1 - 2 m h-1 Listnaté stromy s úzkými cévami 2 - 6 m h-1 Listnaté stromy s širokými cévami 20 - 45 m h-1 Byliny 10 - 60 m h-1 Liány 150 m h-1 Funkční schéma xylému: silný podtlak vytvářený hustou sítí velmi úzkých kapilár v buněčných stěnách při zakončení xylému v listech se přenáší do širších kapilár stonkového xylému s velkou hydraulickou vodivostí. Zajištění spolehlivosti funkce xylému Základním předpokladem funkce transportní funkce xylému je celistvost sloupečků vody v cévách. I přes silnou soudržnost (kohezi) molekul vody může dojít k jejich narušení (např. bublinkou plynů ­ plynová embolie, kavitace). Existují rozmanité zabezpečující mechanismy, např.: * zamezení expanze bublinky pomocí perforovaných přepážek a vytvoření transportního obchvatu poškozeného místa, * scelení přetržených sloupečků dočasným vytvořením přetlaku v cévách (osmoticky - např. kořenovým vztlakem v nočních hodinách, či lokálním transportem osmotik do poškozené cévy), * udržování nadbytečné (předimenzované) transportní kapacity, * tvorba cév a cévic s různým vnitřním průměrem a složitým směrováním, * stálá tvorba nových cév a cévic (pomocí sekundárních meristémů). Specifické znaky transportu v lýku (rozdíly od transportu v xylému): * transportní cestou jsou živé buňky (sítkovice), * transport není jednosměrný, je možný všemi směry, * transportují se velmi koncentrované roztoky, hlavně organických látek, * transport je relativně pomalý (0,2 až 1 m h-1), * transport je řízen metabolickými procesy, * v lýku je stálý přetlak (o 2 až 3 MPa vyšší než atmosférický tlak). Hlavní transportované látky v lýku * cukry (hlavně sacharóza, ale i jiné neredukující oligosacharidy, až 150 g l-1), * aminokyseliny, např. glutamová, asparagová, serin, až 15 g l-1 * organické kyseliny, např. jablečná, citronová, aj., * adenyláty (ADP, ATP), fytohormony a jiné organické látky s regulační funkcí, * ionty solí (zejména K+), * lýkem se snadno šíří po rostlině i viry !!! Strukturní zvláštnosti sítkovic * neobsahují jádro, cytoskelet, ribosomy a diktyosomy (Golgiho aparát), * mají silně redukované plastidy a mitochondrie, * obsahují specifické metabolity (P-protein v oblasti sítek, kalóza) * články sítkovic jsou navzájem propojeny hustou sítí pórů bez membrány, * sítkovice tvoří jeden funkční celek s průvodními buňkami, se kterými jsou propojeny hustou sítí plasmodesmat. * Průvodní buňky jsou vysoce metabolicky aktivní (mají mnoho mitochondrií a ribosomů, ale jen malé vakuoly). Vnitřní struktura sítkovic a průvodních buněk lýka průvodní buňka sítkovice sítkovice sítkovice sítkovice floémový protein průvodní buňka mitochondrie protein sítkovicové plastidy endoplasm. mitoretikulum chondr. cc plastidy Základní rysy tlakové teorie transportu v lýku Apoplastová cesta naplňování lýka buněčná stěna tok sacharózy Hlavní znaky apoplastové cesty * buňky lýka nejsou spojeny s okolními buňkami pomocí plasmodesmat, * průvodní buňky lýka mají zvětšený povrch a velkou hustotu transportních proteinů pro sacharózu v plazmatické membráně (symport s H+), * má vysokou kapacita transportu (i za chladu a jiných stresových stavů), * vyskytuje se u evolučně mladších taxonomických skupin rostlin. Hlavní znaky symplastové cesty: * hojná plasmodesmata na rozhraní mezofyl - lýko, která jsou propustná jen pro malé molekuly, * udržování nízké koncentrace sacharózy v lýku (a tím i koncentračního spádu pro transport z mezofylu) rychlou konverzí do složitějších cukrů (rafinóza, stachyóza, manitol), * vytvořené složitější cukry nemohou projít přes plasmodesmata zpět do mezofylu, proto zůstávají v lýku (,,polymerační past"), * má poměrně malou transportní kapacitu, je citlivá na chlad, * vyskytuje se hlavně u evolučně starších druhů rostlin (řada druhů stromů, keřů a teplomilných bylin). Symplastová cesta naplňování lýka Hlavní transportní cesty plynů * průduchové štěrbiny (umožňují také regulovat rychlost toku!) * interceluláry Transport plynů přes kutikulu, buněčné stěny, membrány a buněčné roztoky (cytosol) je možný, ale je mnohem pomalejší než v intercelulárách. Hlavní mechanismus transportu plynů * difuse (nikoli tedy hromadný tok jako v případě transportu látek v lýku či xylému, neboť nelze obvykle vytvořit tlakový rozdíl) Strukturní zvláštnosti svěracích buněk (ve srovnání s ostatními buňkami pokožky) * na ploše vzájemného styku nemají srostlé buněčné stěny, * buněčné stěny jsou nerovnoměrně zesílené a s příčnou orientací mikrofibril celulózy, * v buněčných stěnách nemají plasmodesmata, * v plasmatické membráně mají velký počet iontových kanálů, * obsahují chloroplasty a zvýšený počet mitochondrií, * mají velký obsah enzymu fosfoenolpyruvát karboxylázy Mechanická stránka pohybů průduchů * k otevření průduchů dochází po zvýšení turgorového tlaku ve svěracích buňkách, které je nezávislé na turgorovém tlaku okolních buněk, * zvýšení turgoru svěracích buněk je způsobeno osmotickým příjmem vody, * rozevření svěracích buněk při zvýšení jejich turgoru je podmíněno zvláštní stavbou buněčných stěn a uložením svěracích buněk mezi buňkami epidermis. Biochemické procesy spojené s pohybem průduchů * osmotickému příjmu vody předchází zvýšení osmotického tlaku svěracích buněk příjmem iontů K+ z okolí (po otevření draslík. kanálů v plazmalemě), * rychlý přesun iontů K+ je podmíněn vysokým spádem elektrického potenciálu, vytvořeného náhlou aktivací protonových pump v plazmalemě. * úbytek vodíkových iontů v cytosolu svěracích buněk je kompenzován tvorbou organických kyselin, hlavně kys. jablečné (biochemický pH-stat). Podněty (signály) řídící pohyby průduchů záření: * přímý vliv - k otvírání dochází po absorpci modré složky záření flavoproteinovými receptory (kryptochrom) přímo v plazmatické membráně svěracích buněk, * nepřímý vliv - fotosyntéza aktivovaná zářením sníží v okolí svěracích buněk koncentraci CO2 Podněty řídící pohyby průduchů (pokračování) koncentrace CO2 v listu: * k otvírání průduchů dochází při poklesu koncentrace CO2 v listu, zvýšení koncentrace CO2 vede k zavírání průduchů. * ke změnám v koncentraci CO2 dochází v důsledku kolísání rychlosti metabolických procesů (fotosyntézy a dýchání). * citlivost svěracích buněk k CO2 umožňuje nastavit otevřenost průduchů (a tím i rychlost toku CO2 do listu) podle aktuální potřeby fotosyntézy a zabránit tak zbytečným ztrátám vody. Podněty řídící pohyby průduchů (pokračování) stav vody v rostlině: * pokles turgorového tlaku turgoru v buňkách mezofylu listu vyvolá rychlou tvorbu fytohormonu kyseliny abscisové (ABA) * ABA inhibuje činnost protonových pump ve svěracích buňkách, což vede k výtoku draslíkových iontů ze svěracích buněk, a tím i k zavírání průduchů. * k tvorbě ABA dochází za nedostatku vody i v kořenech a po transportu do listů také může vyvolat zavírání průduchů (dálková signalizace nedostatku vody). METABOLICKÉ PROCESY V ROSTLINÁCH Chloroplast jako dějiště fotosyntézy u eukaryotních rostlin list buňky mezofylu chloroplast thylakoid thylakoidní membrána chloroplast Organizace hlavních proteinových komplexů v thylakoidní membráně CYTOCHROMOVÝ KOMPLEX FOTOSYSTÉM I FOTOSYSTÉM II ATP-SYNTÁZA vnější strana thylakoidu (stroma) vnitřní strana thylakoidu (lumen) FOTOSYSTÉM II CYTOCHROMOVÝ FOTOSYSTÉM I ATP KOMPLEX SYNTÁZA 2 2 22 2e- 2e- 2e2 fotony 2e2 fotony 3H+ 3 FOTOSYSTÉM II (PS II) (asi 20 polypeptidů, hlavně v přitisklé části membrán) Hlavní složky: jádro fotosystému centrální proteiny D1 a D2 s aktivní molekulou chlorofylu P680 a s redoxními přenašeči (feofytin, chinony QA, QB ), anténa jádra (proteiny s celkem asi 50 molekulami chlorofylu a) vnější anténa (proteiny s celkem asi 100 molekulami chlorofylu a + b, 1:1) centrum fotolýzy vody (4 periferní proteiny, klastr 4 atomů Mn, +Ca2+, Cl-) Funkce: * rezonanční transport excitonů k reakčnímu centru (P680), * uvolnění elektronů z aktivních molekul chlorofylu a v reakčním centru (P680), * redoxní transport uvolněných elektronů na plastochinony v membráně, * doplňování elektronů v P680 štěpením (oxidací) vody. Schéma Q- cyklu v cytochromovém komplexu 2H+ e- e- H+ PQH2 e- PQH2 PQ PQ plastocyanin FOTOSYSTÉM I (PS I) (asi 16 polypeptidů, jen ve volné části membrán) Hlavní složky: jádro fotosystému: - centrální proteiny A a B s aktivním chlorofylem P700 a s redoxními přenašeči (fylochinon, Fe-S proteiny), - anténa jádra - proteiny s celkem asi 100 molekulami chlorofylu a vnější anténa: proteiny s celkem asi 100 molekulami chlorofylu a + b, 1:1. Funkce: * rezonanční transport excitační energie k reakčnímu centru, * uvolnění elektronů z aktivních molekul chlorofylu a v reakčním centru (P700), * redoxní transport elektronů na feredoxin (a z něho pak hlavně na NADP), * doplňování elektronů v P700 z plastocyaninu ( transport z fotosystému II). FEREDOXIN Fe-S protein, první vnější akceptor elektronů z fotosystému I na jeho redukované formě jsou závislé tyto reakce v plastidech: * redukce NADP na NADPH (+ feredoxin-NADP oxidoreduktáza) * redukce dusitanů na amoniak (+ nitritreduktáza) * tvorba glutamátu z glutaminu a -ketoglutarátu,(+ glutamátsyntáza) * tvorba redukovaného thioredoxinu (+ thioredoxin reduktáza) V případě nedostatku akceptorů může předávat elektrony na: * plastochinony (= cyklický transport elektronů tvorba ATP), * kyslík (= Mehlerova reakce, je spojena s tvorbou superoxidu, který je rychle rozkládán superoxiddismutázou, a vznikajicí peroxid vodíku je dále rozložen systémem askorbát - askorbátperoxidáza). Hlavní mechanismy chránící fotosyntetický aparát před poškozením nadměrným zářením Přesun vnějších antén od fotosystému II k fotosystému I Vysoce redukovaný stav plastochinonů a cytochromového komplexu za nadměrné ozářeností listu je signálem pro aktivaci LHCII proteinkinázy a tím i k fosforylaci anténních proteinů a ke ztrátě jejich vazby na fotosystém II. Xanthofylový cyklus (tvorba zeaxanthinu z violaxanthinu) Velký rozdíl v pH mezi vnější a vnitřní stranou thylakoidu za nadměrné ozářenosti listu (hromaděním vodíkových iontů uvnitř thylakoidů) je signálem pro aktivaci deepoxidázy a tím i ke konverzi violaxanthinu na zeaxanthin. Zeaxanthin převádí excitační energii pouze na tepelnou. Celá reakce je velmi rychlá a snadno vratná. Alternativní transport elektronů z feredoxinu na kyslík a následný rozklad vznikajícího superoxidu pomocí askorbátglutationového cyklu. Redukční pentózofosfátová cesta = Calvinův cyklus = C3 cesta (velmi zjednodušené schéma hlavních částí) a) karboxylace: CO2 + ribulóza-1,5-bisfosfát (2x) 3-fosfoglycerát b) redukce: [+ 2 ATP] (2x) 1,3-bisfosfoglycerát [+ 2 NADPH] (2x) glyceraldehyd-3-fosfát [ dihydroxyacetonfosfát] (= triózafosfáty). Jsou využity: ˇ k exportu z chloroplastu * k tvorbě škrobu v chloroplastu * k regeneraci ribulóza-1,5-bisfosfátu c) regenerace: [+ 1 ATP] ribulóza-1,5-bisfosfát + enzym ,,RUBISCO" Hlavní karboxylační enzym ribulóza-1,5-bisfosfátkarboxyláza / oxygenáza ("Rubisco") * je katalyticky málo účinná a velmi pomalá (3 molekuly CO2 s-1 k.m.-1) * je daleko nejhojnějším enzymem [v listech rostlin (> 50%), i na Zemi] * je složena z 8 malých podjednotek kódovaných v jádře a z 8 velkých podjednotek kódovaných v plastidové DNA * na stejný substrát (RUBP) přenáší CO2 (75%) i O2 (25%) * je aktivována: ˇ světlem (+ Mg2+ a CO2 - karbamylace) * enzymem Rubisco-aktivázou (+ inhibitor: karboxyarabinitol-1-P, tvoří se ve tmě) Fotorespirace (= glykolátový cyklus = C2 cyklus ) (velmi zjednodušené schéma hlavních částí) chloroplast: O2 + ribulóza-1,5-bisfosfát (1x) 3-fosfoglycerát Calvinův cyklus + (1x) fosfoglykolát glykolát [+ 1 ATP] peroxizómy: glykolát glycerát oxidace [+1 NADH] glyoxylát hydroxypyruvát transaminace transaminace glycin serin mitochondrie: glycin (2x) serin (1x) + NH3+ C02 glycindekarboxylázový komplex chloroplast mitochondrieperoxisom DŮSLEDKY FOTORESPIRACE * snižuje potenciální rychlost fixace CO2 asi o 25% (= takovým podílem pracuje Rubisco za normální konc. plynů ve vzduchu jako oxygenáza), * vede ke ztrátě uhlíku (uvolněním CO2) a energie (spotřeba ATP a NADH) * vede k tvorbě metabolicky využitelného glycinu a serinu. KE ZVÝŠENÍ PODÍLU OXYGENÁZOVÉ AKTIVITY RUBISCO DOCHÁZÍ: * při snížení koncentrace CO2 ve vzduchu, * při zvýšení koncentrace O2 ve vzduchu, * při zvýšení teploty listu (zvýší se poměr koncentrací O2 / CO2) Fixační cesta C4 (malátová varianta) (velmi zjednodušené schéma hlavních částí) buňky mezofylu: HCO3 - + fosfoenolpyruvát (PEP) cytosol oxalacetát chloroplast malát buňky pochvy cévních svazků: malát chloroplast CO2 + pyruvát Calvinův cyklus PEP-karboxyláza RUBISCO Malátová (A) a aspartátová (B) varianta fixační cesty C4 A mezofylová buňka buňka pochvy cévních svazků B ZVÝŠENÍ ÚČINNOSTI FIXACE CO2 JE DOSAŽENO * vysokou afinitou PEP-karboxylázy k HCO3 * vyšší účinností karboxylace v Calvin. cyklu (potlačením fotorespirace): - vyšší koncentrací CO2 v chloroplastech buněk okolo cév. svazků (asi 5x víc než v atmosféře), - sníženou koncentrací kyslíku v buňkách okolo cévních svazků VÝHODY CESTY C4 SE UPLATŇUJÍ: * za vyšší teploty (není fotorespirace, tudíž se ani nezvyšuje její vliv), * za nedostatku vody (rychlejší difuse CO2 i při přivřených průduších, menší výpar vody při stejném příjmu CO2 než u rostlin s cestou C3, * za dostatku záření. Fixační cesta CAM (velmi zjednodušené schéma hlavních částí) NOC: HCO3 - + fosfoenolpyruvát (PEP) cytosol oxalacetát chloroplast malát vakuola kyselina jablečná DEN: malát chloroplast CO2 + pyruvát Calvinův cyklus SPECIFICKÉ ZNAKY CESTY CAM (odlišné od cesty C4): * oba karboxylační enzymy (RUBISCO, PEP-karboxyláza) jsou v téže buňce, * PEP-karboxyláza je aktivní jen za tmy (!!!), světlem je inaktivována, * je nutné ukládat v noci tvořený malát do vakuoly a ve dne jej rozkládat, * je nutné vytvářet v noci fosfoenolpyruvát (glykolýzou ze sacharidů), * je možná i přímá fixace CO2 ze vzduchu (ve dne) Calvinovým cyklem. VÝHODY FIXAČNÍ CESTY CAM: * umožňuje velmi podstatně snížit ztráty vody při příjmu CO2 (příjem CO2 může probíhat jen v noci, kdy je vlhký vzduch a tudíž malý výpar vody), * vysoká účinnost Calvin. cyklu (potlačení fotorespirace, stejné jak u C4), * možnost fixace CO2 ve dne i v noci (zabránění ztrát uhlíku z respiračních procesů, přežívání dlouhých nepříznivých období bez ztrát uhlíku a energie). Zvláštnosti respiračních procesů u rostlin INTERAKCE S FOTOSYNTÉZOU: využívání enzymů Calvinova cyklu pro oxidační pentózofosfátovou cestu, využívání triózafosfátů a NADPH z chloroplastů pro respirační procesy, využívání glycinu z fotorespiračních procesů k oxidaci v mitochondriích. ÚČAST NA ASIMILACI ANORGANICKÉHO DUSÍKU: tvorba oxoglutarátu v mitochondriích (meziprodukt citrátového cyklu), který slouží jako substrát pro zabudování amoniaku (NH3) do aminokyselin. OCHRANNÉ FUNKCE: schopnost oxidovat NAD(P)H s velmi malým výtěžkem ATP umožňuje: udržovat rovnováhu mezi ATP a NAD(P)H při jejich rozdílné spotřebě, udržovat v chodu primární procesy fotosyntézy i při malé rychlosti syntetických procesů, a tím chránit chloroplasty před poškozením. Význam respiračních procesů pro tvorbu nové biomasy Při růstu nových orgánů je nutno z jednoduchých produktů asimilace uhlíku (cukrů) syntetizovat složitější organické látky (např. polysacharidy, bílkoviny, tuky). Při těchto syntézách je nutno dodávat chemickou energii (hlavně ve formě ATP), neboť: složitější látky mají větší obsah volné chemické energie (nutno ji dodat), chemické přeměny nemají 100% účinnost, vždy jsou ztráty (10-20%), syntéza nových látek je spojena s energeticky náročnými transportními procesy (příjem živin, transmembránové přesuny metabolitů), syntéza organických dusíkatých látek je spojena s výdejem energie i na asimilaci anorganických zdrojů dusíku (NO3 -, NH4 +). Význam respiračních procesů pro udržování vytvořené biomasy Kromě energetické podpory syntetických procesů při tvorbě nové biomasy je nutno trvale vynakládat energii i na údržbu stávajících (nerostoucích) struktur: obměna nefunkčních proteinů: asi 2 až 5% všech proteinů je potřeba denně nahradit (náklady asi 4 až 5 ATP na jednu peptidovou vazbu, asi 75% aminokyselin z degradovaných proteinů se recykluje, 25% se musí znovu syntetizovat!). udržování iontových a potenciálových gradientů na membránách. Studium fotosyntetické fixace CO2 a respirace na úrovni orgánů a celých rostlin K ČEMU HLAVNĚ SLOUŽÍ: k posuzování produkčních schopností rostlin (aktuálních i potenciálních) a jejich závislosti na vnitřních (genotypových) a vnějších faktorech, k indikaci stresových stavů rostlin. JAK SE OBVYKLE PROVÁDÍ: nejvíce nás zajímá rychlost fotosyntetické fixace a respiračních procesů, které odvozujeme z měření rychlostí příjmu a výdeje CO2 , nejdůležitější informace o stavu fotosyntetického a respiračního aparátu odvozujeme z měření funkčních závislostí rychlosti výměny CO2 na množství záření (tzv. ,,světelná křivka") a na teplotě. Interpretace světelných křivek čisté fixace CO2 Sklon počátečního (lineárního) úseku světelné křivky indikuje účinnost fotochemických procesů ­ lze ji vyjádřit jako kvantový výtěžek fixace CO2 = počet molů fixovaného CO2 na jeden mol absorbovaných fotonů (max. hodnota teoreticky 0,12, prakticky 0,08) Maximální rychlost fotosyntetického příjmu CO2 (při nasycení zářením) je dána kapacitou biochemických procesů, zejména: * množstvím a aktivitou enzymů zapojených do fixace CO2, * rychlostí přísunu CO2 z vnějšího vzduchu do chloroplastů, * rychlostí odsunu asimilátů z chloroplastu k dalšímu využití. Přeměny hlavních forem dusíku v půdě N2 NH3 N2 , NOx fixace volatilizace denitrifikace organické formy dusíku NH4 + NO3 - (Thiobacillus denitrificans) (Nitrosomonas sp.) (Nitrobacter sp.) amonifikace nitrifikace příjem a asimilace kořeny rostlin a mikroorganismy (immobilizace) Symbiotická (hlízková) fixace dusíku PRŮBĚH VZNIKU SYMBIOTICKÉ VAZBY: 1. vylučování druhově specifických flavonoidních látek z kořenů hostitelské rostliny, 2. specifické reakce vyvolané flavonoidy u vhodného druhu bakterií: - chemotaxe (chemicky vyvolaný pohyb směrem ke kořenům), - indukce exprese skupiny nod- genů , což vede ke tvorbě specifických oligosacharidů typu lipochitinů, označovaných jako nod- faktory 3. specifické reakce pod vlivem nod- faktorů v hostitelské rostlině : - tvorba lectinů (= proteiny s vazebnými místy pro sacharidy) na povrchu kořenových vlásků - usnadňují vazbu a průnik bakterií do kořene, - tvorba specifických proteinů nodulinů v kořenech (jsou nutné pro tvorbu hlízek a zabezpečení fixačního procesu), 4. průnik bakterií do buněk kůry infekčním vláknem, růst hlízek, 5. tvorba bakteroidů (= zapouzdřených bakterií) a leghemoglobinu v hostitelských buňkách, 6. vlastní fixace N2 Biologická fixace molekulového dusíku SOUHRNNÁ ROVNICE: N2 + 8 e- + 8 H+ + 16 ATP 2 NH3 + H2 +16 ADP + 16 Pi enzym nitrogenáza (Fe- protein + Mo-Fe- protein, je nevratně poškozován kyslíkem!) Vzniklý amoniak difunduje z fixačních bakterií do kořenových buněk, kde je dále zabudován do organických forem N (aminokyseliny, amidy, ureidy). Náklady na fixaci N2: 960 kJ mol-1 fixovaného N2 Asimilace nitrátových iontů může probíhat ve všech částech rostliny, nitráty lze transportovat a skladovat 1. krok - redukce nitrátu na nitrit (dusitan) (v cytosolu): NO3 - + 2e- + 2H+ NO2 - + H2O - donor elektronů : NADH - enzym: nitrátreduktáza (redox. skupiny: FAD, hem, Mo- komplex) 2. krok - redukce dusitanu na amonný iont ( v plastidech): NO2 - + 6e- + 8H+ NH4 + + 2H2O - donor elektronů : feredoxin - enzym: nitritreduktáza (redox. skupiny: Fe-S, hem) Asimilace amonných iontů - po příjmu iontů NH4 + z půdy probíhá asimilace hned v kořenech (NH4 + nelze obvykle transportovat a skladovat!) - po syntéze NH4 + z nitrátů probíhá jejich další asimilace v téže buňce. Nejčastější cesta: glutamát + NH4 + glutamin glutaminsyntetáza (GS, v cytosolu) glutamin + oxoglutarát 2x glutamát glutamátsyntáza (GOGAT, v plastidech) reduktant - feredoxin (v listech), NADH (v kořenech) FOSFOR PŘÍJEM FOSFORU ROSTLINAMI Z PŮDY obvykle aktivně, ve formě hydrogen- či dihydrogenfosforečnanových iontů (HPO4 2- , H2PO4 - ). * anorganické půdní zdroje: Ca-fosfáty (apatity) a Al-fosfáty, málo rozpustné, * organicky vázané fosfátové ionty v půdní organické hmotě, uvolňují se mikrobiálním rozkladem. SKLADOVÁNÍ FOSFORU V ROSTLINÁCH * zásobní fosfátové ionty ve vakuolách, * polyfosfáty a fytáty v semenech FUNKCE FOSFORU V ROSTLINÁCH * stavební součást nukleových kyselin, fosfolipidů (ester. vazby), * aktivace enzymů (fosforylace pomocí proteinkináz), * přenosy chemické energie (pomocí makroerg. vazeb, např. v ATP), * přímá regulační funkce (vyšší konc. fosfát. iontů stimuluje rychlost fotosyntézy, respirace, translokaci asimilátů z chloroplastu, atd.). PROJEVY NEDOSTATKU FOSFORU (zvláště časté u rostlin rostoucích na alkalických půdách!) * zpomalení růstu všech orgánů narušením energetického metabolismu (obsah proteinů a chlorofylu na jednotku biomasy se obvykle nemění!) * vývojové a morfogenetické poruchy (malá tvorba květů, plodů semen) SÍRA PŘÍJEM SÍRY ROSTLINAMI * nejčastěji aktivní, ve formě síranových iontů (SO4 2-) z půdy, * může být asimilován i oxid siřičitý přijímaný listy ze vzduchu, * síranové ionty jsou snadno transportovány a skladovány. REDUKCE SÍRANŮ (probíhá převážně v chloroplastech): SO4 2- + 8e- + 8H+ + ATP S2- + 4 H2O + AMP Síranový iont se ještě před vlastní redukcí navazuje na ATP. Donor elektronů: hlavně feredoxin, (ale i red. glutathion či NADPH) Hlavní enzym: sulfitreduktáza První produkt redukce: cystein (z něho pak methionin) HLANÍ FUNKCE SÍRY V ROSTLINÁCH * stavební součást aminokyselin cysteinu a metioninu, * glutation (tripeptid: glutamát + cystein + glycin) je nejhojnější látkou s obsahem síry v rostlinách. Slouží hlavně jako antioxidační substrát v chloroplastech, dále jako prekurzor pro syntézy jiných látek (fytochelatiny!), má i skladovací funkci. * stavební součást řady sekundárních metabolitů (např. silice u brukvovitých, u česneku, cibule aj. - vesměs jde o látky s antimikrobiálním účinkem), * redoxní systémy typu Fe-S, DRASLÍK PŘÍJEM DRASLÍKU ROSTLINAMI * příjem ve formě iontů K+, může být aktivní i pasivní, * v cytoplazmě buněk bývá K+ ve velmi vysoké koncentraci (100-200 mM). * je mimořádně pohyblivý, často se retranslokuje. HLAVNÍ FUNKCE DRASLÍKU V ROSTLINÁCH * aktivátor mnoha enzymů (navozuje optimální konformační stavy, a to hlavně působením na hydratační obaly), * hlavní osmotikum (látka se schopností rychle měnit osmotický tlak v buňkách a tím ovlivňovat např. pohyby průduchů a dlouživý růst), * doprovodný iont při transportech aniontů (např. v lýku), * není stavební součástí žádné významné složky rostlin. VÁPNÍK PŘÍJEM VÁPNÍKU ROSTLINAMI * příjem jako iont Ca2+, obvykle pasivní (iontovými. kanály), * transport jen xylémem, retranslokace je minimální, * ukládá se v buněčných stěnách, ve vakuole a v ER, v cytosolu je koncentrace Ca2+ velmi nízká (0,1- 0,2 M) HLAVNÍ FUNKCE VÁPNÍKU V ROSTLINÁCH * stabilizace buněčné stěny (tvorbou Ca- pektátů), * stabilizace membrán (Ca- můstky u fosfolipidů), * tvorba slizu, kalózy a dalších sekretů, * aktivátor mnoha enzymů (Ca2+ ionty jsou přenášeny ve vazbě na specifický protein calmodulin), * druhotný přenašeč (mediátor) signálů. HOŘČÍK PŘÍJEM HOŘČÍKU ROSTLINAMI * příjem jako iont Mg2+, obvykle pasivní (iontovými. kanály), * je veden v xylému i ve floému, snadná retranslokace, * v místě funkce je vázán jak iontově, tak i kovalentně. HLAVNÍ FUNKCE HOŘČÍKU V ROSTLINÁCH * strukturní vazby (chlorofyl, buněčné stěny, ribozómy) * účast při enzymových reakcích ­ aktivace, kofaktor (např. ATPázy, fosfatázy, Rubisco, PEP-karboxyláza), * účast při syntéze proteinů (agregace ribosomů), * účast při konverzi a translokaci asimilátů. REGULACE RŮSTOVÝCH PROCESŮ U ROSTLIN ROSTLINNÝ HORMON (fytohormon) = organická sloučenina, která po syntéze v jedné části rostliny je transportovaná do jiné její části, kde již ve velmi malé koncentraci (10-12 -10- 6 M) způsobuje fyziologickou reakci. Hlavní skupiny fytohormonů: * auxiny, * cytokininy * gibereliny * kyselina abscisová * etylén * brassinosteroidy Další, méně významné skupiny fytohormonů: jasmonáty, polyaminy a řada fenolických látek. AUXINY kyselina indolyl-3-octová: další, méně časté auxiny: kyselina fenyloctová kyselina 4-chlorindolyloctová kyselina indolyl-3-máselná Fyziologické účinky auxinů: regulace buněčného cyklu (zvyšují rychlost replikace DNA), řízení (stimulace i inhibice) dlouživého růstu buněk, a tím i procesů závislých na dlouživém růstu, např. fototropismus a gravitropismus, řízení mnoha morfogenetických procesů (např. stimulace tvorby bočních a adventivních kořenů, větvení stonku, diferenciace vodivých pletiv, aj., stimulace tvorby etylénu (a tím i procesů řízených koncentrací etylénu, např. zrání plodů, stárnutí listů). Hlavní mechanismy působení auxinů: aktivace protonových pump v plazmatické membráně, což má za následek: - snížení pH v buněčné stěně a tím i zvýšení její roztažnosti (elasticity), - zrychlení toku iontů draslíku do cytosolu a tím i zvýšení turgorového tlaku, regulace genové aktivity (na úrovni transkripce). CYTOKININY 6-(4-hydroxy-3-metylbut-2-enylamino)purin zeatin a) izoprenoidní: CYTOKININY b) aromatické: benzyladenin meta-topolin =(m-OH) benzylaminopurin(= benzylaminopurin) Biosyntéza cytokininů: z ATP či ADP připojením různých bočních řetězců (celkem je známo asi 30 různých typů cytokininů). Hlavním místem syntézy jsou kořeny, které kryjí i většinu potřeby nadzemních částí. Fyziologické účinky cytokininů: regulace buněčného cyklu (zrychlení replikace DNA, iniciace mitózy), stimulace tvorby pupenů (a tudíž i větvení stonku), zpomalují procesy stárnutí (např. rozklad chlorofylu), usměrňují transport asimilátů (do míst s vyšší koncentrací cytokininů). Mechanismus působení cytokininů: selektivní stimulace genů pro tvorbu proteinů, antioxidační ochrana lipidů v membránách. Praktické využití účinků cytokininů : stimulace růstových procesů včetně klíčení (ve směsi s auxiny), zpomalení stárnutí a vadnutí řezaných květin, zrychlení translokace asimilátů do zásobních orgánů, plodů a semen, indukce tvorby pupenů a lodyh v tkáňových kulturách. GIBERELINY Biosyntéza giberelinů: z kyseliny mevalonové (podobně jak u všech terpenů), celkem je známo několik desítek giberelinů s 18 -20 uhlíky v kruhových systémech a s nejméně jednou karboxylovou skupinou. Hlavním místem syntézy jsou mladé listy a dozrávající semena. Fyziologické účinky giberelinů: stimulace dlouživého růstu buněk, zejména u stonků, stimulace tvorby hydrolytických enzymů při klíčení semen (např. amylázy). Mechanismus působení giberelinů: udržování vysoké roztažnosti (elasticity) buněčné stěny, na rozdíl od auxinů ale bez změny pH, spíše zpomalením ztužovacích procesů. selektivní aktivace genů pro tvorbu proteinů (zejména hydrolytických enzymů, na úrovni transkripce). Praktické využití účinků giberelinů: stimulace klíčení semen, odstraňování dormance semen a pupenů, zvětšení rozměrů částí rostlin (např. plodů, a tím i jejich úložné kapacity), inhibitory syntézy giberelinů se používaly jako růstové retardanty (zejména k dosažení kratších stébel u obilí, odolnějších k poléhání). KYSELINA ABSCISOVÁ (ABA) Fyziologické účinky kyseliny abscisové: zastavuje růst embrya v dozrávajících semenech, zpomaluje dlouživý růst buněk mladých orgánů při vstupu do dormance, udržuje pupeny a semena v dormantním stavu, zvyšuje odolnost rostlin k různým typům stresů, zrychluje stárnutí a degradační procesy. Mechanismus působení kyseliny abscisové: selektivní aktivace genů pro tvorbu stresových proteinů, inhibice činnosti protonových pump ( tok K+ z cytosolu pokles turgoru zastavení dlouživého růstu (u svěracích buněk vede pokles turgoru vlivem ABA k zavírání průduchů!), inhibice tvorby celé řady enzymů (např. hydroláz v semenech). Praktické využití účinků kyseliny abscisové: udržování hlíz (zejména bramborů) v dormantním stavu (bez prorůstání lodyh), zvyšování celkové odolnosti rostlin vůči nepříznivým faktorům prostředí (mráz, sucho, zasolení půdy aj.). ETYLÉN Fyziologické účinky etylénu: inhibice dlouživého růstu buněk (zejména u stonků, současně dochází ke tloustnutí), zrychlení procesů stárnutí (a tím i rychlejší vadnutí květů), zrychlení zrání plodů, opadávání plodů a listů, tvorba intercelulár v kořenech zaplavených rostlin, zvýšení odolnosti rostlin vůči většině stresových faktorů. Mechanismus působení etylénu: zvyšuje neřízenou propustnost membrán ( ztráta turgoru zastavení dlouživého růstu, vadnutí květů), aktivace genů pro tvorbu hydrolytických enzymů (např. celulázy, pektinázy, amylázy aj.), aktivace tvorby stresových proteinů a dalších antistresových metabolitů. Praktické využití účinků etylénu: řízení rychlosti dozrávání ovoce (odstraňováním etylénu zrání zpomalujeme, přidáváním etylénu zrání urychlujeme), k tvorbě kratších a pevnějších stébel u obilovin postřik kyselinou 2-chlor-etylfosfonovou ("Ethrel"), ze které se rozkladem uvolňuje etylén, inhibitory syntézy etylénu (např. ionty stříbra, Ag+) se používají k prodloužení životnosti řezaných květin. Typy pigmentů (barviv) zapojených do přenosu informačních účinků záření (fotoreceptory) Receptory červeného záření fytochromy Receptory modrého záření flavoproteiny (kryptochrom, fototropin) - řídí fototropické reakce, a také morfogenetické procesy (ve spolupráci s fytochromy). karotenoidy, zejména zeaxanthin (podílí se na aktivaci ATPáz), zeaxanthin: flavin FYTOCHROMY modrozelené pigmenty volně pohyblivé v cytosolu, tvořené bílkovinou s kovalentně navázaným tetrapyrolovým řetězcem, který vratnou izomerační změnou (vyvolanou absorpcí červeného záření) ovlivňuje strukturu a funkci proteinového nosiče. Jednotlivé typy fytochromů (A, B,....F) se liší jen v proteinovém nosiči. Všechny typy fytochromů mají 2 vratné formy: Pr (Phytochrome - red)- max. absorpce při 660 nm (jen tato forma je rostlinami syntetizována, není ale fyziologicky účinná), Pfr (Phytochrome ­ far red)- max. absorpce při 730 nm (tvoří se z formy Pr po absorpci světle červeného světla): je fyziologicky účinná (aktivuje enzymy fosforylací či přenosem Ca), je nestálá - vrací se na formu Pr absorpcí tmavě červeného světla, (ale i samovolně v průběhu několik hodin!) Hlavní oblasti regulačního působení fytochromů stimulace klíčení semen (ovlivňováním osmotického tlaku a tvorby aktivních forem fytohormonů, zejména giberelinů), řízení metabolických procesů (ovlivňováním aktivity asi 60 různých enzymů), řízení morfogenetických procesů, např.: - tvorba chloroplastů, - velikost listů a stonků, - počet listů, odnoží, větví, - zakládání květních orgánů (v posledních dvou případech jde o procesy závislé na délce dne -fotoperiodě, u nichž je fotoreceptorem taky fytochrom!). Morfogenetické účinky nízkých teplot * vernalizace (= indukce kvetení nízkou teplotou), - semenáčky a nabotnalá semena jednoletých rostlin, - dvouleté rostliny po prvním roce. * zrušení dormance semen, * zrušení dormance pupenů, * správný vývoj hlíz a cibulí Indukční teplota je nejčastěji v rozmezí 0 ­ 10 °C, doba působení několik (3 - 8) týdnů. STRESOVÁ FYZIOLOGIE ROSTLIN Působení ultrafialového záření na rostliny * poškození proteinů (fotooxidace thyrosinu a tryptofanu, štěpení disulfidických můstků, rozpad terciární struktury), * poškození nukleových kyselin (zejména tvorbou dimerů thyminu ), * poškození fotosyntetického aparátu (zejména reakčního centra ve fotosystému II a plastochinonů). Indukované ochranné mechanismy: * Tvorba specifických enzymů fotolyáz, které opravují poškozené nukleové kyseliny (štěpí vznikající dimery thyminu), * Tvorba sekundárních metabolitů absorbujících UV záření (UV-filtry ­ např. flavonoidy, anthokyany). Působení přízemního ozónu na rostliny * Ozón proniká průduchy do listů, kde ve vlhkých buněčných stěnách se rozkládá za vzniku reaktivních forem kyslíku, * oxidace mastných kyselin v membránách (porušení jejich integrity ­ volná permeace), * oxidace sulfhydrylových skupin proteinů ­ ztráta aktivity enzymů (včetně enzymu Rubisco), * indukce hypersensitivní reakce (autodestrukce buněk), * indukce zvýšené tvorby etylénu, což vede dále jednak k tvorbě ochranných stresových proteinů a polyaminů, ale při delším působení i ke zrychlenému stárnutí a odumírání. Působením chladu (= nízkých teplot nad bodem mrazu) dochází: * k vratnému poškození buněčných membrán (tuhnutím lipidové složky), což vede k jejich volné permeaci ( rozvrat metabolických procesů, energetické vyčerpání). * k oxidačnímu poškození buněčných struktur. Vyšší odolnosti k chladu je dosaženo: * změnami v chemickém složení membrán (zvýšení podílu nenasycených mastných kyselin v lipidech), * tvorbou stresových proteinů a osmotik, * zvýšenou tvorbou antioxidačních substrátů a enzymů. Působením mrazu (= nízkých teplot pod bodem tuhnutí vody) může dojít: * k mechanickému poškození buněk (protržením buněčné stěny a plazmatické membrány krystaly ledu), * k silné dehydrataci cytosolu (vymrazením vody). Zvýšené odolnosti k mrazu může být dosaženo: * uchováním vody v tekutém (podchlazeném) stavu, * zvýšením pevnosti buněčných stěn (tvorbou extensinu), * tvorbou kompatibilních osmotik a stresových proteinů, * řízenou dehydratací (zmenšením vakuol), * omezením růstu velkých krystalů v apoplastu specifickými proteiny a tvorbou amorfní (sklovité) formy ledu. Působením vysokých teplot dochází v buňkách: * k vratnému poškození buněčných membrán (přílišnou tekutostí lipidové složky), což vede k jejich volné permeaci (zvláště u chloroplastů energetické vyčerpání). * k denaturaci proteinů a zastavení proteosyntézy, * k rozpadu cytoskeletárních struktur. K vážnějším změnám dochází při teplotách nad 40 °C, k letálnímu poškození nejčastěji při 50 až 60 °C. Zvýšené odolnosti k vysokým teplotám je dosaženo: * tvorbou stresových proteinů (,,heat shock proteins", HSP), (zvýšená teplota aktivuje transkripční faktory jejich genů), * změnou chemického složení membrán (menší podíl nenasycených mastných kyselin). Nedostatek vody v rostlinách způsobuje: * zpomalení až zastavení dlouživého růstu buněk (poklesem turgoru, nejcitlivější reakce), * zpomalení až zastavení fixace CO2 (uzavřením průduchů), * strukturní a funkční změny proteinů a membrán (změnami hydratace), * poškození plazmalemy (odtržením od buněčné stěny). Hlavní fyziologická přizpůsobení k nedostatku vody: * úsporné hospodaření s vodou (rychlý příjem, pomalý výdej, metabolické cesty C4 a CAM, tvorba zásob, atd.), * zachování funkčnosti buněk i při větším poklesu hodnot vodního potenciálu (tvorbou osmotik a stres. proteinů), * schopnost snášet bez poškození téměř úplnou dehydrataci buněk (v dormantním stavu - poikilohydrické rostliny). Poškození rostlin nedostatkem kyslíku v půdě * energetické vyčerpání (zastavením mitochondriálních respiračních procesů), * tvorba toxického etanolu (náhradní fermentační cestou), * acidifikace cytoplazmy (fermentační tvorbou kys. mléčné), * tvorba reaktivních forem kyslíku, * tvorba toxických redukovaných látek v okolí kořenů (Fe2+, Mn2+, sirovodík), * fytohormonální změny (náhlé zvýšení tvorby kyseliny abscisové a etylénu vede k vadnutí a žloutnutí listů). Hlavní adaptační mechanismy k nedostatku kyslíku v půdě * rychlý transport kyslíku z nadzemních orgánů do kořenů velmi rozsáhlým systémem intercelulár, * oxidace toxických látek v půdě vylučováním kyslíku z kořenů do rhizosféry, * vylučováni etanolu z kořenů, * metabolické adaptace (dokonalejší řízení rychlosti glykolýzy, snížení tvorby kyseliny mléčné a etanolu zpracováním pyruvátu na méně toxické produkty.